Heatmap: Cluster_84 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.22 0.03 -0.9 -3.19 -3.82 -5.24 -0.88 0.31 -0.31 0.91 0.77 0.72 1.06 1.07 -1.6 0.89 -0.45 0.16 -1.32 -0.39 -3.33 -4.86 0.04 -0.16 0.95 -0.44
1.18 1.25 0.41 -0.66 -2.03 -2.24 -0.93 0.08 0.31 0.47 0.92 1.25 1.31 -2.58 -2.58 1.78 -0.99 -0.85 -1.29 -0.8 -3.84 -1.74 -1.11 -0.87 -1.06 -1.67
-1.65 -3.81 -3.42 -1.78 -1.06 0.1 0.78 -0.48 1.84 1.27 0.87 0.5 -1.46 1.17 0.59 -0.05 -1.22 -1.31 -0.7 -1.05 -2.1 0.2 0.16 -0.17 -0.18 -0.47
0.41 - - 1.14 -0.97 - - 0.8 0.11 - 0.06 0.8 0.99 -1.46 - - - - - -1.2 0.72 - 2.63 2.22 -0.55 -1.45
-0.66 -0.82 -0.78 -0.56 -0.32 -0.11 -0.4 -0.7 0.43 0.74 0.97 1.1 -0.69 0.01 -0.82 0.78 -0.18 -0.46 -0.64 -0.7 -0.3 -0.57 0.79 0.68 -0.52 0.06
-0.02 -0.01 -0.3 -0.47 -0.35 -0.31 -0.37 -0.55 -0.3 0.05 0.34 0.66 -0.1 -0.27 -0.65 0.81 0.06 -0.16 -0.37 -0.35 -0.18 0.31 0.78 1.14 -0.87 -0.94
-2.2 -1.4 -1.12 -0.56 -0.51 0.73 0.68 0.47 1.06 1.03 1.2 0.74 -1.48 0.73 -0.38 0.6 -1.14 -1.48 -0.53 -1.14 -1.5 -1.61 0.33 0.83 -0.97 -1.57
0.04 -0.02 -0.03 0.08 0.05 -0.4 -0.31 -0.2 -0.06 0.74 0.89 1.09 0.02 0.34 -0.56 -0.17 -1.17 -0.6 -0.64 -1.1 -2.97 -1.76 0.2 0.92 0.15 0.31
0.77 -1.79 - -0.53 -0.13 -0.6 0.5 0.34 1.71 0.3 0.6 1.49 -0.76 - -0.33 -0.09 - -2.68 - - - -0.48 2.02 -0.0 -0.25 0.19
0.3 -0.1 -0.45 -0.63 -0.54 -0.57 -0.2 -0.19 0.08 0.3 0.56 0.85 0.32 0.12 -0.44 0.69 0.15 -0.25 -0.16 -0.27 -0.38 -0.87 0.45 0.71 -0.77 -0.94
-1.84 -3.58 -2.2 -0.97 -0.75 -0.99 -0.53 -0.45 0.61 0.75 1.02 1.0 -1.48 0.9 -1.23 1.02 0.03 0.94 0.53 0.65 -1.57 -2.47 1.02 -0.23 -1.66 -0.33
0.92 -0.65 -0.62 -0.06 -0.99 -0.53 -0.21 0.3 -0.03 0.91 0.97 0.86 0.99 0.32 -0.05 -0.23 -0.64 -0.21 -0.65 -0.94 -3.53 -3.79 0.01 0.03 -0.9 0.59
1.06 0.55 0.18 -0.27 -1.99 -2.69 -0.98 0.15 0.25 0.07 0.43 0.75 1.01 0.43 -0.84 1.0 0.21 0.06 -0.17 0.15 -2.0 -0.39 -3.55 -1.27 -0.12 -0.62
0.81 -0.31 -0.57 -0.88 -0.99 -0.83 -0.13 0.1 -0.09 -0.09 0.22 0.56 0.95 0.5 0.26 0.42 -0.29 -0.1 -0.06 -0.3 -0.31 -0.16 0.02 0.38 -0.67 -0.69
1.2 0.67 -0.34 -1.04 -1.48 -2.06 -1.95 -2.13 -1.37 -0.28 -0.06 0.31 0.63 1.3 -0.11 1.03 -0.51 -0.56 0.59 0.01 -1.43 -1.11 0.29 -0.0 0.54 -0.07
1.01 0.28 0.35 -0.74 -1.0 - -2.23 - -0.52 -0.74 0.01 0.59 0.96 0.93 -1.67 0.86 -1.18 -0.81 0.01 -1.57 -0.98 -0.43 1.19 -0.1 1.04 0.62
0.73 0.28 -0.36 -0.69 -0.99 -1.14 -0.37 -0.09 0.19 0.35 0.62 0.82 0.7 -0.66 -0.82 0.56 0.08 0.0 -0.36 -0.26 -0.87 -1.04 0.85 0.38 -0.54 -0.92
-0.03 -0.64 0.52 0.46 0.41 -0.9 0.02 -0.23 0.45 0.73 1.73 1.48 -0.27 -1.9 -0.66 -0.65 -1.03 -2.89 -0.19 -0.07 -3.23 -4.23 -0.33 0.69 -0.75 -0.44
-2.54 -3.96 -1.56 -0.41 0.41 0.66 1.0 0.69 0.8 0.88 0.82 0.36 -1.76 0.48 -0.16 0.56 -0.31 -0.78 -0.58 -0.33 -0.26 -0.34 0.02 -0.9 -0.4 -0.56
-0.98 -0.91 -0.55 -0.11 -0.38 -1.09 -0.48 -0.12 0.38 1.11 1.3 1.03 -0.32 0.53 -0.74 0.27 -0.26 -0.78 -1.02 -0.63 -2.08 0.84 -0.56 0.09 0.41 -0.29
0.01 -0.23 -0.16 0.05 0.04 -0.4 0.06 0.13 -0.02 0.47 0.68 0.58 0.1 0.15 -0.39 -0.11 -0.91 -0.62 -0.39 -0.76 -0.29 0.27 0.7 -0.16 0.21 -0.5
0.47 -0.11 -0.56 -0.74 -0.67 -0.44 -0.3 -0.21 0.1 0.32 0.71 0.98 0.79 0.66 -0.46 0.51 0.58 -0.77 -0.82 -0.65 -1.43 -1.16 0.01 0.35 -0.22 -0.42
0.11 -1.08 -2.04 -0.49 -0.34 -1.01 -1.06 -1.06 0.25 0.5 1.09 0.84 -0.14 -1.43 -1.24 -1.76 -1.92 -0.28 -1.01 -1.05 0.73 -2.15 1.92 1.66 -0.13 -0.1
0.22 -0.68 -0.96 -0.74 -1.49 -2.29 -0.43 0.39 0.14 0.35 0.87 0.56 1.2 0.44 0.32 1.0 0.25 -0.21 -0.21 -0.61 -1.63 -0.74 -0.51 -1.18 0.7 -0.66
0.18 -0.54 -1.12 -0.58 -1.26 -1.93 -0.43 0.5 0.45 0.55 0.9 0.56 1.29 0.16 0.23 0.63 -0.27 -0.19 -0.49 -1.11 -1.24 -0.56 -0.13 -0.03 0.4 -0.85
-1.52 -1.0 -0.27 0.41 0.14 -0.19 0.12 0.46 0.84 1.05 1.16 1.01 -1.06 0.34 -1.33 0.07 -1.68 -0.87 -0.65 -0.83 -1.24 0.3 -0.5 0.37 -0.06 -0.79
-0.88 -0.62 -0.53 0.15 0.47 -1.15 0.16 0.66 0.96 1.33 1.53 0.69 -0.91 -0.3 -2.57 -0.41 -2.37 -0.76 -1.68 -0.94 -0.54 0.11 0.53 -0.44 -0.07 -0.48
1.06 0.15 -0.63 -1.27 -1.65 -1.27 -0.68 -0.29 0.16 0.45 0.85 1.31 1.34 0.12 -0.63 1.15 -0.31 -0.26 -0.52 -0.33 -1.49 -0.71 -1.04 -0.45 -0.83 -1.13
0.34 -0.61 0.03 0.18 -0.06 0.11 0.09 0.24 0.22 0.31 0.69 0.56 0.51 -0.09 -0.26 -0.33 -0.48 -0.86 -0.36 -0.31 -2.01 -2.42 -0.46 0.96 0.0 0.25
- - - - -3.73 -2.97 -0.84 -2.33 1.45 1.51 1.68 1.17 -2.09 -1.31 - -2.36 -0.38 -0.62 -2.18 -0.47 0.88 -2.59 2.02 1.8 -0.74 -0.64
-0.32 -0.53 -0.79 -0.75 -0.68 -0.54 -0.34 -0.56 0.47 0.31 0.78 0.77 -0.31 -0.01 -0.21 -0.77 -0.76 -0.06 0.05 -1.13 -1.02 -1.81 0.98 1.51 0.35 0.42
1.08 1.37 0.69 -0.13 -1.68 -3.06 -2.5 -1.01 -1.34 -0.19 0.42 1.07 1.41 -1.25 -1.96 1.23 -1.25 -0.73 -0.34 -0.8 -2.43 -3.38 0.57 -0.0 0.1 0.08
1.11 -0.69 -1.7 -1.5 -1.14 -0.97 0.06 -0.01 0.37 0.84 1.09 0.81 1.31 0.55 -0.74 1.2 -0.25 -0.92 -1.39 -2.01 -0.94 -2.09 -0.09 -0.41 -0.59 -0.68
0.11 0.12 0.1 0.12 0.04 -0.26 -0.33 -0.09 0.28 0.28 0.57 0.59 0.2 0.1 0.04 -0.19 -0.37 0.11 -0.34 -0.55 -2.3 -0.57 0.15 -0.02 0.17 0.14
0.06 -0.2 -0.54 -0.73 -0.56 -0.37 -0.08 -0.07 0.15 0.46 0.5 0.61 0.23 0.05 -0.4 0.35 0.46 0.06 0.06 0.16 -1.1 -1.05 0.42 0.6 -0.66 -0.41
0.05 -0.19 -0.49 -0.88 -0.98 -0.8 -0.83 -0.84 -0.34 0.19 0.46 0.85 0.03 -0.49 -1.1 0.35 0.58 -0.41 -0.37 -0.13 -0.93 0.2 1.07 1.43 -0.36 -0.19
0.24 -0.33 -0.5 -0.56 -0.94 -1.27 -0.88 -0.73 -0.01 0.55 1.01 1.28 0.5 -0.21 -0.95 0.63 0.64 -0.42 -0.25 -0.15 -3.02 -0.34 0.48 0.75 -0.47 -0.89
0.57 -0.17 -0.63 -0.54 -0.52 -0.63 -0.13 -0.06 -0.34 -0.2 0.28 0.95 0.72 -0.89 -1.05 0.26 0.05 -0.11 -0.84 -0.71 -0.84 -0.78 0.99 0.79 0.82 -0.62
-0.1 -0.4 -0.44 -0.09 0.23 0.28 0.51 0.36 0.29 0.4 0.45 0.27 -0.06 0.24 -0.08 0.35 -0.23 -0.54 -0.33 -0.61 -0.61 0.1 0.3 -0.4 -0.49 -0.62
0.85 0.03 -0.33 -0.43 -0.28 -0.16 -0.01 0.04 -0.07 -0.14 0.34 0.98 0.89 -0.67 -0.7 0.35 0.24 -0.5 -0.45 -0.51 -1.39 -1.11 0.42 0.39 0.15 -0.98
0.62 -0.47 -1.26 -2.26 -1.93 -1.26 -0.46 -0.54 0.06 0.64 1.08 1.32 1.19 0.09 -1.07 -1.35 -0.51 -0.2 -1.47 -1.53 0.61 -2.92 1.26 0.84 -0.65 -0.26
-1.3 -1.27 -1.34 -0.56 -0.24 -0.46 -0.15 -0.2 0.37 0.95 1.25 1.19 -1.22 0.26 -0.17 -0.49 -0.59 0.09 0.1 -0.07 -0.44 -0.37 0.38 0.58 -0.47 -0.19
0.19 -0.42 -0.58 -0.49 -0.2 -0.29 -0.22 -0.16 0.19 0.58 0.82 0.93 0.48 0.08 -0.31 0.12 -0.42 -0.16 0.02 -0.62 -0.39 -1.05 0.13 0.47 -0.51 -0.15
0.68 -0.4 -0.58 -0.68 -1.28 -1.57 -1.35 -0.94 -0.36 -0.04 0.67 1.06 0.91 -0.13 -1.16 0.8 0.13 -0.27 -0.6 -0.9 -0.1 0.31 0.36 0.93 0.14 -0.56
-1.73 -0.73 -0.31 -0.2 -0.29 -0.25 -0.08 -0.07 0.26 0.33 0.33 0.31 -1.44 -0.51 -0.07 0.76 -0.59 0.31 0.13 0.02 -0.21 -0.79 1.29 0.85 -0.66 -0.19
0.23 0.19 -0.2 -0.62 -0.73 -0.34 -0.12 0.05 0.33 0.41 0.55 0.69 0.29 -0.44 -0.57 0.41 -0.21 -0.2 -0.2 -0.31 -0.06 -0.73 0.63 0.62 -0.61 -1.05
-0.17 -1.0 -0.44 0.2 0.41 0.04 -0.17 0.1 0.1 0.77 0.97 0.97 0.34 0.72 -1.41 -0.33 -0.61 -1.39 -1.26 -0.36 -0.42 -1.42 0.76 -1.02 -0.09 0.2
-0.26 -1.33 -0.55 -0.02 0.32 -0.48 -0.27 -0.13 -0.3 0.65 0.91 0.85 0.05 0.68 -1.44 -0.19 -0.51 -1.18 -1.43 -0.51 0.02 -1.04 1.15 -0.01 0.42 0.25
0.77 0.73 -0.07 -0.77 -1.07 -0.59 0.18 0.58 0.84 0.95 1.11 1.24 1.0 -2.58 -2.08 0.62 -0.21 0.04 -0.46 0.03 -6.8 -1.83 -4.5 -1.22 -1.06 -1.87
0.4 -0.16 -0.76 -1.21 -1.39 -1.2 -0.48 -0.3 0.15 0.69 1.11 1.25 0.63 0.1 -1.26 0.42 0.34 -0.98 -0.85 -0.61 -0.95 -0.77 0.61 1.05 -0.88 -0.8
0.06 -0.29 -0.86 -1.29 -1.6 -1.62 -0.57 -0.41 -0.05 0.62 0.91 1.11 0.4 0.24 -1.22 0.71 0.62 -0.51 -0.76 -0.48 -0.71 -0.6 0.83 1.08 -0.74 -0.58
0.23 -0.01 -0.63 -1.17 -0.89 -0.4 0.22 0.36 0.46 0.72 0.79 0.88 0.46 -0.34 -0.36 0.48 0.22 0.16 -0.27 -0.24 -1.35 -1.76 -0.03 0.24 -0.18 -1.44
0.89 -0.56 -1.3 -1.23 -1.72 -2.03 -1.19 -1.03 -0.38 0.57 0.69 0.88 0.58 1.15 -0.2 0.8 -1.88 0.27 -0.03 -0.11 -1.04 -1.26 0.75 0.13 0.42 -0.49
-0.97 -0.2 0.25 0.1 -0.58 -0.71 -0.08 0.09 0.37 0.66 0.8 1.05 -0.6 -0.42 -0.25 -0.41 -0.61 0.48 0.19 -0.13 -2.62 -0.82 0.4 0.06 0.16 0.11
-1.08 -2.0 -0.66 -0.29 0.07 -0.33 -0.13 -1.07 0.34 0.57 0.71 1.28 -0.58 0.09 0.2 0.13 -0.9 -0.36 0.08 -0.29 0.55 -1.47 -0.24 1.02 -0.49 0.27
-0.79 -1.83 -2.56 -2.1 -1.79 -1.77 -0.84 -0.4 0.19 0.99 1.2 0.94 -0.33 0.76 -0.06 0.73 -1.29 0.48 -0.14 0.03 -0.05 -0.32 0.75 0.45 -0.13 -0.11
1.37 -0.47 -1.69 -2.36 -1.56 -2.07 -1.1 -1.4 0.12 0.84 1.31 1.39 1.02 -0.09 -1.23 1.21 -0.63 -0.92 -0.3 -0.26 -1.96 -2.63 -0.05 0.36 -0.58 -0.16
0.66 -0.15 -0.46 -0.91 -1.61 -1.91 -0.98 -0.49 -0.5 -0.18 0.34 0.87 0.78 0.16 -0.2 0.97 0.3 0.09 -0.07 -0.31 0.14 -0.57 -0.35 0.58 0.18 -0.19
-0.36 -0.35 -0.81 -0.99 -0.87 -0.84 -0.5 -0.54 -0.28 0.2 0.46 0.61 -0.4 0.12 -0.82 1.69 -0.04 -0.67 -0.75 -0.81 0.35 0.06 1.26 0.69 -0.57 -0.76
-0.22 -1.55 -2.06 -2.31 -2.13 -1.31 -0.5 -0.28 0.23 0.91 1.4 1.87 0.04 0.36 -1.27 0.35 -0.74 -0.82 -1.27 -0.96 -1.24 -1.57 1.08 1.3 -0.41 -0.59
-0.36 -1.69 -2.61 -2.79 -2.64 -2.12 -0.72 -0.59 -0.02 0.73 1.1 1.63 -0.37 0.46 -1.8 0.48 -0.66 -0.43 -1.3 -0.94 -0.98 -2.31 1.52 1.87 -0.08 -0.46
-0.72 -1.14 -0.77 -0.32 -1.07 -0.66 -1.24 -0.66 -0.47 0.92 0.92 0.32 -0.33 0.64 -1.25 0.31 -1.0 -0.65 -0.13 -1.4 0.92 -0.93 2.06 -0.51 0.01 -0.16
-1.2 -0.36 -0.62 0.26 0.68 0.61 0.8 0.52 1.05 1.19 1.62 0.85 -1.93 -1.94 -1.87 -0.42 -2.46 -0.61 -3.17 -1.53 -3.45 -3.97 1.22 -0.65 -0.08 -0.98
-0.71 -1.18 -0.91 0.01 0.67 -0.05 0.66 0.54 0.7 0.85 0.96 0.74 -0.41 -0.8 -1.1 -0.83 -0.9 -0.63 -0.09 -0.73 -0.42 -0.74 0.23 0.47 -0.04 -0.29
-1.24 -1.27 -1.4 -0.19 -0.2 0.05 -0.71 -0.12 0.93 1.37 1.55 1.12 -0.52 0.62 -0.59 -0.81 -2.96 -0.54 -0.42 -0.97 -0.73 -0.2 0.46 0.52 -1.32 -0.61
-0.49 -0.61 -0.96 0.46 1.08 -0.11 -0.55 -0.76 1.37 1.38 2.08 0.28 -0.47 0.32 -0.18 -0.94 -2.24 -0.65 -4.56 -3.0 -0.83 -2.57 0.33 -0.33 -1.28 -2.15
-3.33 -3.48 -2.7 -1.15 -1.01 -0.29 0.41 -0.42 1.9 1.0 1.3 1.15 -2.02 0.48 -0.32 -0.32 -1.5 -1.73 -1.61 -2.04 -3.27 0.32 0.44 0.1 0.92 0.34
-1.83 -0.51 -0.82 0.14 -0.36 -0.61 0.12 0.63 0.79 0.81 0.68 0.62 -1.1 0.53 -0.49 0.57 -0.17 -0.36 -0.5 0.18 -5.3 0.1 -0.4 -0.0 0.13 0.12
-0.32 -1.12 -1.15 -0.73 -1.14 -1.32 -1.27 -0.94 0.06 0.48 0.53 0.97 -0.23 -0.05 0.18 -0.26 -0.25 -0.19 0.57 -0.03 -0.9 -3.3 1.93 1.04 -0.41 -0.25
0.71 -0.27 -1.1 -1.59 -1.09 -0.81 0.08 -0.08 -0.1 0.08 0.03 -0.1 0.74 0.67 0.69 0.41 -0.02 0.55 0.21 -0.28 -0.89 -1.02 0.13 0.46 -0.72 0.0
0.93 -0.24 -1.18 -1.44 -0.87 -0.43 0.1 -0.02 0.01 0.24 -0.04 0.06 0.79 0.77 0.64 0.49 -0.03 0.26 0.32 -0.16 -1.27 -0.97 -0.28 0.12 -0.69 -0.48
-2.51 -2.44 -1.42 -0.88 0.19 0.88 1.04 0.36 1.23 1.18 0.74 0.06 -2.42 0.99 -0.49 0.09 -2.12 -0.5 -0.33 -0.6 -2.54 -0.29 0.75 -0.38 -0.71 -0.53
0.51 -0.05 0.77 0.05 1.3 -0.1 0.34 -0.84 0.92 1.21 1.92 1.54 0.69 - -1.97 - - - -1.97 - -1.18 - 0.12 0.01 -3.42 -
0.96 -0.83 -0.37 -0.56 -1.01 -0.94 0.24 0.4 -0.07 0.22 0.43 1.09 1.72 0.68 0.14 0.79 -1.19 -0.82 -0.33 -0.66 -4.29 -1.89 -0.55 -1.33 -0.41 -0.71
-0.92 -0.98 -0.67 -0.63 -0.34 -0.72 -0.66 -0.59 0.22 0.6 0.9 1.37 -0.53 -0.23 -0.42 0.8 -0.06 -0.55 -0.64 -1.01 -0.11 -1.66 1.55 1.21 -2.62 -1.36
-4.84 -5.02 -2.72 -2.51 -0.47 0.49 0.68 -0.71 1.47 1.02 0.39 -0.21 -4.73 0.55 0.42 0.28 0.77 -0.85 -0.68 -0.0 -1.88 0.71 0.35 0.18 -0.49 0.42
-0.2 -1.82 -0.89 -1.2 -1.52 -1.49 -1.05 -0.58 0.25 0.86 0.85 0.95 0.31 0.19 -0.67 0.32 0.04 0.42 0.36 0.03 -0.66 -1.19 0.45 0.73 0.36 -0.05
0.16 -0.17 -0.36 -0.55 -0.51 -0.53 -0.24 -0.23 0.12 0.54 0.7 0.82 0.25 -0.01 -0.8 0.7 0.43 -0.33 -0.3 0.03 -1.77 -0.27 -0.28 0.85 -0.59 -0.43
-0.14 -0.22 -0.05 0.02 0.04 0.16 0.48 0.45 0.22 0.05 0.21 0.11 -0.07 0.14 -0.25 -0.14 0.02 -0.15 0.04 -0.3 -0.61 -0.45 0.48 -0.27 -0.04 -0.39
0.45 0.37 -0.11 -0.44 -0.65 -0.92 -0.46 -0.44 -0.22 0.0 0.13 0.34 0.4 -0.49 -0.32 0.7 0.01 0.58 0.03 -0.29 -0.29 -0.02 -0.28 0.84 -0.29 -0.34

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.