1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_123 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 2.43 2.34 - - 3.96 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - -0.08 - - - 1.31 - 1.99 3.63 - 1.76 - -0.48 - - -0.14 0.35 -
- - - - - - - - - - - - - - 3.6 - - 2.11 - 2.53 1.91 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.94 - - - - - 1.75 - 2.97 - 1.7 1.78 - 2.1 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.3 - - - - - - - - 2.2 - - - 1.73 - - 2.51 - - 1.93 1.87 - - - - -
2.77 -0.08 - 1.29 - - - - - - - 1.43 0.73 - - - - 0.59 - - 2.16 - 1.96 - 0.66 -
- - - - - - 1.34 1.02 2.15 1.09 - - - - 1.04 - 1.11 0.99 - 1.76 1.97 - - - 0.46 -
1.27 - - - - 2.09 1.14 1.02 1.18 - - - - - - - 1.36 0.98 - 2.34 1.69 - - - - -
- 0.79 - - - - 1.42 - - - 1.14 - - - 1.12 3.17 3.03 - - - - - - - - -
- - 0.78 - 0.25 0.8 - 0.44 - - - - - - 0.46 - 2.78 1.81 - 0.17 0.58 - 2.49 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.96 - 3.38 - - - - -
0.7 -0.71 -0.29 - - -0.38 -0.28 -0.4 -0.3 -0.4 0.68 -0.18 -0.39 - 1.55 - 1.92 1.46 -0.64 -0.37 -0.27 - - -0.39 1.07 0.29
- - - - - 2.34 - - - - 3.34 - - - - 2.31 2.56 - - - - - - - - -
- - - -0.97 -1.02 -0.91 0.53 1.0 -0.93 1.0 -0.99 0.19 - 1.52 -0.09 -0.78 0.87 -1.67 0.61 1.62 1.12 - 1.32 - -0.6 -1.42
- - - - - - - - - 1.14 - - - - 3.61 1.33 1.39 - - - 2.25 - 0.81 - - -
- - - - 1.99 - - - - - 2.29 - - - - - 4.1 - - - - - - - - -
- - - - - - 3.81 - - - - - - - - - 3.59 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.19 0.78 - 1.93 0.63 0.26 1.23 2.35 0.26 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 0.91 - - - - - - - - - 0.8 - - - 1.81 3.29 0.58 2.61 - 0.58 - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.74 - - - - 3.66 - - - - - -
0.97 1.63 0.84 - 1.32 0.63 - - - 0.59 2.13 0.84 - - -0.52 - 1.75 -1.08 - - -0.3 - -1.59 - -2.29 0.61
- - 0.1 - - - 1.12 0.83 -0.0 -0.18 - -0.02 - - 1.62 1.55 - - -0.2 - 2.3 -0.38 0.79 - 1.67 -0.63
- - - - - - - - - - - - - 3.63 - - - - - - 3.77 - - - - -
-2.82 -2.01 -0.54 0.21 -0.4 1.69 0.08 - -0.87 - -2.03 - -2.06 0.74 1.54 0.45 1.66 1.19 1.39 1.27 -3.4 -1.72 -3.33 -3.06 - -0.64
-0.48 - -1.17 -1.1 - 0.47 - 0.71 -1.05 -1.22 - - 0.66 -1.34 - 1.45 3.63 - - 1.1 -1.62 - - - -1.79 -0.75
- - - - - 2.09 0.42 - - 0.29 - - - - 1.16 - 2.22 2.02 - 0.32 1.43 - - - 2.1 -
- - - 2.0 - - - 1.26 1.03 - 1.98 - - - 2.79 - - - - - 2.43 - 0.38 - - -
- - - - 0.36 0.9 - 2.13 - - - - - 3.13 0.4 - 0.88 - - - 1.8 - - - 1.01 0.15
- - -0.99 - 1.21 1.39 1.92 -0.78 - 1.41 - 0.12 - - -1.24 -1.01 2.73 0.64 - 1.15 - 0.2 - - - -
- - - - - - - - -0.71 - - - - 2.01 2.12 1.61 2.61 1.73 0.14 1.05 -1.14 - - - - -0.12
0.82 -0.76 -0.22 0.85 0.67 0.64 -1.33 1.09 - - -1.38 -0.23 - 0.52 -0.43 0.33 2.8 0.34 -1.69 -0.72 - -0.66 - -0.74 -1.96 -
0.15 -1.53 -0.69 -2.41 -2.07 -0.52 -0.02 -0.95 -0.49 0.3 -0.46 -0.63 -0.87 0.85 0.84 1.57 0.31 0.93 1.19 0.48 -1.89 0.09 -3.31 -1.17 0.06 0.16
- - - - - - -0.7 - - - - - - 1.46 1.56 2.16 1.31 1.91 1.16 1.72 -0.29 0.29 0.02 - - -1.4
- - - - - - - - - - - - - 2.8 2.62 1.87 1.04 0.39 1.55 1.55 - - - - - -
- -0.72 - - - - - - - - - - - - - - 4.39 2.12 - - - - - - - -
- - - - - 2.76 - - - - - - - - 2.67 - 2.98 - - - 2.31 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.58 - 1.03 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
-0.3 -0.41 - 2.65 - - - - - - -0.03 - 1.42 - 1.34 - - 1.85 - - 2.25 - 1.22 - 0.36 -
- - - - - - - - - 1.86 - - - - 3.24 - 2.1 - - - - - 3.11 - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.73 1.89 0.94 -0.79 1.07 1.48 2.98 - -1.42 - - - -
1.26 - - - 0.58 - - 1.48 - -0.21 - -0.03 - -0.71 1.27 - 2.05 1.53 2.73 - - -0.38 - - - -
- - - - - - - - - - - - 1.71 - - - 4.51 - - - - - - - - -
-1.87 1.22 0.74 -2.72 -0.07 -1.09 -0.01 -2.59 - -0.68 -1.28 - - 0.91 2.29 1.95 0.71 -0.09 0.73 1.43 - -3.2 - -2.38 -3.48 -
- - - - - 2.39 - - - - - - - - - - 3.54 1.09 1.23 0.92 - 1.25 - - - -1.66
- - - - - - - - - - - - - - - 2.39 3.18 2.94 1.01 0.99 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.75 - - - - - - - - - - - 4.6 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.26 0.54 2.21 -0.28 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.04 - - 2.94 - - 3.34 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.48 - 2.89 - 2.89 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.26 -0.66 -1.58 -0.47 -1.02 -3.04 -0.75 -3.26 -1.01 -3.32 - - 1.85 2.32 1.54 0.8 -0.33 1.66 1.36 -1.63 -0.59 - - -0.28 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.48 - - - - - - - - 1.4 1.5 - - - - - 2.94 - 2.98 1.11 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.89 - - 1.28 - - - - - - - - - 2.61 - 1.09 1.43 1.05 0.84 1.82 1.76 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - -
0.62 - -2.13 - - - - -1.17 - -1.24 -2.2 -1.03 -2.23 2.25 2.51 1.24 1.68 0.3 0.61 1.8 -2.06 - - - - -
- - 1.57 1.36 0.53 - 1.79 - - 2.1 - - - -0.25 0.25 - 2.38 - 0.27 1.02 - - - - -0.28 -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.9 - 3.47 - - - - - - -
- 2.9 - - - - - - - 2.65 - - - - - - 2.97 - - - - - - - 2.15 -
- - 1.11 - 0.81 1.36 - - - - - - - 1.46 1.02 1.09 2.93 - - - - - 2.32 - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.23 - - 4.05 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.57 0.97 1.37 3.04 1.68 1.15 - - 1.43 1.08 - - -
-0.67 -0.62 - - - - - - - -1.61 - - - -0.11 2.69 1.45 0.45 1.29 0.74 1.24 - 0.84 - 2.15 -2.19 -
-3.38 -3.5 - - -0.21 - - -2.19 -3.09 -0.57 -0.76 0.34 0.14 -0.81 2.63 0.53 -0.54 -3.67 -0.7 -0.34 2.23 1.37 -1.59 -0.97 0.81 -0.45
- -1.55 0.53 -1.72 - - - - -0.2 -0.9 1.16 -1.69 - 2.58 1.43 2.0 -1.56 0.23 0.75 0.94 -1.78 -0.61 -2.46 -1.9 -0.43 -
0.47 0.62 0.71 - - 0.73 - - - 0.39 - - - 0.83 0.23 - 2.45 - 1.63 - - 1.82 - 1.78 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.09 - 0.92 - - - - - - - - - 0.68 2.63 1.91 0.81 - - - 1.64 - 1.46 0.74 0.17 -
- 3.54 - - - - - - - - - - - - 3.15 - - - - - 2.46 - - - - -
0.72 -0.15 0.94 1.29 1.21 - - -0.84 - 0.23 - - 1.81 - - - - -0.47 - -0.05 1.92 0.51 0.76 -0.83 0.61 -0.23
- - - - - - 1.58 - - 1.01 - - 1.52 2.74 2.87 - - - 1.05 1.04 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.16 -0.77 -0.78 - - 0.47 - -0.8 -0.89 - - -0.92 - 2.1 2.54 -1.03 1.16 0.11 1.62 1.04 0.13 - - -1.11 -1.63 -
- - - - - - - - 3.6 - - - - - - - 3.79 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.46 3.19 - 3.44 - - - 1.7 - - - - -
- - - - - - - - - 3.52 - - - - - - 3.86 - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.