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Heatmap: Cluster_110 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.08 -0.22 -0.4 -0.06 -0.21 -0.4 -0.16 0.04 0.05 0.22 0.4 0.28 0.13 0.15 -0.08 -0.05 -0.46 -0.17 -0.58 -0.26 -0.46 0.83 0.21 0.05 0.15 0.21
-1.76 -1.07 -0.49 -0.01 0.35 0.53 0.46 0.49 0.61 0.49 0.45 0.37 -1.63 -0.77 -0.93 -0.99 -0.77 0.23 -0.01 -0.33 0.12 0.46 0.19 -0.34 0.39 0.32
0.16 -0.4 -0.58 -0.03 0.33 -0.16 0.27 0.46 0.21 -0.42 -0.02 0.74 -0.46 0.23 -1.21 -0.64 -1.72 -1.01 -1.33 -1.03 -2.58 1.24 0.7 0.04 0.6 0.87
-0.5 -0.51 -0.84 -0.53 -0.23 -0.17 0.54 0.79 0.87 0.77 0.4 -0.07 -0.56 -0.25 -0.91 -1.13 -0.51 0.19 -0.25 -0.0 -0.02 0.76 -0.48 -0.29 -0.01 0.28
-0.04 -0.2 -0.29 -0.07 0.05 -0.15 0.23 0.29 0.36 0.32 0.41 0.33 -0.25 -0.31 -0.62 -0.85 -0.58 -0.03 -0.22 -0.28 -0.18 0.59 -0.35 0.09 0.31 0.35
-0.08 -0.24 -0.02 0.03 0.06 -0.26 0.37 0.58 0.49 0.46 0.67 0.42 0.07 -0.45 -0.94 -0.88 -0.76 -0.25 -0.5 -0.44 -0.27 0.26 -0.28 0.04 0.12 0.17
-0.0 -0.03 0.18 0.41 0.18 -0.41 0.1 0.43 0.44 0.55 0.39 0.33 0.01 -1.0 -1.33 -0.36 -0.44 -0.29 -0.89 0.09 0.06 0.38 -0.3 -0.24 0.04 0.0
-0.99 -1.26 -1.01 -0.46 0.19 0.79 0.83 0.69 0.83 0.84 0.34 -0.06 -0.76 -0.53 -0.66 -1.01 -1.04 0.0 -0.76 0.13 0.36 0.16 -0.09 -0.29 0.26 -0.21
-4.27 -2.9 -1.01 0.29 0.87 0.78 0.47 -0.05 0.75 0.62 0.36 0.04 -3.06 -0.9 -1.09 -1.03 -0.91 -0.23 -0.43 -0.35 0.67 0.92 -0.79 0.68 0.41 0.19
-2.95 -1.02 -0.29 -0.29 0.17 0.12 0.3 0.18 0.76 0.82 1.01 0.92 -1.76 -0.52 -0.72 -0.66 -0.48 -0.22 -0.01 -0.02 -4.48 0.85 -0.47 0.66 -0.25 0.01
-4.99 -1.26 -0.93 -0.55 -0.67 -0.59 0.11 0.88 1.29 1.03 0.58 0.39 -2.87 -1.98 -1.91 -1.81 -1.06 0.93 0.02 0.26 0.85 -0.94 -0.11 0.87 0.2 0.09
0.18 -0.43 -0.17 0.16 -0.03 -0.25 -0.1 0.33 -0.01 0.15 0.4 0.04 -0.19 0.25 -0.42 -0.3 -1.13 -0.84 -1.06 -0.53 0.21 0.72 0.06 0.27 0.27 0.67
-1.22 -0.2 -0.27 -0.1 0.13 0.09 0.37 0.46 0.75 0.54 0.48 0.26 -1.15 -0.07 -0.21 -0.54 -0.33 0.37 -0.23 -0.3 -0.56 0.63 -1.24 0.25 0.04 -0.34
-1.99 -1.05 -0.46 -0.12 0.28 0.56 0.5 0.27 0.84 0.22 0.3 -0.02 -2.09 -0.13 -0.04 0.26 -0.26 0.36 0.04 -0.07 -0.99 0.58 -0.55 -0.07 0.17 -0.06
0.26 -0.3 -0.24 -0.16 -0.32 -0.51 0.12 0.34 0.24 0.46 0.51 0.56 0.42 -0.92 -0.51 -0.7 -0.2 0.6 0.01 0.34 -4.5 0.16 -0.46 0.13 0.2 -0.05
-0.53 -1.88 -1.47 -1.08 -0.44 -0.29 -0.39 0.04 1.21 1.16 0.91 0.78 -0.66 -0.96 -1.81 -0.89 -0.85 0.23 -0.06 0.0 -0.87 1.16 -1.02 -0.17 0.81 0.2
-0.08 -0.29 -1.28 -0.44 -0.28 -0.83 0.47 0.63 1.12 0.88 0.73 0.66 -0.23 -0.66 -1.34 -1.91 -1.73 0.05 -0.59 -1.4 -0.34 0.83 -1.35 -0.11 1.1 -0.06
-1.19 -2.52 -1.62 -0.59 -0.25 0.33 0.38 0.42 1.39 1.28 0.79 0.66 -1.29 -0.8 -2.0 -0.98 -0.18 0.22 -0.37 -0.18 -2.27 0.83 0.26 -0.51 0.4 -0.57
-0.19 -0.42 -0.16 0.24 0.33 0.35 0.61 0.76 0.6 0.73 0.49 0.08 -0.81 -0.32 -0.61 -0.31 -1.22 -0.66 -0.62 -0.66 -0.46 0.29 -0.25 -0.37 0.22 0.0
-2.98 -3.16 -0.93 0.38 0.87 0.78 1.13 0.65 0.51 0.07 0.09 0.02 -2.33 -0.5 -0.9 -0.59 -0.99 -0.35 -0.53 -0.77 1.12 0.39 -1.22 -0.15 0.61 0.09
-0.05 0.14 -0.41 -0.08 -0.19 -0.28 0.0 0.25 0.51 0.33 0.56 0.39 -0.19 -0.15 -0.83 -1.1 -0.82 -0.12 -0.16 -0.98 -0.35 0.59 0.11 0.34 0.36 0.33
-0.76 -1.25 -1.75 -0.49 0.26 0.01 0.37 0.08 0.67 0.88 0.78 0.79 -0.27 -0.0 -0.54 -0.29 -0.85 0.01 -0.44 -0.7 -3.52 0.85 -0.05 0.96 -0.49 -0.3
0.07 0.01 -0.3 -0.03 -0.03 -0.26 0.2 0.46 0.8 0.69 0.75 0.4 0.02 -0.42 -0.63 -1.07 -0.47 -0.03 -0.01 -0.12 -1.75 0.51 -1.49 -0.04 0.02 -0.18
-1.53 -1.48 -1.19 -0.08 0.28 -0.12 0.26 0.49 0.66 0.58 0.61 -0.17 -1.81 -1.33 -1.49 -1.93 -0.57 -0.04 -0.03 -0.82 1.26 0.43 0.66 -0.77 0.92 0.49
-1.71 -1.38 -0.52 0.13 0.53 0.18 0.26 0.52 0.84 0.85 0.89 0.48 -1.38 -1.08 -1.1 -2.25 -0.18 0.39 -0.27 -0.73 0.96 -0.95 0.21 -0.99 0.35 -0.15
-2.37 -1.6 -0.7 -0.6 -0.16 0.41 0.41 0.06 0.93 0.44 0.3 -0.01 -1.57 0.22 0.1 0.31 -0.06 -0.08 -0.02 -0.03 -2.63 1.24 -0.21 0.34 -0.05 -0.3
-0.07 -0.73 -0.22 0.09 0.29 0.19 0.24 0.17 -0.04 0.18 -0.02 0.34 0.01 -0.03 -0.58 -0.04 -0.35 -0.42 -0.2 -0.69 -0.53 0.51 0.1 0.13 0.41 0.3
0.17 -0.09 -0.46 -0.59 -0.38 -0.25 0.16 0.02 0.17 0.51 0.53 0.68 0.15 -0.45 -0.23 -0.46 -0.1 0.3 -0.02 -0.09 -2.94 0.5 -0.32 0.3 -0.07 0.23
-2.52 -1.3 -0.53 0.28 -0.13 -0.04 0.23 0.15 0.29 0.23 0.48 0.02 -2.89 -0.16 -1.18 -0.76 -1.25 -0.67 -0.73 -0.69 1.28 0.69 0.52 0.07 1.19 0.49
-3.59 -3.04 -1.35 0.7 1.61 0.99 0.71 0.54 0.64 0.3 0.34 -0.39 -3.34 0.05 -1.91 -0.09 -3.52 -0.96 -1.36 -1.11 0.03 0.8 0.44 -0.57 0.1 0.22
-3.15 -3.6 -0.85 0.51 1.15 1.09 0.62 0.45 0.22 0.33 0.1 -0.8 -2.99 0.77 -1.36 0.38 -1.81 -0.66 -0.76 -0.71 0.06 0.39 0.17 -0.64 0.63 0.29
-0.43 -0.14 -0.52 -0.49 -0.21 -0.3 0.2 0.13 0.47 0.57 0.41 0.27 -0.44 0.18 -0.19 -0.32 -0.05 0.3 0.1 0.15 -0.31 0.29 -0.7 0.26 -0.4 0.12
0.01 -0.07 -0.17 -0.26 -0.34 -0.47 0.21 0.35 0.47 0.57 0.46 0.42 0.21 -0.7 -0.17 -0.11 -0.19 0.34 0.19 -0.23 -2.59 0.34 -0.14 -0.25 -0.06 -0.11
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
-0.07 -0.64 -0.73 0.01 0.26 0.02 -0.23 0.1 0.55 0.58 1.03 0.37 -0.52 -1.21 -1.21 -0.95 -1.56 0.34 -0.16 -0.4 0.06 0.46 0.62 0.06 0.03 -0.0
-0.01 -0.34 -0.26 0.48 0.57 0.31 0.28 0.68 0.57 0.56 0.58 0.37 -0.14 -1.08 -1.57 -0.98 -1.26 -0.85 -0.93 -0.93 -0.36 0.27 0.38 -0.03 0.24 0.01
-0.18 -0.02 -0.01 0.47 0.39 -0.08 0.45 0.59 0.36 0.42 0.45 0.22 -0.3 -0.57 -0.98 -0.51 -0.64 -0.31 -0.73 -0.3 -0.53 0.25 -0.21 -0.14 0.36 -0.04
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.81 - - - 3.58 -
-0.59 -0.3 -0.19 0.57 0.99 0.37 0.45 0.13 0.1 0.61 0.73 0.51 -0.47 -0.67 -1.53 -0.89 -2.6 -0.58 -1.51 -1.65 -0.37 0.46 -0.28 0.69 0.27 0.28
-1.4 -2.11 -1.44 -0.06 0.15 0.34 0.86 0.86 0.84 0.14 -0.04 -0.03 -1.47 -0.82 -0.86 -0.34 -1.31 -1.05 -0.87 -1.33 0.25 0.86 -0.14 1.07 1.02 0.12
-3.52 -1.3 -0.69 -0.29 0.21 0.74 0.79 0.7 0.82 0.6 0.48 0.43 -2.23 -1.81 -0.65 -1.22 -0.28 0.76 0.38 0.1 1.05 -0.98 -0.21 -0.23 -0.62 -1.12
-0.26 -0.37 -0.09 0.08 0.07 0.08 0.3 0.2 0.25 0.2 0.2 0.27 0.14 -0.07 -0.76 -0.15 -0.39 -0.35 -0.29 -0.45 -0.11 0.52 -0.14 0.01 0.13 0.29
-0.26 -0.11 0.07 0.33 0.44 0.28 0.34 0.34 0.25 0.18 0.24 0.2 -0.14 -0.02 -0.43 -0.48 -0.24 -0.59 -0.21 -0.61 -0.36 0.35 -0.22 -0.61 0.3 -0.0
0.05 -0.59 -1.2 -0.78 -0.65 -0.82 0.01 0.34 0.38 0.54 0.51 0.21 0.13 0.65 -0.28 -0.63 -0.55 -0.37 -0.82 -0.68 0.27 1.22 -0.27 -0.36 0.42 0.29
0.28 -0.45 -0.8 0.38 0.41 -0.14 -0.03 0.12 0.28 0.28 0.77 0.66 0.4 -1.09 -1.58 -1.4 -1.58 -1.13 -1.6 -1.64 0.12 0.63 0.57 0.97 0.14 0.07
0.14 -0.08 -0.24 -0.12 -0.27 -0.32 0.27 0.28 0.38 0.42 0.45 0.47 0.03 -0.45 -0.32 -0.09 -0.5 0.46 0.35 -0.31 -1.79 0.38 -0.86 0.14 0.08 -0.32
0.27 -1.26 -1.77 -0.62 -0.83 -1.36 -1.68 -0.94 0.28 0.86 -0.46 -0.02 -1.4 - -2.69 - -2.33 0.31 -2.1 -3.81 2.5 0.56 0.24 -0.02 1.95 0.51
-3.19 -4.43 -2.93 -3.72 -0.61 1.47 1.82 0.83 1.46 0.93 0.42 -0.26 -2.02 1.05 -2.23 -1.55 -1.15 -2.38 -1.09 -2.83 0.52 -2.24 0.92 0.25 -1.62 -0.21
-2.52 -2.82 -0.53 -0.65 -0.84 -1.23 -0.21 0.03 0.63 0.8 0.91 1.53 -1.92 -1.32 -0.88 -2.35 -0.88 0.43 0.03 -0.29 0.61 -1.23 0.41 0.86 0.92 0.37
-0.15 -0.49 -0.24 0.09 -0.11 -0.28 0.3 0.39 0.11 0.28 0.41 0.1 0.02 0.12 -0.32 -0.44 -0.1 -0.47 -0.71 -0.42 -0.9 1.06 0.39 -0.3 0.03 0.08
0.09 -1.07 -0.78 0.21 -0.14 -1.17 -0.66 -0.59 -0.43 0.31 1.0 0.82 -0.11 -1.37 -1.25 -0.67 -1.81 -0.96 -1.05 -1.26 1.15 0.03 0.78 0.8 0.61 1.02
-2.79 -2.52 -4.77 -3.99 -0.47 -0.31 -0.14 0.08 1.34 1.45 1.03 0.79 -1.63 -1.01 -2.61 -1.4 -1.52 0.69 -0.52 -0.14 -0.17 0.76 0.69 0.23 0.27 0.63
-0.76 -0.48 -0.51 -0.06 -0.22 -0.8 -0.69 0.06 0.58 0.69 1.07 0.76 -0.8 -0.61 -1.68 -1.58 -0.85 -0.67 -0.92 -1.07 0.84 0.46 -0.71 0.7 1.01 0.63
-0.55 -0.56 -0.2 -0.25 0.16 0.09 -0.08 -0.12 0.58 0.89 0.75 0.5 -0.21 -0.2 -0.33 0.13 -0.2 0.3 0.37 -0.24 -1.68 -0.24 -0.07 -0.44 -0.4 -0.06
-0.42 -0.29 -0.22 -0.17 0.19 0.22 0.23 0.24 0.14 0.36 0.32 0.52 -0.35 -0.37 -0.71 -1.02 -0.44 0.18 -0.01 -0.17 0.43 0.07 -0.35 -0.06 0.09 0.43
-0.31 0.01 -0.43 0.05 0.23 -0.0 0.26 0.61 0.99 0.78 0.5 0.08 -0.38 -0.94 -0.56 -1.64 -0.62 0.62 -0.03 -0.39 -0.88 0.67 -1.03 -0.58 0.06 -0.37
-2.19 -2.66 -2.42 -1.86 -0.22 0.43 0.53 0.36 0.31 0.56 0.61 0.34 -1.43 -0.47 -0.04 -1.01 0.14 1.02 -0.51 -0.73 1.15 -1.16 0.72 1.05 -0.51 -0.66
-0.31 -0.39 -0.97 -0.23 0.05 0.11 0.18 0.27 0.38 0.3 0.5 0.47 -0.55 -0.31 -0.68 -0.51 -0.85 -0.02 -0.59 -0.56 -0.47 0.66 0.02 0.87 0.34 0.26

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.