Heatmap: Cluster_24 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.64 -0.53 -1.08 -0.31 -0.25 -0.25 0.3 0.33 0.21 0.23 0.5 0.55 0.53 -1.69 -1.79 -2.0 -2.03 -0.88 -1.0 -1.76 -0.44 -0.99 1.31 0.18 1.42 0.74
0.09 0.58 -1.15 -0.62 0.24 -1.09 -0.13 -0.37 0.48 0.24 0.67 0.33 -1.02 -0.62 -2.08 -0.71 -0.98 0.44 -1.51 -3.85 -0.87 0.52 1.45 -0.54 1.37 0.38
1.04 -0.44 -0.52 -0.52 -1.1 -1.61 -0.37 0.05 -0.6 0.03 0.58 0.45 0.84 0.22 -0.51 -1.15 -0.41 0.55 0.11 -0.18 -1.51 -1.19 0.59 0.13 0.79 0.32
0.49 -0.24 - - - - - -1.95 - -0.31 -0.3 0.84 -0.67 0.97 - -0.25 - -2.43 -2.19 - -1.51 -1.16 2.69 2.36 1.21 0.64
0.52 -0.31 -0.5 -0.25 -0.39 -0.18 0.34 0.08 0.17 0.27 0.39 0.04 0.65 -0.69 -0.47 -0.86 -0.53 0.43 -0.43 -0.45 -2.19 -1.76 0.82 0.29 0.94 0.26
0.47 -0.56 -0.6 -0.06 -0.06 -0.71 -0.3 0.2 0.08 0.27 0.37 0.2 0.46 -0.5 -0.74 -0.54 -0.89 -0.26 -0.24 -0.46 -1.71 -0.34 1.05 0.55 0.78 0.5
0.54 1.15 0.41 -0.62 -2.66 -3.84 -1.6 -0.38 0.2 0.21 0.99 1.2 0.98 -1.74 -1.91 -2.06 -1.03 -0.36 -1.3 -0.88 -3.22 -1.5 0.97 0.55 1.27 0.18
0.76 0.9 0.29 -0.46 -1.07 -0.92 -0.23 0.14 0.18 0.23 0.35 0.37 0.54 -0.17 -0.46 -0.58 -0.23 -0.37 -0.73 -0.32 -1.11 -1.02 0.58 0.07 0.38 0.1
0.44 0.11 0.23 -0.12 -0.34 -1.05 -0.45 -0.14 -0.25 0.23 0.75 1.16 0.82 -1.57 -0.9 -1.43 -1.91 -0.78 -0.42 -1.13 -2.52 -2.15 1.32 1.02 0.14 0.61
0.49 -0.17 -0.99 -0.01 -0.77 0.04 -0.04 0.04 -0.17 -0.35 -0.06 -0.11 -0.37 -0.58 -1.09 -0.31 -1.39 0.47 0.37 -1.08 -2.42 -0.23 1.23 -0.03 1.63 0.42
0.77 -0.18 -0.87 -0.55 -0.27 0.09 0.42 0.37 0.47 0.17 0.25 -0.17 0.14 -1.55 -1.12 -1.24 -1.12 0.37 -0.03 -0.68 -2.6 0.43 0.44 0.5 0.95 0.2
0.11 -1.04 -0.86 0.4 0.05 -0.66 -0.12 0.1 0.43 0.03 0.43 0.16 0.28 -1.11 -1.14 -0.74 -0.98 0.31 -0.73 -0.85 -3.03 -0.72 1.47 0.56 1.07 0.44
0.91 0.26 0.24 0.42 -0.06 -0.44 -0.37 -0.15 -1.1 -1.08 -0.34 -0.02 0.92 -1.14 -1.4 -1.28 -1.07 -0.77 -1.04 -0.97 0.39 -1.35 1.7 0.11 0.86 0.38
0.78 -0.01 -1.04 -0.47 -1.09 -1.51 -0.03 0.27 0.22 0.29 0.42 0.19 -0.34 -0.7 -0.8 -0.71 -0.79 0.3 -0.09 -1.22 -2.63 0.38 1.17 0.7 1.03 0.08
0.13 -1.47 -0.51 -0.01 -0.73 -1.46 0.11 0.71 -0.78 0.32 0.29 -0.06 0.82 -0.47 -2.26 -0.92 -1.56 -0.44 -0.78 0.03 -0.19 -2.79 1.01 0.09 1.26 1.45
0.73 0.3 0.42 0.26 -0.31 -0.7 -0.53 -0.49 -0.53 -0.71 -0.34 0.05 0.18 -0.98 -0.91 -0.34 -1.19 -0.92 -0.72 -0.65 0.31 -0.05 1.0 -0.14 1.6 0.37
-0.03 -0.83 -0.87 0.64 0.36 -0.01 0.19 0.35 -0.41 -0.64 0.17 -0.65 -0.14 -3.26 -2.91 -3.94 -2.95 -1.45 -1.56 -0.79 0.23 -1.01 2.27 0.72 0.81 1.01
-0.11 -0.37 -0.13 -1.02 -1.5 -1.61 -0.85 -0.25 0.51 0.8 1.15 1.18 0.5 -0.53 -0.49 -0.6 -2.28 -1.04 -0.96 -0.99 -1.65 -0.31 1.19 1.07 0.76 -0.35
0.28 -1.63 -0.62 0.63 0.06 -1.06 0.15 -0.0 0.88 0.06 0.96 -0.34 -1.28 -1.16 -1.34 -0.21 -1.03 -0.01 -1.77 -1.03 -2.3 -3.34 1.41 0.1 1.5 0.84
0.68 0.33 0.43 0.26 -0.41 -0.81 -0.52 -0.1 -0.49 -0.9 -0.67 -0.46 0.24 -0.48 -0.32 -0.83 -0.44 -0.66 -0.41 -0.21 -0.19 -0.05 1.52 0.08 0.53 0.65
1.79 0.36 0.12 -0.24 -1.11 -1.38 -0.71 -0.06 -2.44 -1.76 -0.89 -0.45 1.61 -0.42 -0.93 -1.28 -1.4 -1.08 -0.85 -0.7 -1.77 -0.98 1.03 -0.13 1.16 1.27
0.88 -0.25 -0.34 0.14 -0.47 -0.53 0.05 0.01 0.24 -0.18 0.64 0.43 0.64 -1.1 -1.04 -1.56 -1.53 -0.42 -1.09 -1.43 -1.28 -0.05 0.86 0.68 0.9 0.62
0.52 0.9 0.8 0.53 -0.18 -0.46 -0.07 0.13 -0.26 0.01 0.03 0.21 0.45 -1.1 -1.56 -2.06 -1.04 -1.0 -0.54 0.06 -2.77 -0.67 0.8 0.37 0.69 0.35
0.66 0.02 0.17 0.21 0.06 0.04 0.24 0.42 -0.54 -0.71 -0.61 -0.53 0.51 -1.09 -1.32 -1.52 -1.47 -1.14 -1.15 -0.83 -0.13 -0.62 1.73 0.09 0.85 0.73
0.55 -0.17 -0.44 -0.23 -0.52 -0.44 -0.41 -0.21 -0.01 0.38 0.67 0.87 0.68 -1.5 -0.96 -1.6 -1.3 -0.15 -0.22 -1.15 -1.62 -0.86 1.15 1.31 0.28 0.1
0.71 0.34 0.24 0.2 -0.57 -1.59 -1.76 -0.65 -0.74 -0.34 0.27 0.5 0.36 -1.5 -1.59 -1.77 -1.23 -0.98 -1.11 -0.65 0.35 0.53 1.53 0.93 0.61 0.57
0.66 0.38 -1.24 -0.77 -1.1 -1.63 -0.55 0.09 -0.83 -0.51 0.37 0.92 0.54 -0.56 -0.83 -2.03 -2.18 -0.91 -0.35 -2.46 -2.76 -0.75 2.11 1.29 0.69 0.42
0.08 0.05 -0.37 -0.34 0.09 -0.3 -0.28 -0.34 -0.13 0.2 0.49 0.37 0.29 -0.69 -1.07 -0.85 -1.37 0.27 -0.7 -1.84 -0.15 -0.21 1.59 0.71 0.37 0.05
0.93 -0.1 -0.65 -0.48 -0.63 -0.95 -0.14 0.11 0.37 0.35 0.55 0.44 0.69 -1.02 -0.59 -1.14 -0.47 0.08 -0.33 -0.64 -1.37 0.23 0.92 0.39 0.31 -0.28
1.24 -0.14 -0.11 0.03 -0.32 -0.45 0.03 0.27 -0.2 0.11 0.41 0.74 1.3 -2.0 -1.13 -2.12 -1.01 -0.5 -0.46 -0.01 -0.96 -1.62 0.15 0.6 0.12 0.29
0.92 -0.79 -1.88 -1.33 -0.24 -0.0 0.53 0.26 -0.24 -0.07 -0.12 -0.07 0.81 0.33 -1.48 -1.89 -1.49 -0.59 -0.99 -1.59 -1.25 0.24 1.32 0.66 0.95 0.69
0.54 -0.46 -0.8 -0.69 -0.69 -0.78 0.12 0.14 -0.35 -0.33 -0.23 -0.4 1.05 -0.1 -0.19 -0.77 -0.52 0.26 -0.33 0.18 -0.86 -1.05 1.29 -0.36 0.99 0.58
1.68 0.7 0.39 0.36 -1.83 -3.0 -1.52 -0.06 -1.66 -1.29 -0.62 -0.73 1.37 -2.14 -2.44 -1.73 -2.36 -0.85 -1.81 -1.75 -1.06 -1.26 1.44 1.13 1.2 1.12
-0.22 -2.67 -2.49 -1.85 -0.66 -0.31 0.24 0.17 0.44 0.67 0.72 0.6 0.35 -0.81 -0.8 -1.13 -0.41 0.13 -0.44 -0.01 -2.08 -2.45 0.7 1.04 1.41 0.55
0.8 0.58 0.53 0.36 -0.11 -0.59 -0.47 -0.12 -0.43 -0.43 -0.13 0.05 0.35 -0.99 -0.92 -0.61 -1.0 -0.82 -0.88 -0.26 -0.21 -0.04 1.19 0.05 0.66 0.29
0.65 -0.24 0.15 -0.72 -1.58 -1.08 -0.52 0.22 -0.17 0.15 0.37 0.63 0.02 -0.09 -2.85 -1.53 -2.1 -0.76 -1.04 -0.64 -2.66 -3.14 1.43 0.81 1.37 1.41
0.92 0.61 0.45 0.19 -1.06 -0.94 -0.37 0.5 -0.04 -0.09 -0.04 0.39 0.58 -1.92 -1.48 -1.26 -0.87 -0.27 -0.44 -0.29 -2.51 -0.69 0.53 0.81 0.37 0.93
1.44 -1.02 -1.08 0.48 -0.89 -0.86 -1.43 0.09 0.16 0.49 0.53 0.92 1.15 -1.71 -4.89 -2.78 -3.16 -1.31 -2.25 -2.77 -0.82 0.08 1.52 -0.8 1.42 0.33
1.16 0.33 -0.23 -0.08 -1.98 -3.03 -0.51 0.27 -1.64 -0.72 0.09 0.46 1.13 -2.27 -3.71 -3.22 -3.46 -1.43 -1.67 -1.13 0.18 -1.71 1.72 1.14 1.09 1.13
0.89 0.5 -0.12 0.1 0.02 0.16 0.1 0.01 -0.4 -0.82 -0.71 -0.4 0.59 -0.45 -0.42 -0.82 -0.64 -0.32 -0.46 -1.13 -0.36 -0.16 1.22 0.31 0.57 -0.12
0.77 0.51 0.35 0.19 -0.28 -0.7 -0.44 0.05 -0.02 0.2 0.48 0.59 0.69 -1.12 -0.99 -1.37 -0.8 -0.81 -0.89 -0.13 -0.86 -1.28 1.2 0.55 -0.05 -0.06
-0.17 -1.29 -1.79 -0.33 -0.35 -0.44 -0.39 -0.43 -1.01 0.16 0.16 -0.47 -0.71 -0.12 -1.68 -1.69 -1.43 -1.11 -0.52 -2.68 0.35 -0.59 2.25 1.26 0.8 1.3
1.22 0.38 0.41 -0.04 -1.63 -1.74 -0.49 0.36 -0.31 0.14 0.36 0.57 1.34 -1.53 -0.94 -1.54 -1.07 -0.8 -0.84 -0.72 -2.05 -0.84 0.85 0.39 0.42 0.66
1.09 0.16 -1.31 -0.99 -1.05 -0.41 0.1 0.19 -0.26 -0.26 -0.07 -0.31 0.38 -1.3 -1.16 -1.2 -0.85 -0.6 -0.41 -0.94 -2.26 0.53 1.38 0.86 1.19 0.62
0.43 -0.14 -0.55 -0.17 -0.02 0.27 0.51 0.54 0.16 0.08 -0.06 -0.21 -0.06 -1.42 -1.09 -1.7 -0.71 -0.26 -0.46 -0.46 -1.96 -0.39 1.18 0.06 1.22 0.53
0.86 0.23 -0.09 -0.08 -0.35 -0.88 -0.38 -0.2 -0.28 0.1 0.31 0.39 0.67 -0.94 -0.97 -1.11 0.21 -0.13 -0.54 -0.48 -2.32 0.49 0.79 0.44 0.43 0.16
1.01 -1.93 -4.89 -5.81 -1.22 -0.59 0.85 0.59 0.46 -0.02 0.04 -1.21 0.53 -1.84 -3.0 - -1.77 -0.07 -1.18 -1.38 -1.4 -2.43 1.66 1.17 2.09 0.38
0.54 -0.44 -1.04 -0.95 -0.47 -0.47 0.08 0.33 0.15 -0.03 0.15 -0.08 -0.09 -0.15 -0.63 -0.56 -0.35 0.26 -0.15 -0.4 -2.5 -0.49 1.0 0.51 1.25 0.48
1.04 -1.06 - -1.98 -1.32 -0.41 0.03 -0.01 -0.58 -0.37 -0.59 -0.36 0.71 - -2.86 -2.42 -1.1 -0.28 -0.56 -1.64 -1.32 1.25 1.4 -0.43 2.53 -0.05
1.07 -0.39 -0.95 -0.79 -0.2 0.03 0.08 -0.03 0.2 0.32 0.39 0.44 0.38 -1.63 -1.83 -2.14 -1.04 0.23 -0.21 -0.72 -4.92 -0.05 0.88 0.7 1.13 0.19
0.44 0.28 0.22 0.06 -0.31 -0.47 -0.43 -0.21 -0.38 -0.79 -0.6 -0.03 0.13 -1.4 -1.19 -0.93 -1.05 -0.69 -0.5 -0.48 0.35 0.49 1.67 0.39 0.71 0.41
0.59 -0.32 -0.83 -1.13 -1.35 -1.53 -1.01 -0.46 -0.14 -0.23 -0.15 -0.12 0.22 -1.18 -0.13 -0.55 -0.41 0.49 -0.42 -0.0 -0.59 -1.1 1.47 0.75 1.24 1.07
0.35 0.08 -0.24 0.32 0.17 -0.38 0.31 0.45 -0.29 -0.08 0.23 0.28 0.23 -0.43 -0.56 -0.32 -0.9 -0.03 -0.21 -0.68 -0.59 0.35 0.28 -0.35 0.26 0.48
0.67 0.53 0.22 0.2 -0.59 -0.89 -0.65 0.03 -0.15 -0.04 0.54 0.75 0.84 -1.45 -1.44 -0.97 -0.68 -0.93 -1.12 -0.91 -0.06 -1.01 1.56 0.18 0.4 -0.43
0.82 0.14 -0.22 0.42 -0.04 -0.89 -0.16 -0.1 -0.38 -0.55 0.02 -0.08 0.7 -1.08 -0.86 -1.1 -1.33 -0.42 -0.33 -0.6 0.32 -0.19 0.96 0.26 0.98 0.31
0.16 -0.73 -1.97 -1.43 -1.43 -0.54 0.24 0.4 0.46 0.74 0.57 0.29 0.25 -1.44 -1.06 -0.89 -1.16 0.32 -0.27 -0.79 -2.24 -0.69 0.99 0.35 1.55 0.7
0.75 0.83 0.14 -0.81 -1.52 -1.14 -0.4 0.05 -0.47 -0.42 -0.53 -0.55 0.44 -0.31 -0.21 -0.32 0.44 0.41 0.09 -0.22 -0.59 -0.89 1.21 -0.64 1.07 -0.44
0.53 0.04 -0.15 0.33 -0.38 -0.88 0.72 1.28 0.54 0.22 -0.15 -0.6 0.45 -0.71 -1.18 -0.37 -1.3 0.01 -0.21 -0.39 -0.58 -1.37 0.69 -1.02 0.37 0.14
0.61 -2.19 -3.31 -1.41 -1.65 -1.63 0.0 0.54 0.38 0.33 0.42 -0.12 0.11 -2.01 -1.33 -1.72 -1.18 0.54 -0.85 -1.06 -2.17 -0.69 1.9 0.46 1.98 0.01
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0.73 0.89 0.59 0.19 -0.38 -0.67 -0.57 -0.27 -0.19 -0.03 0.39 0.66 0.98 -0.77 -0.7 -0.61 -0.69 -0.62 -0.66 -0.67 -3.05 -1.5 0.91 0.12 0.71 -0.41
1.26 0.04 -0.63 0.36 -0.64 -1.41 -0.72 -0.01 -0.52 -0.17 0.36 -0.12 1.01 -1.21 -1.52 -1.22 -1.92 -0.65 -0.64 -1.4 -1.69 -0.89 1.59 -0.16 1.39 0.78
0.65 -0.39 -0.52 -0.18 -0.92 -1.19 -0.41 0.15 -0.07 -0.01 0.22 0.1 0.43 -1.06 -0.86 -1.37 -1.17 -0.62 -0.97 -1.08 -1.27 0.26 1.2 0.74 1.53 0.81
0.54 0.57 0.43 0.39 -0.14 -0.15 -0.21 0.18 -0.28 -0.4 -0.04 0.04 -0.03 -1.06 -1.27 -0.98 -0.73 -1.44 -1.34 -0.84 -0.12 -0.9 1.73 0.47 0.43 0.26
1.44 0.86 0.26 -1.2 -3.68 -4.8 -2.93 -1.99 -1.33 -0.53 -0.21 0.23 1.43 -0.93 -0.73 -1.52 -1.03 -0.03 0.11 -0.77 -1.81 -0.5 2.34 0.56 -0.86 -0.31
0.89 0.81 0.3 0.13 -0.87 -1.24 -0.97 -0.67 -0.68 -0.5 -0.2 0.09 0.12 -1.27 -0.82 -1.32 -0.53 -0.47 -0.12 -0.2 -0.95 -0.05 1.66 1.05 -0.08 0.42
0.4 -0.75 -0.71 -0.11 -0.65 -1.15 -1.3 -0.79 0.08 -0.45 0.36 -0.2 -0.08 0.01 -0.3 -0.46 -0.44 0.1 0.16 -0.37 -2.36 0.23 1.51 -0.55 1.14 1.16
0.66 0.01 -0.29 0.03 0.03 -0.12 0.28 0.39 0.21 0.06 0.11 -0.08 0.22 -0.4 -0.78 -0.71 -0.86 -0.61 -0.97 -0.89 -2.85 0.17 0.79 -0.09 1.05 0.6
1.02 -0.27 -1.52 -1.41 -1.27 -0.97 -0.03 0.17 -0.15 -0.08 -0.2 -0.22 1.16 -0.58 -0.72 -0.61 -0.47 -0.36 -1.03 -1.1 -0.27 0.11 1.26 0.44 1.36 -0.06
0.2 -0.01 -0.5 -0.32 -0.39 -0.7 -0.31 -0.04 0.04 0.43 0.52 0.68 0.23 -0.04 -0.32 -0.28 -0.25 -0.47 -0.58 -0.36 -1.19 -0.82 1.18 0.46 0.34 0.11
0.23 0.05 -0.66 -1.03 -1.71 -1.04 -0.39 -0.07 0.4 0.53 0.97 1.06 -0.5 -0.39 -2.41 -1.04 -1.04 -1.12 -1.18 -1.12 -1.81 0.12 1.12 1.22 1.0 0.57
0.61 0.04 0.03 -0.19 -0.17 -0.22 -0.42 -0.18 -0.42 -0.45 0.11 0.41 0.73 -0.46 -1.29 -0.67 -0.68 -1.17 -1.31 -1.1 0.19 -0.05 1.26 0.73 0.97 -0.34

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.