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Heatmap: Cluster_182 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.23 -0.02 -0.13 -0.15 -0.09 0.06 0.23 0.25 0.14 -0.01 -0.16 -0.28 0.01 0.05 -0.08 0.17 0.01 0.62 0.35 0.25 -2.7 -1.17 -0.34 -0.4 0.42 0.35
-0.03 -0.2 0.01 0.28 0.02 -0.39 0.36 0.61 -0.1 0.33 0.35 -0.09 -0.7 -0.06 -0.47 0.02 0.22 0.33 0.03 0.2 -5.66 0.71 -0.99 -0.92 0.43 0.02
0.84 0.54 0.47 0.43 0.34 0.09 0.22 0.31 -0.0 0.08 0.25 0.13 0.51 -0.69 -0.37 -0.36 -0.1 0.53 0.16 0.29 -4.0 -2.8 -0.86 -1.14 -0.74 -0.26
0.72 0.68 0.53 0.09 -0.06 0.11 0.69 0.77 0.42 -0.11 -0.33 -0.53 0.49 -0.52 0.06 -0.14 0.1 0.53 0.36 0.13 -3.81 -2.59 -1.09 -1.08 -0.89 -1.05
0.43 0.02 -0.06 0.03 0.2 0.12 0.31 0.26 -0.25 -0.14 -0.14 -0.17 0.22 -0.52 0.13 0.22 0.28 0.59 0.45 0.33 -3.32 -1.03 -0.25 -0.43 -0.03 -0.28
-0.24 -0.07 0.06 0.17 0.22 -0.12 0.42 0.5 0.27 0.34 0.11 -0.17 -0.42 -0.4 -0.06 0.05 0.09 0.5 -0.03 0.11 -3.2 0.42 -0.18 -0.59 -0.05 -0.43
0.37 0.37 0.15 0.35 0.0 -0.01 0.3 0.33 0.01 -0.18 -0.05 0.02 0.56 -0.5 -0.22 -0.17 -0.54 0.89 -0.14 -0.17 -3.4 -1.56 -0.16 -0.13 0.23 -0.01
-0.2 -0.16 -0.06 -0.03 0.02 -0.32 0.16 0.23 -0.09 0.13 -0.0 -0.1 -0.26 0.07 0.04 0.04 0.23 0.52 0.28 0.18 -1.38 0.81 -0.53 -0.68 -0.11 -0.06
0.54 0.45 0.3 0.05 -0.05 -0.05 0.04 0.05 -0.41 -0.44 -0.5 -0.45 0.31 0.07 -0.08 -0.05 0.26 0.5 0.45 0.35 -2.45 -0.6 -0.38 -0.56 0.14 0.19
0.27 -0.01 0.04 0.3 0.36 0.23 0.63 0.54 0.17 0.04 -0.29 -0.52 0.46 -0.01 -0.15 0.27 -0.04 0.38 0.19 0.25 -3.6 -0.4 -1.45 -1.17 -0.2 -0.32
0.18 -0.65 -0.4 -0.11 0.06 -0.35 0.34 0.36 0.04 0.04 -0.06 -0.26 0.06 -0.24 -0.02 -0.19 -0.1 0.43 0.28 -0.24 -2.19 0.9 -0.12 0.23 -0.08 0.14
0.37 0.03 0.05 0.15 0.03 -0.05 0.47 0.48 0.06 0.28 0.08 -0.05 0.3 -0.02 -0.01 0.56 0.26 0.63 0.17 0.25 -4.14 -0.48 -1.85 -1.33 -0.61 -0.63
0.5 0.14 0.06 0.19 0.22 0.35 0.45 0.5 0.23 0.25 0.09 0.11 0.4 -0.23 -0.04 0.28 -0.03 0.5 0.3 0.16 -4.31 -0.87 -1.89 -1.42 -0.72 -0.67
0.05 0.17 -0.28 -0.1 0.06 0.39 0.29 0.27 0.46 0.03 0.25 0.33 0.3 -0.62 -0.63 0.33 -0.49 0.44 0.03 -0.2 -5.07 -0.57 -0.37 0.28 0.06 -0.03
0.33 0.41 0.11 -0.09 -0.18 -0.06 0.37 0.43 0.08 -0.32 -0.65 -0.92 -0.29 -0.47 -0.15 -0.88 -0.06 0.74 0.36 0.28 -5.73 -0.35 -0.4 -0.76 0.98 0.72
-0.44 0.43 0.48 0.59 0.5 -0.26 0.27 -0.1 -0.7 0.35 0.05 -0.78 -0.94 -0.49 -0.59 -0.26 0.36 1.29 0.47 0.72 -4.65 -0.14 -0.51 -2.62 -0.32 0.05
-0.4 -0.32 -0.53 -0.5 0.08 0.33 0.65 0.41 0.19 0.43 0.25 -0.32 -0.65 0.4 0.48 0.62 0.13 1.11 0.36 0.51 -3.69 -0.81 -2.48 -1.23 -0.85 -0.51
0.31 0.57 0.38 0.17 0.19 0.23 0.5 0.51 0.32 0.28 0.08 0.04 0.41 -0.51 -0.19 -0.26 0.06 0.43 0.26 0.3 -4.1 -0.97 -1.77 -1.04 -0.73 -0.66
0.06 0.56 0.46 0.5 0.03 -0.0 0.36 0.7 0.33 -0.75 -1.22 -1.84 -0.78 -0.6 -0.5 -1.22 -0.24 0.25 0.61 0.45 -4.81 -0.66 -0.52 -1.36 1.14 0.95
-0.16 0.11 -0.03 -0.11 -0.2 -0.24 0.09 0.1 0.08 0.09 -0.2 -0.26 -0.35 -0.29 0.06 0.34 0.02 0.71 0.52 0.38 -1.87 -1.62 0.01 0.08 0.36 0.24
-0.01 -0.07 -0.04 0.23 0.27 -0.3 0.36 0.4 -0.01 0.16 -0.13 -0.43 -0.52 0.12 -0.25 0.31 0.06 0.78 -0.07 -0.09 -3.61 0.24 -0.34 -0.59 0.43 -0.11
0.56 0.21 0.09 0.32 0.32 0.44 0.56 0.62 -0.1 -0.13 -0.23 -0.2 0.7 0.26 -0.17 0.27 -0.25 0.53 0.16 0.19 -5.63 -2.71 -1.87 -1.8 0.12 -0.75
-0.62 0.29 0.5 0.36 0.25 -0.28 0.27 0.4 0.29 0.34 0.21 -0.15 -0.39 -0.45 -0.06 -0.1 0.24 0.55 0.15 0.41 -4.41 -0.09 -0.26 -0.98 -0.25 -0.51
0.15 0.71 0.36 0.02 -0.05 0.1 0.23 0.23 0.14 -0.02 -0.06 -0.27 -0.08 -0.17 0.16 0.07 -0.21 0.78 0.14 -0.17 -1.46 -0.82 -0.27 -0.67 -0.0 -0.43
-0.01 0.16 0.32 0.22 0.42 0.01 0.23 0.41 0.1 0.3 0.04 -0.17 -0.28 -0.42 -0.1 -0.25 0.31 0.49 0.18 0.11 -5.42 0.46 -0.83 -0.63 -0.31 -0.3
-0.12 -0.01 0.34 0.38 0.33 0.11 0.81 0.58 0.19 0.08 -0.21 -0.33 -0.26 -0.56 -0.75 -0.34 -0.13 0.64 0.11 0.35 -3.65 0.42 -0.37 -0.94 -0.25 -0.3
0.22 0.21 0.22 0.12 -0.13 -0.32 0.28 0.26 -0.25 -0.32 -0.56 -0.68 0.17 0.22 0.35 0.17 0.03 0.78 0.42 -0.03 -2.42 -0.52 -0.72 -0.79 0.51 0.16
0.24 -0.05 0.19 0.16 0.13 -0.1 0.24 0.2 -0.16 0.29 -0.07 -0.12 0.09 -0.02 0.11 0.01 0.24 0.42 0.31 0.22 -2.77 0.09 -0.89 -0.8 -0.1 -0.11
0.54 0.56 0.38 0.26 0.14 0.01 0.32 0.22 0.06 -0.0 -0.18 0.13 0.53 0.03 0.23 0.12 -0.23 0.49 0.35 0.1 -3.05 -1.6 -1.33 -1.06 -0.67 -0.42
0.42 0.5 0.2 0.34 0.2 -0.08 0.47 0.39 -0.24 -0.24 -0.56 -0.58 -0.02 -0.33 -0.29 0.05 0.15 0.94 0.38 0.51 -3.66 -0.81 -0.86 -1.08 -0.01 -0.1
-0.68 -0.61 -0.3 0.15 0.16 -0.05 0.53 0.67 -0.07 0.44 0.21 -0.3 -0.54 -0.2 -0.11 0.12 0.36 0.35 0.38 0.21 -3.64 0.78 -0.48 -1.04 -0.03 -0.26
0.64 0.31 0.12 0.06 -0.16 0.0 0.36 0.43 -0.01 -0.49 -0.59 -0.72 0.15 -0.43 -0.17 -0.34 0.06 0.59 0.61 0.38 -2.49 -0.19 -0.85 -0.77 0.44 0.15
0.51 0.23 0.01 -0.04 -0.05 -0.27 0.38 0.29 -0.14 -0.16 -0.39 -0.59 0.39 0.16 0.14 0.18 0.14 0.86 0.26 0.14 -4.17 -0.34 -0.79 -0.78 0.12 -0.14
0.16 0.81 0.54 0.28 0.06 -0.12 0.13 0.14 -0.04 -0.05 -0.18 -0.23 0.07 -0.16 0.27 -0.1 -0.32 0.92 0.28 0.02 -5.07 -0.52 -0.84 -1.11 0.13 -0.39
0.22 0.58 0.55 0.28 -0.11 -0.2 0.03 0.29 -0.07 -0.29 -0.28 -0.41 0.08 -0.05 0.43 -0.27 -0.09 0.47 -0.11 0.06 -1.24 -0.52 -0.01 -0.74 0.24 -0.15
0.07 0.09 0.03 0.16 0.23 0.03 0.55 0.41 0.14 0.27 -0.08 -0.23 -0.04 -0.02 -0.4 0.27 0.08 0.6 -0.08 0.02 -2.7 -0.32 -0.57 -0.35 -0.07 -0.28
0.33 -0.88 -1.59 -1.24 -0.57 -0.09 0.78 0.55 0.05 0.08 -0.05 -0.35 0.28 -0.01 -0.4 -0.47 0.02 1.19 0.55 0.09 -2.09 -0.26 -0.04 -0.32 0.46 0.07
0.62 -0.09 -0.02 -0.08 -0.29 -0.18 0.43 0.33 -0.16 -0.14 -0.24 -0.01 0.77 0.02 0.22 0.42 0.21 0.72 0.47 0.41 -2.29 -2.78 -0.82 -1.02 -0.49 -0.4
0.11 -0.02 0.43 0.32 0.27 0.06 0.33 0.23 -0.09 -0.18 -0.4 -0.52 -0.16 -0.0 0.27 0.29 0.15 0.55 0.26 0.19 -4.66 -0.47 -0.91 -0.82 0.38 -0.03
0.27 0.1 0.05 -0.04 -0.23 -0.33 0.25 0.17 0.06 0.24 0.02 0.07 -0.01 -0.36 0.48 -0.17 0.03 0.9 0.38 0.3 -3.79 -0.79 0.01 -0.25 -0.5 -0.36
-0.15 -0.07 0.14 0.23 0.09 -0.35 0.35 0.35 0.1 0.14 -0.06 -0.27 -0.54 0.37 -0.18 0.36 0.05 0.31 0.02 0.09 -1.65 -0.12 -0.27 -0.42 0.21 0.04
0.31 -0.01 -0.08 -0.16 -0.23 -0.51 0.34 0.17 0.09 0.38 0.04 -0.04 0.09 -0.09 0.46 -0.03 0.05 0.79 0.63 0.33 -3.38 -0.91 -0.25 -0.5 -0.45 -0.37
0.77 0.57 0.24 0.37 0.5 0.37 0.57 0.48 0.47 0.36 0.1 0.03 0.45 -0.64 0.16 -0.49 0.01 0.14 0.27 0.05 -5.63 -2.7 -1.48 -0.92 -1.41 -1.41
0.17 0.18 0.13 0.04 -0.67 -0.75 -0.22 0.51 -0.35 0.08 -0.19 -0.43 -0.63 -0.15 0.25 0.33 0.18 1.05 0.71 0.11 -2.99 -0.85 0.16 -1.14 0.32 0.32
0.66 0.31 0.21 -0.01 0.08 0.1 0.24 0.22 0.09 0.13 -0.03 -0.1 0.46 -0.07 0.15 -0.11 0.03 0.43 0.32 0.29 -3.41 -0.87 -0.78 -0.7 -0.5 -0.45
0.32 0.16 -0.01 -0.27 -0.38 -0.33 0.24 0.24 0.04 0.1 -0.03 -0.13 0.13 -0.22 -0.16 -0.16 0.16 0.67 0.31 0.26 -1.36 -0.53 -0.14 -0.03 0.02 0.03
0.36 0.31 0.34 0.2 -0.02 -0.09 0.44 0.36 -0.07 -0.07 -0.09 -0.24 0.07 -0.1 -0.14 -0.54 0.09 0.63 0.3 0.38 -2.79 -1.19 -1.09 -0.7 0.18 0.37
0.5 0.38 0.26 0.25 0.04 -0.3 0.21 0.16 0.14 0.08 0.12 0.15 0.45 -0.3 -0.33 -0.21 -0.14 0.67 0.21 0.24 -4.97 -0.61 -0.67 -0.79 -0.13 -0.08
0.23 -0.25 -0.61 -0.26 0.06 0.22 0.48 0.4 0.24 0.1 -0.06 -0.5 0.09 -0.14 -0.04 -0.31 0.29 0.74 0.51 0.31 -1.49 -0.39 -0.59 -0.86 -0.0 0.02
0.34 -0.15 -0.47 -0.52 -0.16 -0.11 0.53 0.37 0.14 0.14 -0.13 -0.43 0.12 0.25 0.17 0.1 0.31 0.89 0.43 0.19 -2.28 -0.84 -0.6 -0.52 -0.11 -0.18
0.5 -0.27 -0.44 -0.5 -0.2 -0.29 0.55 0.53 -0.18 -0.0 -0.21 -0.37 0.44 -0.02 0.0 0.02 0.23 0.67 0.54 -0.08 -2.94 0.44 -0.45 -0.48 0.07 -0.51
0.2 0.82 0.65 0.19 -1.16 -1.38 0.01 0.49 -0.56 -0.66 -0.65 -0.84 0.15 -0.48 0.17 0.19 -0.16 1.4 0.8 0.0 -2.84 0.34 -1.21 -1.3 0.52 -0.8

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.