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Heatmap: Cluster_87 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.2 0.05 -0.09 0.01 0.2 0.29 -0.2 -0.31 -0.48 -0.53 -0.37 -0.22 -0.0 -1.02 -0.48 -0.82 -0.45 0.1 -0.31 0.11 -3.48 1.65 0.08 0.07 0.78 0.32
-0.23 0.36 0.7 1.27 0.91 -0.75 -1.24 -1.13 -0.97 -0.37 -0.03 0.19 -0.53 -0.9 -1.88 -0.92 -1.63 -0.89 -1.23 -0.53 -2.16 2.21 0.33 -0.06 -0.21 0.17
-0.32 0.06 0.13 0.26 0.41 0.45 0.45 0.37 0.23 0.04 -0.15 -0.31 -0.19 -0.36 -0.15 -0.38 -0.14 0.47 0.02 -0.1 -4.11 1.42 -1.21 -1.19 -0.41 -0.51
-1.36 -1.31 -1.13 -0.26 0.11 0.16 0.17 -0.01 -0.2 -0.38 -0.27 -0.76 -0.92 -1.25 -0.51 -1.21 -1.86 -0.45 -0.53 -1.57 0.25 2.58 1.42 -0.07 -0.11 -0.54
-0.43 -0.16 0.31 0.93 0.79 0.12 -0.06 0.07 -0.3 -0.24 -0.19 -0.16 -0.5 -0.78 -1.18 -1.05 -1.19 -0.82 -1.34 -0.57 0.18 1.5 -0.18 -0.32 0.74 0.43
-4.25 -2.3 -1.67 -0.82 0.18 0.49 0.51 0.14 0.39 0.26 -0.08 -0.73 -5.01 -0.27 -0.34 -0.48 -0.35 -0.09 -0.38 -0.38 -2.19 2.2 0.99 0.12 0.25 0.03
-3.27 -2.28 -2.31 -0.68 -0.39 0.72 1.51 0.47 1.0 0.38 0.3 -0.99 -4.71 -0.16 -0.82 0.05 -2.93 -0.91 -1.47 -1.82 -3.15 2.22 1.32 -1.37 -0.17 -0.34
-0.04 -0.22 -0.48 0.45 0.25 -0.22 -0.25 -0.3 -0.81 -0.94 -0.67 -0.71 -0.18 -0.34 -0.6 -0.14 -1.3 -0.46 -1.39 -1.6 -0.28 2.33 0.01 -0.16 0.9 0.44
0.47 -0.0 0.26 0.74 0.66 0.24 0.18 0.31 -0.49 -0.54 -0.25 -0.33 0.44 -0.34 -0.31 -0.37 -1.58 -1.18 -1.28 -1.79 -0.69 1.71 -0.48 -0.9 0.49 -0.29
0.07 -0.57 -1.21 0.68 0.43 -0.35 -0.22 -0.11 -0.54 -0.93 -0.25 -0.81 -0.23 -1.26 -1.37 -0.71 -1.84 -1.12 -1.3 -2.58 -0.09 2.7 0.04 -0.55 0.76 0.38
0.42 -0.49 -0.43 0.54 0.17 -0.5 -0.24 0.09 -0.82 -0.62 -0.45 -0.47 -0.01 -0.57 -0.57 -0.59 -1.27 -0.91 -1.33 -1.41 -0.58 2.17 0.35 -0.04 0.85 0.46
-0.11 0.13 0.08 0.63 0.58 -0.6 -1.07 -1.18 -1.79 -1.61 -1.46 -1.5 -0.2 0.26 -0.25 0.33 -0.47 -0.65 -0.39 -1.31 0.44 2.27 -0.09 -0.25 0.25 0.18
0.41 0.02 0.17 1.49 1.49 -0.16 -0.71 -0.54 -1.17 -0.71 -0.6 -0.95 0.44 -0.74 -1.36 -1.43 -1.47 -1.3 -1.45 -2.03 0.35 1.86 -0.03 -1.29 0.08 0.05
0.03 -0.31 -0.33 0.34 0.26 -0.21 -0.0 0.02 -0.31 -0.05 0.32 0.3 0.13 0.15 -0.98 -0.75 -0.89 -0.86 -1.26 -1.24 -0.34 1.47 0.2 -0.48 0.81 0.47
-0.61 0.1 0.28 0.62 0.65 0.28 -0.05 -0.3 -0.42 -0.21 -0.08 -0.54 -0.72 -0.58 -1.82 -0.6 -1.71 -1.17 -1.64 -1.31 -1.21 1.98 0.99 -0.23 0.59 0.36
0.26 0.29 0.26 0.67 0.44 -0.73 -1.45 -0.94 -0.8 -0.35 0.26 0.55 -0.19 -0.99 -1.26 -0.98 -0.53 -0.13 -0.47 -0.17 -1.91 1.39 -0.25 1.07 0.18 0.52
0.08 -0.52 -0.65 0.17 0.34 0.09 -0.14 -0.23 -0.5 -0.57 -0.44 -0.41 0.27 0.02 -0.37 -0.09 -0.58 -0.37 -0.7 -1.31 -1.77 2.31 -0.39 0.08 0.21 -0.19
0.34 0.01 0.12 1.89 1.0 -0.17 -0.59 -0.73 -0.64 -0.02 -0.71 0.17 -0.07 -2.84 -2.5 -1.23 -0.53 -0.53 -1.46 -0.22 -1.43 1.53 -2.91 -2.35 0.69 0.93
-4.21 -3.26 -2.7 -0.79 -0.31 -0.03 0.52 -0.24 0.23 0.05 0.31 -0.48 -3.05 -1.32 -1.75 -0.82 0.02 -1.21 -1.81 -1.74 -0.85 2.72 0.54 1.11 0.68 0.15
-0.11 -0.52 -0.4 0.21 0.86 1.14 0.09 -0.1 -0.37 -0.45 -0.35 -0.38 -0.21 0.46 -0.04 -0.2 -0.69 -0.38 -0.62 -0.98 -2.04 1.86 -0.41 -0.84 -0.32 -0.39
0.16 -0.15 -0.2 0.0 0.24 0.52 0.29 0.3 0.32 0.32 0.12 0.11 0.35 -0.3 0.06 -0.31 -0.25 0.08 0.21 -0.38 -2.55 0.74 -0.66 -0.89 -0.46 -0.2
-1.36 -1.82 -1.83 -0.51 0.83 0.93 0.87 0.49 0.48 0.18 0.05 -0.16 -0.89 -1.01 -1.23 -0.83 -1.86 -0.82 -1.43 -1.82 -1.25 2.5 0.71 -1.45 -0.25 -0.93
-1.02 0.3 -0.01 1.13 0.27 -1.0 -1.11 -0.91 -0.09 0.24 0.63 0.7 -1.31 -0.48 -1.38 -0.28 -1.3 -0.82 -1.35 -1.02 -0.98 1.68 0.34 0.78 0.13 0.18
-3.74 -3.78 -1.36 0.91 1.1 1.0 -0.25 -0.42 -0.07 -0.18 0.29 0.0 -2.33 -1.19 -2.85 -1.01 -3.78 -1.46 -2.09 -0.41 -1.32 2.29 0.58 0.81 0.52 0.17
-1.09 -1.13 -0.98 -0.23 0.02 -0.52 -0.25 -0.08 0.11 0.03 0.13 -0.19 -0.88 0.26 -0.16 0.24 -0.28 -0.2 -0.46 -0.7 -0.4 1.93 0.77 -0.15 0.15 0.01
-0.93 -0.05 0.33 0.83 1.14 0.81 0.32 0.04 -0.42 -0.51 -0.55 -0.43 -0.79 -1.41 -1.95 -1.84 -1.57 -0.73 -1.49 -0.94 -0.71 2.02 0.26 -0.8 0.35 0.4
-0.94 -0.01 0.47 0.88 1.01 0.56 0.3 0.04 -0.43 -0.6 -0.65 -0.66 -1.01 -0.98 -1.48 -1.35 -1.02 -0.57 -1.07 -0.56 -0.6 2.04 0.05 -0.93 0.26 0.32
-6.9 -6.05 -5.42 -3.84 -1.65 0.32 0.83 0.47 0.7 0.77 0.97 0.52 -5.63 -0.97 -1.42 -1.48 -0.96 -0.49 -1.56 -1.14 -2.07 2.3 0.47 0.37 1.0 0.4
-0.57 -1.26 -1.07 0.1 0.22 -0.34 0.21 0.39 -0.32 -0.09 0.22 -0.2 -0.01 0.09 -1.16 -0.04 -1.14 -0.47 -1.35 -1.51 -0.23 1.88 0.39 -0.44 0.83 0.49
0.16 0.59 0.25 0.21 0.13 -0.01 0.32 0.13 -0.74 -0.5 -0.58 -0.55 0.54 -1.28 -1.9 -1.47 -1.24 -0.84 -0.61 -0.08 -1.15 1.8 0.12 0.04 0.51 0.49
-0.24 0.29 0.16 0.62 0.61 0.52 0.34 0.31 0.41 0.05 0.27 -0.36 -0.74 -1.38 -0.59 -1.16 -0.49 -0.03 0.09 -0.58 -5.08 1.55 -0.99 -1.59 0.49 -0.46
-0.7 0.17 0.26 0.44 0.63 0.37 0.45 0.3 0.15 0.53 0.11 -0.1 -0.65 -1.73 -0.41 -2.27 -0.06 -0.01 0.05 0.32 -3.35 1.29 -2.5 -1.17 0.1 0.42
-2.39 -1.29 -0.72 -0.05 0.09 0.43 0.24 -0.03 0.2 -0.09 -0.17 -0.58 -2.88 -1.46 -1.47 -0.45 -2.66 -1.88 -1.64 -1.38 -0.12 2.78 0.97 -0.66 0.4 0.26
-0.04 -0.21 -0.0 0.25 0.54 0.45 0.36 0.26 0.23 0.26 0.26 0.1 -0.19 -0.59 -0.44 -0.61 -0.54 0.16 0.18 -0.07 -1.33 1.07 -1.34 -0.75 -0.47 -0.02
0.28 0.32 0.33 0.45 0.67 0.52 0.2 -0.03 -0.54 -0.38 -0.27 -0.05 0.72 0.07 -0.39 -0.05 0.21 -0.41 -0.79 -0.62 -2.64 0.75 -1.09 -1.02 0.27 -0.11
-3.52 -0.5 0.37 0.14 0.61 0.1 0.31 0.15 -0.02 -0.16 -0.2 -0.27 -3.47 -0.02 -0.44 -0.15 -0.35 -0.61 -0.67 -0.14 -3.27 1.87 0.2 -0.31 0.24 0.74
-2.54 -0.18 0.3 1.45 1.08 0.33 -0.88 -0.65 -1.95 -2.36 -1.8 -2.69 - 0.62 -1.02 0.35 -0.79 -1.48 -1.07 -1.5 -3.12 2.55 -0.28 -1.78 0.76 0.73
-2.57 -0.58 0.08 0.22 0.69 0.97 0.66 -0.07 -0.16 -0.53 -0.66 -0.56 -2.19 -0.87 -0.88 -0.48 -0.36 -0.24 -0.36 0.07 -1.65 2.09 0.2 -0.21 0.05 -0.24
-4.13 - -3.24 -1.15 -0.71 0.08 -0.01 -0.17 0.18 0.36 0.33 0.25 -4.02 -0.13 -1.12 -0.37 -1.1 -0.25 -0.3 -1.01 -1.04 2.44 1.18 0.08 0.49 0.58
0.29 -0.1 -0.02 0.01 -0.19 -0.61 -0.19 -0.21 -0.14 -0.23 -0.14 -0.36 -0.4 0.09 -0.19 0.16 -0.06 -0.09 -0.02 -0.49 -2.24 1.34 0.27 0.68 0.25 -0.03
-0.83 1.2 1.17 1.71 1.11 -1.44 -2.52 -1.96 -3.01 -2.73 -2.79 -2.55 -1.14 0.2 0.18 0.7 0.19 -0.4 -0.57 -1.09 -2.24 2.07 -2.21 -1.98 0.06 -0.43
-3.5 -4.93 -2.01 -1.04 0.1 1.19 0.87 0.17 0.32 0.07 0.15 -0.07 -1.93 -0.12 -0.93 -0.45 -0.76 -0.77 -0.62 -0.48 -1.39 2.11 0.14 0.61 -0.24 0.38
0.2 -0.27 -0.15 -0.06 -0.28 -0.41 -0.19 0.24 -0.18 -0.18 -0.22 -0.6 -0.02 -0.68 -0.07 -0.41 -0.92 0.02 -0.21 -0.32 -2.87 1.68 0.59 0.19 0.61 0.27
0.74 0.59 0.66 1.99 1.31 0.24 -0.55 -0.19 -0.61 -0.69 -0.57 -1.09 0.42 -1.67 -2.68 -2.06 -2.96 -1.65 -1.56 -1.72 -0.53 1.53 -0.5 -1.6 -0.16 -0.04
0.68 0.47 0.61 1.33 1.32 1.06 0.54 0.16 -1.57 -1.56 -1.78 -0.96 0.62 -0.07 -1.74 -0.27 -1.64 -1.68 -1.94 -1.98 -2.75 1.46 -1.34 -3.04 0.17 0.04
0.1 0.03 0.14 0.23 0.25 0.37 0.25 0.09 0.11 0.03 0.1 0.18 0.46 -0.33 0.19 -0.27 -0.3 -0.11 -0.32 -0.19 -3.78 1.02 -1.6 -0.75 0.01 0.02
-0.95 -0.84 -0.67 -0.14 0.09 -0.01 0.34 0.38 0.36 0.22 -0.01 -0.4 -1.06 -0.33 -0.17 -0.14 -0.14 0.05 0.02 -0.28 -1.37 1.62 0.31 -0.1 0.18 -0.07
-4.36 -4.5 -2.88 -1.49 -0.48 0.05 0.23 -0.23 0.6 0.17 0.0 -0.83 -4.2 -1.02 -0.69 -0.49 -0.58 -0.75 -1.0 -1.04 -0.75 2.67 1.23 0.52 0.64 0.02
-4.38 -3.94 -2.83 -1.29 -0.42 0.11 0.47 0.01 0.63 0.22 0.27 -0.74 -4.5 -0.88 -1.12 -0.44 -0.39 -0.58 -1.11 -1.06 -0.87 2.48 1.25 0.47 0.59 0.09
-4.91 -4.76 -3.16 -1.45 -0.56 0.35 1.1 0.53 0.96 0.8 0.25 -0.65 - 0.81 -0.69 0.09 -1.99 -1.58 -2.86 -1.26 -0.4 2.05 1.46 -0.96 -0.51 -0.09
-5.25 -3.72 -2.79 -0.6 0.59 0.76 0.72 0.11 0.33 0.2 -0.14 -1.28 -5.95 -0.39 -1.8 -0.69 -2.36 -1.8 -1.63 -2.16 -3.16 3.09 -0.24 -0.75 0.85 -0.26
-2.14 -0.65 -0.13 0.44 0.98 1.05 0.61 0.11 -0.31 -0.79 -1.08 -1.17 -2.41 -0.28 -0.09 -0.3 -0.22 0.34 0.14 -0.21 -1.19 1.93 -0.41 -1.6 -0.32 -0.11
-5.45 -5.11 -1.98 -0.66 0.14 0.45 0.05 -0.39 0.1 -0.06 -0.18 -0.38 -5.13 -0.25 -0.52 -0.3 -0.89 -1.2 -1.47 -1.28 -0.4 2.62 1.03 0.37 0.78 0.02
-4.99 -4.96 -4.06 -2.2 -0.49 0.76 0.96 0.26 0.38 -0.17 -0.56 -1.78 -5.56 -0.69 -1.38 -1.4 -1.26 -1.66 -2.05 -2.17 -0.95 2.8 2.05 -0.43 0.19 -0.3
-0.49 -1.1 -1.06 0.06 0.66 0.48 0.31 0.11 -0.45 -0.29 0.09 -0.11 -0.62 -0.99 -1.54 0.79 -2.46 -1.62 -1.56 -1.75 -1.46 2.2 1.11 -0.89 0.39 0.19
-6.7 -4.06 -1.61 -0.58 0.44 1.0 0.88 0.32 0.45 -0.05 -0.2 -0.61 -5.61 -0.49 -0.52 -0.46 -0.92 -0.97 -1.56 -1.16 -1.04 2.44 0.99 -0.43 0.03 -0.01
-0.18 -0.08 -0.07 0.54 0.28 0.36 0.15 0.13 0.22 -0.24 -0.2 -0.14 -0.17 -0.86 -1.03 -0.34 -0.35 -0.61 -0.55 -0.45 0.1 1.52 -0.03 -0.99 0.5 -0.22
-0.2 -0.29 -0.7 -0.58 -0.24 0.06 -0.17 0.14 -0.36 -0.78 -0.79 -0.79 0.08 -1.16 -1.04 -1.06 -1.62 0.01 -0.46 -1.22 -0.23 2.45 0.99 -0.5 0.75 -0.06
0.16 0.54 0.74 0.53 0.07 -0.85 -0.12 -0.24 -1.13 -0.19 -0.37 -0.33 0.23 -1.33 -1.3 -2.09 -1.63 -0.11 -1.57 -0.24 -4.36 1.77 -1.12 0.11 0.29 1.66
-5.96 -3.31 -1.91 0.45 1.12 0.48 0.3 0.3 0.1 -0.02 -0.3 -0.85 -5.38 -0.95 -0.69 -1.57 -1.61 -1.04 -1.85 -1.12 0.17 2.43 1.27 -0.33 0.05 -0.02
-1.58 -1.62 -1.07 -0.13 0.09 -0.15 -0.1 -0.33 0.02 -0.2 -0.24 -0.54 -1.53 -0.39 -0.67 -0.65 -1.01 -0.67 -1.19 -1.0 -0.01 2.47 1.15 0.35 0.26 0.24
0.81 -0.02 -0.0 -0.12 -0.84 -2.08 -2.23 -2.05 -2.52 -2.25 -1.63 -0.44 1.08 0.23 -0.15 -0.38 -0.79 -1.13 -1.52 -2.05 -0.07 2.73 0.48 0.18 -0.12 0.06
-7.69 -5.01 -3.93 -1.9 -0.17 0.77 0.1 -0.63 -1.22 -2.56 -1.9 -3.19 -5.7 -0.05 1.15 -0.27 -4.04 -1.84 -2.79 -3.07 -1.33 3.08 1.77 -0.07 0.57 0.03
-0.13 -0.83 -0.62 0.85 0.86 -0.56 -0.63 -0.26 -0.8 -0.67 -0.14 -0.22 0.15 0.33 -0.97 -0.55 -1.51 -0.85 -1.28 -2.1 -0.48 2.25 0.24 -0.37 0.68 0.01
-0.77 -0.14 0.23 0.47 0.46 0.44 0.57 0.35 0.2 -0.04 -0.49 -0.59 -1.26 -0.23 0.17 -0.05 0.23 0.35 0.05 0.11 -3.97 1.4 -1.41 -1.3 -0.34 -0.4
-0.51 0.32 0.89 2.11 1.83 -0.7 -1.15 -1.58 -1.94 -1.93 -1.54 -0.56 -0.45 -1.15 -1.66 -1.8 -3.04 -2.46 -2.79 -2.42 -2.91 2.44 -3.31 0.05 0.73 -0.75
-0.37 0.04 0.11 0.4 0.19 -0.61 -0.36 -0.13 -0.77 -0.79 -0.89 -0.78 -0.51 -0.02 -0.63 0.16 -1.41 -0.31 -0.48 -1.09 0.44 2.03 -0.56 -0.14 0.26 0.98
0.38 0.18 0.27 0.83 0.85 0.31 0.06 -0.05 -0.38 -0.56 -0.17 -0.28 0.47 -0.83 -0.97 0.4 -1.12 -0.26 -0.48 -1.09 -1.99 1.15 -0.15 -1.56 0.35 0.16
-1.42 -0.85 -0.62 -0.46 0.13 1.04 0.92 0.17 0.29 -0.0 -0.16 -0.32 -1.8 0.4 -1.07 -0.02 -1.64 -0.9 -0.93 -0.37 -4.56 2.16 0.26 -1.2 0.18 0.16
-0.18 -0.4 -0.24 0.38 0.21 -0.21 -0.05 0.2 -0.28 -0.22 -0.18 -0.27 -0.2 -0.26 -0.31 -0.14 -0.62 -0.09 -0.51 -0.73 -0.45 1.54 0.17 -0.13 0.49 0.36
0.27 -0.32 -0.81 0.24 -0.53 -1.18 -0.81 -0.55 -0.74 -0.48 0.4 0.6 0.31 -0.25 -0.79 -0.67 -0.78 -1.29 -1.03 -1.47 -0.48 2.09 0.73 0.85 0.32 -0.16
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0.42 0.11 -0.19 0.87 1.18 0.72 0.59 0.5 -0.65 -0.79 -0.85 -1.27 0.15 -1.95 -1.91 -1.7 -0.93 -0.16 -0.72 -0.57 -4.72 2.36 -2.3 -1.35 -0.13 -0.8
-3.35 -2.36 -1.67 0.01 0.77 0.66 0.6 0.27 -0.11 -0.87 -1.2 -1.79 -3.2 -1.74 -2.19 -1.54 -2.21 -1.85 -2.24 -2.19 -0.32 3.33 0.51 -1.2 -0.13 -0.53
-0.41 0.17 0.41 0.98 1.05 0.86 0.54 0.47 -0.96 -0.93 -0.9 -1.03 -0.02 0.24 -0.03 0.35 0.24 -0.61 -0.54 -0.96 -3.91 0.66 -1.81 -0.97 0.31 -0.21

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.