1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_101 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- 1.11 1.53 -0.1 - 0.19 0.39 - - - -0.05 - - 1.92 - - -0.09 1.24 1.66 - 1.09 1.27 0.87 - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.03 - - - 2.09 - - - 2.43 - - - -
- - - - - - - - - - - - 2.43 2.34 - - 3.96 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - -0.08 - - - 1.31 - 1.99 3.63 - 1.76 - -0.48 - - -0.14 0.35 -
1.11 - - - - 2.03 1.18 1.1 0.02 1.49 1.5 - - 2.44 - 0.96 - -0.57 - - - - - - - -0.6
0.8 -0.27 -0.38 -0.73 -1.08 -0.78 -0.02 0.03 0.28 0.62 0.56 0.64 0.75 -0.57 1.36 -1.88 0.37 0.71 0.27 0.7 -5.11 -4.53 -4.47 -2.88 -0.11 0.11
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.77 -0.08 - 1.29 - - - - - - - 1.43 0.73 - - - - 0.59 - - 2.16 - 1.96 - 0.66 -
- - 2.66 - - 2.91 - - - - - - - 3.01 - - - - - - - - - - 2.05 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.96 - 3.38 - - - - -
- - 0.51 - -0.81 -0.13 - -1.73 -0.02 -1.73 0.66 - - -1.78 -0.23 -0.02 0.42 1.08 1.92 0.45 -0.56 1.05 0.01 -0.01 0.76 1.46
0.7 -0.71 -0.29 - - -0.38 -0.28 -0.4 -0.3 -0.4 0.68 -0.18 -0.39 - 1.55 - 1.92 1.46 -0.64 -0.37 -0.27 - - -0.39 1.07 0.29
- - - - - - - - 2.78 - - - - 3.0 - 2.55 - - - - - 2.4 - - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.96 - 2.28 - 1.49 1.75 - 0.49 - 0.8 - - 2.03
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - 0.91 - - - - - - - - - 0.8 - - - 1.81 3.29 0.58 2.61 - 0.58 - - -
- -1.41 - -0.91 -1.29 - - - - 0.9 - 0.7 - - - - -0.79 1.45 2.2 - - -1.24 1.88 0.3 1.2 2.5
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.09 0.42 - - 0.29 - - - - 1.16 - 2.22 2.02 - 0.32 1.43 - - - 2.1 -
-2.37 -0.46 -0.7 -1.34 -2.46 -0.03 - -0.44 -1.3 - -0.07 1.2 -1.93 - -1.53 - -2.13 1.49 0.59 -0.52 1.99 1.44 -0.2 -0.88 1.95 -0.51
- - - - - - - - - - - - - - - - - 2.75 - - 3.06 - - - 3.45 -
- - - - 1.76 - - - - - - - - 3.58 - - 1.29 - 1.99 - - 0.66 1.4 - - -
- - 1.3 - - 1.32 - 1.52 - - - - - 3.65 - - - 1.88 0.95 - - - - - - -
-0.3 -0.41 - 2.65 - - - - - - -0.03 - 1.42 - 1.34 - - 1.85 - - 2.25 - 1.22 - 0.36 -
-0.64 0.56 - - -0.73 - -0.43 1.73 1.43 1.3 0.88 - 1.42 2.07 - -0.49 0.58 - 1.36 -0.72 - - - - - -
1.51 -1.96 -1.54 - -0.49 0.25 0.19 0.73 -2.64 -0.27 -0.57 -1.66 1.27 0.21 -0.1 1.02 0.45 0.96 1.51 -0.53 -2.45 -0.91 -0.66 - -0.53 -1.11
1.26 - - - 0.58 - - 1.48 - -0.21 - -0.03 - -0.71 1.27 - 2.05 1.53 2.73 - - -0.38 - - - -
- - 2.63 - - - - -0.05 - - - 2.04 - - - 3.14 - - 2.56 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 2.16 - 2.64 - - 2.03 3.49 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 2.39 3.18 2.94 1.01 0.99 - - - - - -
-0.61 - - - -2.19 -1.88 -1.68 - - - -1.96 - - 4.09 -1.98 - -1.92 -0.44 -0.66 - - -0.56 0.26 0.01 -2.5 1.21
- - - - - - - - - 2.17 - 2.34 - 2.6 - - - 1.71 - - - 2.0 - - 1.64 -
- 1.92 1.76 0.05 - - - - - 1.01 1.02 1.19 - 0.44 - - - -0.45 - 0.01 - 1.8 - - 1.77 0.55
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.48 - 2.89 - 2.89 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.13 - - - 1.13 - 1.09 - - - 0.97 1.31 - 0.79 - - 1.24 0.87 2.14 1.19 - - - 0.26 0.3
-1.07 - -1.21 - -1.02 -0.96 - - 0.47 -0.33 0.35 - -1.32 -0.09 - 0.77 2.71 1.91 2.03 1.65 - - - - - -
1.48 - - - - - - - - 1.4 1.5 - - - - - 2.94 - 2.98 1.11 - - - - - -
- - - - - - - - - - 1.43 - - - - - 2.69 1.92 1.45 2.73 - - - - - 1.89
- - - - - - - - - - - - - 3.71 - - - 2.62 - - - - - - 2.75 -
- - - - - - - - - - - 3.57 - 3.82 - - - - - - - - - - - -
-2.14 -0.29 -2.07 0.8 -0.09 -0.83 1.3 -0.91 -2.06 -3.16 0.04 -2.98 -0.76 - -2.24 -2.93 -0.3 1.81 0.61 -1.45 1.79 -0.4 -0.7 -0.89 1.39 0.86
- - - 2.13 - - - - - - - - - 3.4 - 2.19 - - 1.98 - - - - - 1.37 -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
3.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.81 - - - - - - -
- - 3.52 - - - - - - - - - - 3.86 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.9 - 3.47 - - - - - - -
- - 2.96 - - - - - - - - 3.05 - 3.31 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.57 0.97 1.37 3.04 1.68 1.15 - - 1.43 1.08 - - -
-0.47 0.08 - 0.85 0.03 - 1.08 0.72 1.47 0.72 1.39 -0.07 - 1.18 -0.42 1.4 - -0.91 - -0.49 - 1.12 - - -0.84 -
0.47 0.62 0.71 - - 0.73 - - - 0.39 - - - 0.83 0.23 - 2.45 - 1.63 - - 1.82 - 1.78 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.59 - 2.64 - - - 1.03 - 0.97 - - 1.45 2.36 - - - 1.26 2.0 - - - - - - -
0.72 -0.15 0.94 1.29 1.21 - - -0.84 - 0.23 - - 1.81 - - - - -0.47 - -0.05 1.92 0.51 0.76 -0.83 0.61 -0.23
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.08 - - - 1.08 - - - 0.75 - 0.94 1.23 2.18 - - 0.81 - 2.37 - - - - - 1.16 -
1.5 -1.73 -2.34 -1.62 -1.11 -0.28 0.27 -0.03 0.08 0.04 -0.07 -0.72 1.47 0.55 0.95 -0.57 0.83 1.01 0.79 0.07 -3.4 -5.93 -2.16 -3.46 -0.04 -1.34
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.09 - - - 3.16 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.96 - - - 0.97 0.85 - - - - 1.85 1.79 - 2.52 - - 2.47 - - - - - - -
- 2.42 - - 2.74 - - - - - - - - 3.19 - - - - - - - - - - - 2.27

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.