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Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.32 -0.27 -0.2 -0.26 -0.03 0.21 0.2 0.14 0.13 0.05 -0.25 -0.43 -0.33 0.32 0.03 0.37 0.37 0.66 0.35 0.44 -1.28 0.32 -0.57 -0.61 -0.28 -0.2
-0.12 -0.13 -0.11 -0.18 -0.42 -0.44 -0.01 0.08 -0.14 -0.28 -0.52 -0.59 -0.15 0.08 0.39 0.46 0.55 1.04 0.97 0.68 -1.6 -1.17 -0.44 -0.86 -0.27 0.16
-0.8 -0.39 -0.4 -0.49 -0.14 0.05 0.07 -0.26 -0.24 -0.1 -0.61 -0.87 -1.12 0.23 0.52 0.26 0.42 1.03 1.08 0.74 -1.46 -0.65 -0.21 -0.19 -0.23 0.43
-0.77 -0.12 0.09 0.11 -0.07 -0.38 0.19 0.16 -0.13 0.12 -0.01 0.19 -0.54 0.22 0.73 0.31 0.3 0.96 0.65 0.3 -3.13 -1.19 -1.19 -0.58 -0.19 -0.06
-0.59 0.06 0.05 0.05 0.41 0.42 0.22 -0.04 -0.63 -0.45 -0.74 -0.86 -0.62 -0.08 0.63 0.05 0.52 0.99 0.98 0.68 -1.26 -0.51 -1.44 -0.88 -0.49 -0.02
-0.55 -0.26 -0.38 -0.33 -0.14 -0.06 0.09 -0.13 -0.17 -0.04 -0.35 -0.48 -0.68 0.48 0.86 0.54 0.16 1.16 0.94 0.37 -1.73 -1.38 -0.84 -0.16 -0.71 0.13
-0.99 -0.23 -0.44 0.49 0.38 0.14 0.5 0.69 0.18 0.77 0.45 -0.68 -1.66 -1.01 -0.53 1.22 0.09 0.69 -0.22 -0.16 -4.5 -0.36 -0.22 -1.45 0.07 -0.18
-0.97 -0.88 -0.53 -0.83 -0.9 -0.58 -0.19 -0.46 -0.14 -0.08 -0.19 -0.17 -0.8 1.18 0.9 0.79 0.6 0.51 0.82 0.7 -2.59 -1.96 -0.57 0.19 -0.25 0.51
-0.87 -0.22 -0.01 0.03 0.09 -0.02 0.44 0.15 -0.33 -0.28 -0.61 -0.79 -1.16 0.06 0.36 0.53 0.48 1.02 0.98 0.76 -2.14 -0.68 -1.03 -0.64 -0.19 0.06
-0.55 -0.19 0.06 0.05 0.02 0.28 0.29 0.03 0.08 -0.14 -0.26 -0.01 -0.62 0.39 0.45 0.24 0.1 0.56 0.68 0.18 -3.56 -1.07 -0.65 -0.34 -0.11 0.46
-0.29 0.42 0.22 0.06 0.01 -0.29 0.09 0.04 -0.04 0.35 0.07 -0.08 -0.72 -0.07 0.16 -0.28 0.3 1.03 0.7 0.82 -5.71 -2.22 -1.12 -0.85 -0.11 0.19
-0.91 -0.81 -0.24 0.26 0.19 -0.32 0.14 0.24 0.05 0.24 0.23 -0.04 -0.52 -0.74 -0.15 1.07 -0.76 0.83 0.54 -0.24 -2.59 0.32 -0.01 -0.02 -0.12 -0.0
-1.28 -0.56 -0.48 -0.32 0.11 0.33 0.22 -0.07 0.31 0.05 -0.33 -0.56 -1.56 0.72 0.28 0.38 0.34 0.86 0.72 0.01 -1.83 0.11 -0.11 -0.37 -0.17 0.01
-1.07 -0.26 -0.19 -0.08 0.25 0.12 0.06 -0.32 -0.89 -0.38 -0.87 -0.8 -1.25 0.49 0.82 0.58 0.77 0.95 1.03 0.94 -3.46 -1.18 -1.62 -0.6 -0.39 0.44
-0.37 -0.12 -0.19 -0.14 -0.26 -0.06 -0.01 0.06 0.12 0.12 -0.02 -0.04 -0.34 0.18 0.16 0.13 -0.04 0.79 0.73 0.39 -2.77 -1.54 -0.32 0.04 -0.01 0.54
-0.32 -0.36 -0.48 -0.62 -0.11 0.26 0.13 -0.36 -0.04 -0.04 -0.31 -0.42 -0.32 0.58 0.61 0.49 0.29 0.38 0.73 0.42 -2.92 -1.96 -0.43 0.69 -0.5 0.45
0.23 -0.74 -1.42 -1.32 -0.51 -0.08 0.73 0.48 0.05 -0.03 -0.52 -0.67 0.0 0.74 0.43 0.06 0.68 1.19 1.03 0.41 -5.09 -0.36 -1.81 -0.85 -0.5 -0.44
0.78 0.45 -0.04 -0.5 -0.56 -0.46 0.18 0.16 -0.3 -0.09 -0.39 -0.47 0.56 -0.09 0.17 -0.11 0.13 1.13 0.9 0.46 -2.25 -1.79 -1.13 -0.74 -0.18 -0.14
-0.4 -0.17 -0.15 -0.36 -0.35 -0.62 -0.11 -0.31 -0.16 0.09 -0.18 -0.23 -0.61 0.56 0.45 0.55 0.44 0.95 0.71 0.55 -3.03 -1.29 -0.41 0.04 -0.17 0.33
0.02 0.63 0.1 -0.28 -0.53 -0.25 0.01 0.19 0.21 -0.19 -0.34 -0.38 -0.17 0.01 0.29 0.05 0.22 0.73 0.56 0.27 -2.64 -0.6 -0.63 0.21 0.14 -0.15
-0.91 -0.29 -0.23 -0.19 -0.03 -0.01 -0.01 -0.63 -0.25 -0.16 -0.64 -0.71 -1.12 0.28 0.8 0.11 0.46 0.85 1.17 0.55 -2.68 0.18 -1.13 -0.22 0.16 0.25
0.14 -0.01 -0.21 -0.31 -0.14 -0.11 0.34 0.22 -0.0 0.04 -0.28 -0.46 -0.01 0.13 0.54 0.03 0.33 0.96 0.73 0.73 -3.64 -1.58 -0.69 -0.63 -0.4 -0.18
-0.93 -0.41 -0.15 -0.35 -0.32 -0.41 -0.13 -0.26 -0.59 -0.47 -0.64 -0.83 -0.88 0.43 0.54 0.76 -0.0 0.89 0.79 0.29 -1.95 0.35 -0.47 0.16 0.15 0.87
-0.78 -0.37 -0.12 -0.07 -0.05 -0.14 0.06 -0.07 0.01 -0.26 -0.32 -0.55 -1.23 -0.39 -0.45 1.49 0.15 1.16 0.52 0.51 -2.85 -0.87 -0.2 -0.23 0.07 0.25
-0.48 -0.31 -0.24 -0.29 -0.1 -0.25 0.15 -0.13 -0.18 -0.11 -0.47 -0.39 -0.59 0.28 0.52 0.2 0.38 0.77 0.61 0.3 -1.85 -0.04 -0.13 -0.08 0.17 0.33
-1.21 -0.32 -0.01 -0.06 0.19 0.32 -0.08 -0.42 -0.09 -0.06 -0.24 -0.36 -1.19 0.35 0.48 0.7 0.23 0.55 0.64 0.16 -2.16 0.15 -0.89 -0.14 0.14 0.35
-0.48 -0.29 -0.2 -0.35 -0.69 -1.07 -0.1 -0.23 -0.18 0.15 -0.02 -0.14 -0.56 0.88 0.65 0.66 0.31 0.79 0.63 0.41 -2.68 -1.62 -1.05 0.01 -0.1 0.69
-0.52 -0.16 -0.13 -0.3 -0.42 -0.17 -0.03 -0.28 -0.16 -0.06 -0.26 -0.17 -0.66 0.7 0.86 0.48 0.3 0.62 0.68 0.22 -2.48 -1.51 -0.5 -0.16 0.05 0.57
-2.2 -0.68 -0.45 -0.27 0.04 0.47 0.37 0.17 0.1 -0.28 -0.28 -0.27 -2.38 0.59 0.81 0.6 0.36 0.74 0.5 0.56 -2.66 -1.41 -0.35 -0.28 -0.16 0.44
-0.13 -0.12 -0.25 -0.13 -0.12 0.05 0.33 0.32 0.18 0.18 -0.31 -0.24 -0.23 0.12 0.16 0.2 -0.0 0.8 0.54 0.33 -1.33 -0.9 -0.78 -0.4 -0.11 0.24
-0.16 0.04 0.02 0.11 0.21 -0.02 0.26 0.09 -0.19 -0.12 -0.28 -0.31 -0.19 0.28 0.76 0.42 0.26 0.85 0.64 0.38 -3.34 -1.19 -0.82 -0.9 -0.72 -0.1
-0.2 -0.1 -0.17 -0.23 0.03 0.17 -0.16 -0.38 -0.69 -0.71 -0.98 -0.99 -0.22 0.75 0.94 1.09 0.38 1.07 0.88 0.02 -2.75 -0.1 -1.54 -0.93 -0.47 -0.16
-0.62 -0.37 -0.19 -0.27 -0.24 -0.19 -0.02 -0.29 -0.37 -0.09 -0.37 -0.46 -0.62 0.43 0.51 1.12 0.21 0.49 0.6 0.17 -1.63 0.26 -0.66 -0.16 0.08 0.27
-2.09 -0.76 -0.52 -0.27 0.01 0.52 0.37 0.09 0.05 -0.33 -0.6 -0.82 -1.98 0.5 0.31 0.59 0.11 0.99 0.8 0.36 -1.67 -0.43 -0.13 0.12 -0.1 0.38
-1.03 -0.21 -0.16 -0.24 -0.05 -0.16 0.01 -0.03 0.11 0.09 -0.08 -0.21 -1.22 0.62 0.54 0.19 0.2 0.98 0.85 0.37 -2.23 -0.61 -0.68 -0.43 -0.19 0.29
-1.06 -0.56 -0.2 -0.25 -0.0 0.33 0.17 -0.11 0.02 -0.34 -0.86 -0.56 -1.01 1.01 0.88 0.73 0.3 0.53 0.77 0.35 -1.93 -1.23 -1.3 -0.08 -0.54 0.49
0.29 0.27 0.0 -0.39 -0.37 -0.73 -0.12 0.04 -0.04 -0.17 -0.29 -0.24 -0.02 0.18 0.33 0.36 0.01 0.95 0.83 0.28 -4.17 -0.48 -0.74 -0.34 0.23 0.02
-1.58 -0.52 -0.29 -0.03 0.01 0.31 0.21 0.05 0.03 -0.12 -0.47 -0.69 -1.47 0.36 0.51 0.37 0.23 0.87 0.71 0.29 -1.24 -0.35 -0.65 -0.17 0.02 0.59
0.24 0.4 0.26 -0.04 -0.13 -0.3 0.26 0.24 -0.11 -0.0 -0.29 -0.51 -0.13 -0.37 0.26 -0.38 0.31 1.24 0.81 0.53 -5.45 -0.83 -1.23 -1.07 -0.01 -0.26
-2.46 -0.96 -0.27 -0.05 0.1 0.16 0.11 -0.19 -0.46 -0.19 -0.66 -0.63 -2.43 0.35 0.47 0.19 0.52 0.86 0.96 0.63 -1.94 -0.68 -0.56 -0.4 0.57 0.95
-1.36 -0.21 -0.15 -0.02 0.04 0.3 0.08 -0.15 -0.07 -0.16 -0.47 -0.52 -1.65 0.01 0.22 -0.11 0.28 1.13 1.14 0.4 -2.62 -0.02 -0.86 -0.31 0.21 0.45
-0.02 -0.31 -0.3 -0.37 -0.25 -0.18 -0.11 -0.26 -0.32 -0.34 -0.68 -0.49 0.06 0.78 0.5 1.17 0.28 0.78 0.45 0.4 -1.85 -1.37 -0.55 -0.67 -0.04 0.3
-0.99 -0.04 0.14 0.18 0.35 0.41 0.37 0.19 0.06 -0.1 -0.49 -0.6 -1.06 0.02 0.67 0.53 0.33 1.07 0.95 0.49 -4.49 -1.22 -1.45 -1.2 -0.51 -0.49
-0.35 -0.27 -0.32 -0.36 -0.08 0.07 0.36 -0.01 -0.0 0.05 -0.45 -0.62 -0.63 0.55 0.21 0.16 0.12 0.74 0.56 0.27 -2.35 -0.69 -0.48 0.33 0.3 0.36
-0.56 -0.14 0.04 0.05 0.09 0.04 0.24 0.01 -0.45 -0.36 -0.57 -0.55 -0.56 0.61 0.59 0.72 0.55 0.75 0.72 0.39 -3.59 -1.26 -1.39 -0.7 0.17 0.17
-1.41 0.19 0.46 0.41 0.54 0.63 0.46 0.42 0.37 -0.11 -0.34 -0.58 -1.53 0.03 0.59 0.35 0.15 0.73 0.46 0.28 -3.9 -0.76 -1.41 -1.34 -0.33 -0.58
-0.45 -0.05 -0.0 -0.31 -0.19 -0.06 -0.38 -0.35 -0.85 -0.82 -0.96 -0.96 -0.56 -0.19 1.13 0.44 0.59 1.11 1.16 0.13 -1.09 0.31 -0.84 -0.5 0.1 -0.31
-0.65 -0.22 -0.02 -0.08 0.24 0.4 0.41 0.08 0.15 -0.02 -0.52 -0.69 -0.74 0.44 0.62 0.62 0.49 0.82 0.71 0.65 -4.28 -1.34 -1.85 -0.85 -0.86 0.03
-1.28 0.05 0.29 0.22 0.33 0.34 0.35 0.22 -0.01 -0.17 -0.51 -0.71 -1.57 0.22 0.71 0.38 0.18 1.15 0.71 0.27 -3.27 -1.21 -1.22 -1.01 -0.06 -0.07
-1.03 0.04 0.32 0.16 0.4 0.37 0.43 0.28 0.28 0.1 -0.17 -0.47 -1.11 0.18 0.77 0.36 0.27 0.89 0.53 0.42 -3.97 -1.22 -1.14 -1.3 -0.64 -0.64
-1.74 -0.89 -0.41 0.28 0.56 0.17 0.18 0.2 0.19 0.34 0.33 0.04 -1.41 -0.54 0.22 1.34 -0.41 0.7 0.13 -0.41 -3.18 0.32 -0.0 -0.52 -0.04 -0.74
-1.01 -0.14 -0.08 -0.08 0.17 0.41 0.08 -0.16 -0.12 -0.18 -0.55 -0.72 -1.08 0.03 0.37 0.21 0.31 0.79 0.99 0.65 -1.49 -0.64 -0.29 -0.15 -0.31 0.28
-0.6 -0.21 -0.38 -0.36 -0.33 -0.53 0.08 -0.11 -0.19 -0.07 -0.28 -0.36 -0.78 0.47 0.64 0.1 0.39 1.12 0.98 0.72 -3.44 -1.17 -0.7 -0.27 -0.08 0.48
-0.86 -0.19 -0.17 -0.14 0.13 0.15 0.05 -0.12 -0.13 -0.29 -0.52 -0.78 -1.13 0.34 0.58 0.07 0.19 0.98 0.8 0.37 -1.05 -0.89 -0.01 -0.41 0.09 0.43
-0.79 -0.12 -0.25 -0.19 -0.04 0.17 0.09 -0.13 -0.07 -0.2 -0.45 -0.55 -0.94 0.33 0.64 0.42 0.53 0.91 1.11 0.76 -3.87 -2.19 -0.56 -0.63 -0.48 0.39
-0.9 -0.14 -0.14 -0.32 0.11 0.54 0.24 -0.26 -0.03 -0.0 -0.44 -0.62 -0.91 0.5 0.54 0.43 0.21 0.8 0.64 0.38 -2.43 -0.24 -0.65 -0.49 0.01 0.05
-0.19 -0.32 -0.58 -0.46 -0.19 0.27 0.43 0.16 0.14 0.02 -0.38 -0.59 -0.48 0.24 0.45 0.07 0.37 0.75 0.9 0.46 -2.91 -0.38 -0.74 -0.64 0.06 0.15
0.22 0.15 -0.07 -0.56 -0.45 -0.34 0.01 -0.19 -0.56 -0.3 -0.77 -0.77 0.01 0.06 0.51 -0.03 0.34 1.24 1.0 0.52 -3.33 -0.49 -0.7 -0.13 -0.14 0.32
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-1.34 0.05 0.2 0.08 0.52 0.39 0.26 0.06 -0.88 -0.49 -1.07 -1.05 -1.99 0.02 0.71 0.3 0.68 1.13 1.32 1.11 -5.64 -2.52 -2.14 -1.0 -0.68 0.06
-1.64 -0.3 -0.34 -0.33 0.04 0.05 0.26 -0.09 -0.07 0.04 -0.37 -0.51 -2.02 -0.07 0.61 0.06 0.36 1.28 1.11 0.61 -3.56 -0.75 -0.39 -0.1 -0.0 0.11
0.46 0.46 -0.1 -0.57 -0.51 -0.25 0.19 0.12 0.14 0.14 -0.1 -0.13 0.2 0.07 0.17 0.44 0.4 0.85 0.73 0.52 -3.08 -1.78 -1.53 -0.62 -0.42 -0.38
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-0.56 -0.46 -0.49 -0.35 -0.08 -0.38 -0.06 -0.45 -0.24 0.08 -0.03 -0.07 -0.47 0.91 0.77 0.18 0.07 0.83 0.65 0.11 -1.27 -0.34 -0.79 -0.23 0.13 0.27
-0.82 -0.6 -0.24 -0.34 -0.03 0.21 0.14 -0.08 -0.08 -0.21 -0.37 -0.72 -0.8 0.42 0.76 0.39 0.41 0.73 0.67 0.34 -1.48 -0.43 0.1 -0.5 -0.05 0.19
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-0.49 0.02 -0.18 -0.29 -0.01 0.09 -0.06 -0.26 -0.26 -0.34 -0.73 -0.74 -0.64 0.32 0.71 0.35 0.68 1.03 1.11 0.55 -2.8 -0.89 -0.94 -0.14 -0.61 0.09
-0.04 -0.37 -0.65 -0.74 -0.24 0.03 0.23 0.03 -0.21 -0.12 -0.57 -0.59 -0.24 0.4 0.68 0.14 0.57 1.14 0.95 0.29 -3.0 -1.77 -0.54 -0.19 -0.1 0.29
-1.59 0.05 0.3 0.13 0.46 0.63 0.28 0.13 0.15 -0.08 -0.26 -0.59 -1.65 0.07 0.78 0.36 0.33 0.76 0.67 0.45 -4.05 -0.44 -1.49 -0.91 -0.19 -0.55
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-1.45 -0.33 -0.06 -0.17 0.04 0.03 -0.04 -0.31 -0.48 -0.31 -0.73 -0.9 -1.5 0.66 0.88 0.73 0.5 0.91 0.68 0.26 -1.73 0.32 -0.51 -0.48 0.0 -0.01
0.01 0.15 0.07 -0.02 0.09 0.24 0.41 0.22 0.04 -0.01 -0.31 -0.39 -0.07 0.16 0.45 0.29 0.35 0.94 0.59 0.31 -3.9 -1.31 -1.09 -0.79 -0.72 -0.33
-0.7 -0.27 -0.16 -0.12 0.21 0.47 0.33 0.02 0.04 -0.17 -0.52 -0.64 -0.85 0.12 0.35 0.46 0.48 0.94 0.9 0.52 -1.31 -0.83 -0.89 -1.11 -0.22 -0.11
0.61 0.73 0.34 -0.22 -0.79 -1.06 -0.13 0.02 -0.22 0.02 -0.21 -0.3 0.3 -0.29 0.15 -0.11 0.3 1.11 0.74 0.49 -1.95 -1.28 -1.33 -0.75 0.06 -0.14
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-1.8 -0.56 -0.22 -0.51 -0.31 -0.56 -0.12 -0.29 -0.21 0.36 -0.37 -0.5 -2.56 -0.12 0.77 0.4 0.37 1.43 1.49 0.61 -3.06 -1.69 -0.68 -0.22 0.05 0.3
-0.97 -0.24 -0.13 -0.08 0.29 0.5 0.26 -0.05 0.02 -0.05 -0.52 -0.82 -1.5 0.16 0.37 -0.01 0.4 0.86 1.42 0.63 -5.12 -0.74 -1.5 -0.48 -0.24 0.13
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-0.31 -0.08 -0.04 -0.14 -0.02 0.12 0.1 -0.24 -0.58 -0.55 -0.84 -0.71 -0.37 0.42 0.63 0.39 0.84 0.79 0.96 0.18 -2.72 0.1 -1.04 -0.73 0.1 -0.14
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-0.32 0.08 0.09 0.05 0.22 0.2 0.31 0.16 -0.13 -0.0 -0.34 -0.55 -0.59 -0.02 0.35 0.08 0.26 0.95 0.76 0.64 -4.23 -1.72 -0.81 -0.56 -0.02 0.07
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-2.28 -0.63 -0.31 -0.15 -0.08 0.07 0.3 0.04 -0.16 -0.26 -0.56 -0.44 -2.14 0.31 0.62 0.52 0.53 1.13 1.06 0.67 -3.95 -0.73 -0.49 -0.49 0.07 0.21
0.91 0.64 -0.16 -0.66 -1.45 -1.32 0.51 0.55 -0.32 0.4 0.1 -0.56 0.84 -0.61 0.1 -0.77 0.11 1.25 1.11 0.23 -5.06 -1.21 -2.93 -1.94 0.16 -0.61

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.