Heatmap: Cluster_77 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - 2.56 - - - - - - 3.29 2.3 2.44 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 1.46 - 3.79 - - - 2.25 - - - - 2.24 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.88 - - - - - 2.69 2.6 2.61 - - - - - - - - - - - - - - -
0.99 1.54 - 1.37 - 2.43 1.5 - - 1.21 - 1.4 1.73 - - - - - - - - 1.04 - - - -
0.74 2.51 - - - - - - 2.39 2.22 - - - 0.88 2.01 - - 1.52 - - - - - - - -
- 3.2 - - - - 0.16 0.04 - 1.04 0.09 0.25 2.84 - - 0.14 - - 1.08 - - - - - - -
- - - - - - - 3.99 - - - - - - - - - 2.12 2.52 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.51 - - - - 2.46 - 2.38 - - 2.37 2.15 - - - - - - - - - - - - -
0.59 2.46 1.96 1.14 -1.11 -4.83 -2.32 -0.5 -1.23 -0.02 0.26 -0.1 0.63 0.09 -1.16 -1.63 -1.28 -2.27 -2.75 -0.65 -3.41 -3.21 -2.48 -2.16 0.65 0.01
0.61 2.09 1.54 0.94 -2.29 -3.1 -2.0 -1.14 -0.46 -0.25 -0.03 0.57 1.13 -0.19 -1.48 -0.9 -3.23 -2.01 -0.86 -2.13 -3.4 -2.2 0.44 -1.15 0.38 0.85
0.44 2.46 1.56 0.62 -1.69 -3.95 -1.47 -0.54 -1.24 -0.45 0.47 -0.01 0.62 0.15 -1.24 -0.44 -1.1 -0.98 -2.2 -1.09 -4.15 -0.05 -0.69 -1.48 -0.17 0.41
0.62 2.35 1.37 0.76 -2.18 - -2.27 -0.88 -1.05 -0.62 0.58 0.15 0.92 0.2 -1.03 -1.29 -2.15 -2.18 -0.98 -1.85 -2.27 0.6 -0.49 -1.57 0.61 -0.15
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.61 2.68 1.19 -2.66 - - 0.44 - -2.75 2.26 -2.73 - 2.42 - - -2.76 -2.77 -0.96 - -3.12 - 1.99 - -2.84 - -
- - 2.92 2.0 - - - - - 2.87 - - - - - - - 2.38 - - 0.98 - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.48 -0.06 - - -0.16 1.81 - 1.0 1.89 - 1.04 -0.17 -0.65 - 0.92 - -0.81 - - 1.77 - 1.06 0.54 0.29 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.41 - - - 1.65 - - - 1.65 - - 1.25 1.84 - - 1.62 -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.74 - - - - - 1.16 - - 2.09 1.5 -0.35 -0.0 -0.09 -0.52 2.26 - 1.32 - - - - - - 1.92 0.64
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
0.66 - - - - - - 1.18 - 2.92 0.89 - 0.86 - 0.88 - - 1.37 - - - - - - 1.91 1.46
- - - - - - - - - 3.49 1.52 - - - 1.46 - - - 1.2 1.18 2.2 - - - - -
2.94 - - - - - - - - 4.2 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.33 1.97 1.59 1.77 0.32 -1.92 -2.22 -1.88 -1.78 -1.07 0.01 0.36 1.07 -1.2 -3.35 -1.13 -3.58 -4.15 -3.59 -3.38 -1.64 0.84 0.02 -0.19 -0.38 0.19
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.96 - - - - 1.33 - - 2.03 2.1 - 1.02 - - - - - - 1.04 - - - - - 1.71
- - - 2.4 2.15 2.46 - 2.47 - 2.4 - - - - - - - - - - - - - - - -
2.58 - - - - - 3.09 - - - - - - - - - - - 2.53 2.51 - - - - - -
- - - - - 2.25 2.44 - - - - 2.34 3.43 - - - - - - - - - - - - -
- - 1.53 1.61 2.4 - - - - 3.73 - - - - - - - - - - 0.59 - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.35 - - 3.29 - - - - - - - 2.59 - - - - - - - -
- 3.78 - - - - - - - - - 3.62 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.61 - - - - - 1.07 1.51 - 2.16 2.15 - - 1.03 - - - - 0.61 - 1.98 - - - -0.06 1.12
1.08 0.35 0.39 1.0 -0.09 -1.06 -0.89 -0.35 -0.38 -0.26 0.46 0.51 0.78 -0.55 -0.42 -0.6 -0.39 -1.1 -0.96 -0.9 -0.65 0.74 -0.4 0.38 -0.5 -0.02
- - - -0.35 - - - - 1.72 3.89 - - - - - 2.0 - -0.45 -0.31 - - - 0.62 - - -
1.72 -2.09 0.33 1.73 0.92 -1.66 0.23 0.8 0.9 2.67 0.63 0.74 -0.28 - -1.76 - - - - - - - - - - -2.18
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.47 - - - - 1.98 2.33 1.35 0.48 - 1.8 - - - 0.85 1.03 1.01 -0.05 - - - - -
- - - - 2.08 - 2.1 2.1 2.02 - - - 1.78 - - - - - 1.54 - - 1.49 - - - -
- - - - - - - - - 4.01 - - - - - - - 3.31 - - - - - - - -
0.47 0.59 - - 0.53 0.35 2.9 1.46 0.46 2.29 0.27 1.45 - - - - - - - - - - - - - -
- 3.08 - - - - - - - - - - 2.73 - - 2.73 - 2.09 - - - - - - - -
- 3.26 1.41 - - 0.2 - - 1.35 1.83 - 1.99 0.69 - - - - - - - - - -0.08 - - -
- 1.58 - 1.52 - - 1.65 - 1.57 - 1.37 3.13 - - - - - - 1.43 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.71 - - - - - 1.58 - - 2.52 1.53 - - - - - - - - - 3.06 - - 1.47 - -
2.64 - - - 2.65 - - - - 2.9 - - - - - - - - 2.59 - - - - - - -
- - 0.87 - 1.59 - - -0.23 -0.13 2.27 -0.32 - 0.18 0.75 -0.5 -0.36 - 0.71 2.03 - -0.22 - - - 0.72 0.33
1.52 - - - - - - 3.27 1.66 - - 1.64 1.43 - - - - - 2.18 - - - - - - -
1.67 0.23 - - - - 0.54 -0.88 - - 0.02 1.19 1.68 1.65 -1.16 0.24 0.88 - 2.06 0.3 -0.31 - - - -1.58 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.