Heatmap: Cluster_216 (HCCA cluster)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots (apex), 7 DAG
Roots (differentation zone), 4 DAP
Roots (elongation zone), 4 DAP
Roots (meristematic zone), 4 DAP
Roots (stele cells), 7 DAS
Roots (tip)
Leaves (rosette), 21 DAG
Leaves (rosette), 29 DAG
Leaves (rosette), 35 DAG
Leaves (rosette), 42 DAG
Leaves (rosette), 57 DAG
Epidermis cells
Mature guard cells
Stems (internode)
Stems (internode), senescent
Meristem (M1-3), 7-9 DAG
Meristem (M4-6), 1-12 DAG
Meristem (M7-1), 13-16 DAG
Axis of the inflorescence
Pedicel
Flowers (receptacles)
Flowers (floral buds)
Flowers (sepals)
Flowers (petals)
Flowers (stamen filaments)
Flowers (anthers)
Flowers (carpels)
Flowers (ovules)
Stigmatic tissues
Pollen
Siliques
Siliques, senescent
Pods of Siliques
Pods of Siliques, senescent
Embryo
Endosperm
Seeds, dry
Seeds, from senescent siliques
Seeds, young
Seeds, germinating
Seedlings, 5 DAG
Seedlings, 11 DAG
Seedlings, 14 DAG
Seedlings, etiolated
AT1G02980 (CUL2)
-5.71 -3.67 -7.27 -7.55 - - - - - - - - -4.74 - -8.03 - -11.56 -9.41 - - -5.06 -5.51 - - - 0.25 -5.86 -5.32 - -4.31 0.49 -6.76 -0.61 - -2.11 5.32 -6.01 - -2.53 -6.06 - - -7.38 -6.17
- - - - - - - - - - - - - - - - - -6.07 - - -4.36 -4.69 - - - -1.92 -5.64 -5.73 - - 0.09 - -1.84 - -3.56 5.39 - - -1.68 - -6.51 - - -
- -6.09 - -7.38 - - - - -9.6 -6.74 -6.93 - - - -4.86 - -9.49 - -7.96 - -3.03 -3.61 -8.96 - - -5.97 -3.28 0.14 -6.56 - 0.77 -4.44 -0.61 -1.11 -2.84 5.29 -6.84 -8.52 -1.46 -10.12 - - -7.21 -9.6
AT1G17770 (SDG17)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -3.08 - - - - - - - - - 1.54 - -0.28 - -2.2 5.27 - - 0.32 - - - - -
AT1G19950 (HVA22H)
-0.47 -1.86 -0.96 0.74 - -0.0 -1.19 -3.99 -7.17 -6.83 -6.67 -3.69 -4.49 0.55 -3.85 -0.32 -0.27 0.22 0.61 -0.03 -0.87 -0.82 -0.52 0.04 -0.59 -2.57 -0.0 0.41 -0.64 -6.71 0.17 -4.24 -0.44 -4.85 0.49 4.22 -4.7 -4.5 0.15 -1.38 -1.04 -1.08 -0.46 -1.39
-5.27 -5.5 - -4.79 - - - - - - - -4.7 - -6.35 -3.53 -6.66 -5.58 -7.67 - -6.81 -3.63 - -5.79 -3.66 -4.47 -5.37 -5.2 - - - -0.91 - -2.01 - -2.21 5.4 -6.84 - -2.25 -6.97 -6.16 - -5.04 -8.38
- - - -4.16 - -3.53 - - - - - - - - - - - - - - -5.5 -1.71 -5.65 - -5.23 2.28 -2.77 -1.04 - - 0.74 - 0.15 - -1.99 5.1 -5.21 - -0.79 -2.73 - - -5.0 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.33 - -1.24 - - 5.35 - - -2.11 - - - - -
- - - - - - - - - - -4.46 - - - - - - - - - - - - - - -1.17 - - - - 2.32 - 0.46 - -1.49 5.2 - - - - - - - -
-2.4 -0.4 -2.81 -4.32 - -5.01 -0.44 -2.41 -0.9 -1.15 -0.8 -3.09 - -2.3 -1.24 -1.44 -1.1 -1.35 -0.57 -0.9 -1.24 0.59 -0.4 -2.23 -1.86 -1.83 -0.25 -0.63 -6.74 - 0.74 -2.49 0.29 -0.3 1.09 4.48 -5.95 -4.47 -1.27 -1.31 -1.73 0.53 -0.04 -2.08
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -5.17 - - - - - - - 0.83 - 0.06 -3.73 -2.2 5.35 -4.64 - -5.95 -4.63 - - - -5.2
- - - - - - - - - - - - - - - - -9.12 -8.67 - - -5.87 - - - - -3.92 - - - - 1.4 - 0.05 - -4.24 5.32 - - -4.05 - - - - -3.85
AT1G65300 (PHE2)
-5.6 - -7.84 - - - - -8.39 -7.95 - - - - -7.71 - - - -5.72 -5.67 - -2.45 -5.67 -7.66 - - -9.27 -7.04 -6.7 - - 0.26 - -1.44 - - 5.37 - - -1.38 -8.34 - -3.54 -2.5 -2.67
AT1G65330 (PHE1)
-2.46 -7.22 -3.8 - - -5.93 -9.55 -1.66 -8.95 -9.81 -10.69 - - -2.0 -5.88 -7.96 -10.7 -9.76 - - -3.0 - -8.1 - - -7.71 -7.79 -9.09 -7.63 -5.68 -0.61 -3.06 -2.3 0.92 -7.93 5.3 - -8.1 -1.6 -6.61 -7.61 -4.64 -4.06 -2.37
AT1G65640 (DegP4)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.24 - -4.92 - -1.72 5.42 - - -4.4 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -6.59 -6.53 - - -6.41 - - - - 1.78 -6.63 - - -5.05 0.61 - -0.82 - -2.46 5.25 - - -2.87 -6.72 - - - -
-4.66 -3.46 - - - - - - - - - - - - - -3.31 - - - - -6.8 - -5.75 - - 0.67 -7.52 - - - -3.13 -6.42 -4.66 - - 5.39 - - -5.13 -7.99 - - - -7.22
- - - -2.63 - - - - - -6.22 - - - - -1.5 - - - - - - - -5.7 - -3.55 2.16 -3.81 -2.21 - -4.64 -2.9 -3.43 -5.82 -0.03 - 5.21 -5.26 - -2.04 -6.95 -4.0 - - -
- -7.17 - -5.89 - -7.94 - - - - - - - -8.03 - -9.66 -8.59 -8.84 -7.99 - -2.5 -4.11 -7.4 -5.94 -4.8 -7.93 -2.7 -0.02 -5.54 - 0.12 -8.27 -2.13 -8.2 -2.6 5.3 - - 0.66 -7.48 - - - -4.57
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.53 - - - - 0.17 - -1.9 - - 5.41 - - -5.73 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.58 - - - - 1.1 - 0.08 - -2.17 5.29 - - -6.22 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -5.4 - - - - -4.48 - - - - 0.81 - -0.5 - -2.16 5.36 - - -4.7 -5.57 - - - -5.68
- - -4.34 - - -5.07 - - - - - - - - - -3.81 -2.9 -0.48 - - -2.13 -4.21 - -5.31 - -4.25 -5.4 -3.67 - - 1.51 - 0.33 - -2.5 5.07 - - -0.92 1.82 -4.09 - -2.18 -1.63
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.3 -2.35 -7.16 - - -8.65 -1.1 0.09 - - -0.24 - -3.06 -5.32 - 5.08 - - 2.73 - -7.87 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -3.39 - - - - - - - - - 1.66 - -0.66 - - 5.26 - - 0.81 - - - - -
-2.38 - - - - - -4.91 - - -4.17 -5.15 -1.78 - - -1.94 - -6.58 -3.95 - - - -1.84 -3.92 - - 1.53 -2.72 -4.45 -4.52 -3.34 1.71 - 0.72 -2.78 -1.97 5.07 -2.93 -5.01 -2.45 -3.62 - - -2.71 -2.94
-1.84 - - - -3.87 - - -6.66 - - - - - -5.07 -4.22 - - -7.33 - - -2.93 -4.03 -6.06 - - -2.42 -4.29 -5.07 - - 2.17 - 1.16 - -1.73 5.13 -2.21 -2.88 -0.64 -6.57 - - -5.32 -7.11
- 2.03 -1.44 - - - -2.34 -4.58 -3.38 -2.91 -3.26 -2.67 -2.8 -2.31 -0.62 - -4.36 - -3.89 -1.72 -5.09 - -2.29 -2.95 - -2.69 -2.25 -1.57 -1.95 - -2.43 - -1.62 -2.45 -3.73 5.07 -4.36 - -2.08 -3.31 -2.85 -1.9 -1.56 -1.02
AT2G23990 (ENODL11)
- - - - - - - - - - -10.77 - - - -8.87 - -12.06 - - - -0.6 -3.69 -9.93 - - -7.13 -2.19 0.56 -9.03 - 0.26 -9.19 -1.73 -5.95 -6.81 5.19 - - 1.84 -11.57 - - -9.22 -6.84
AT2G25700 (SK3)
- - -7.95 - - - - - - -9.32 - - - - -7.79 - -9.69 -9.24 -7.89 - -3.05 -5.27 - - - -1.37 -5.99 -4.08 -7.04 -4.79 0.63 - -0.81 - -3.4 5.34 - - -0.98 - - - - -4.82
AT2G27120 (TIL2)
-4.23 - -4.35 - 2.97 - - - - - - -4.19 - - - - -4.08 -4.98 -4.28 -3.26 -1.13 0.07 - - - 2.07 -0.21 1.47 - 1.81 -0.28 - -1.2 - -2.12 4.21 - - 1.23 -2.26 - - - -1.56
AT2G31760 (ARI10)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.76 -4.71 -4.88 - - 1.19 - -0.19 - -2.39 5.08 - - -6.21 - - - - -
AT2G31780 (ARI11)
- - - - - - - - - - - - -0.35 - - - - - - - -4.53 0.1 - - - 0.99 -6.27 - - - 1.17 - -0.06 - -4.67 5.19 - - -1.93 - - - - -
-3.93 2.33 -3.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.89 -3.0 - - - -0.74 -7.41 - - 0.48 1.53 - 0.12 - -1.87 4.95 - - 0.25 -5.7 -4.82 - - -3.37
-0.99 0.99 0.82 - - -1.55 - - - - - - - -4.6 - -5.25 - - - - -4.36 -4.59 - - - -4.82 -7.14 - - -5.54 0.41 - -1.21 - - 5.11 - - -2.42 0.54 -4.9 - -1.78 -0.24
- - -6.44 - - -4.29 - - - -7.42 -8.11 -7.21 - -7.28 -1.97 -6.3 -4.61 -3.29 - - - - -7.26 - - -2.75 -5.17 - - -1.01 -1.11 - -2.72 -4.86 -5.14 5.39 - - -4.34 -4.31 - -3.31 - -
- - - - - - - -4.34 -5.46 -6.1 -4.7 - - - - -7.29 - - - - -2.39 -3.64 -4.13 - - 0.56 -4.54 -1.21 - - 1.41 -1.99 -0.35 1.31 -4.51 5.09 - - -0.26 -6.83 -2.03 -3.68 -4.93 -
- - -4.22 - - -4.04 - -5.22 - - - - - - - -5.18 -4.86 -6.31 - -4.6 -3.2 - - - - - -4.75 -1.98 - - 0.03 - -2.19 -4.3 - 5.38 - - -1.38 - - - - -6.19
2.48 0.13 2.72 -0.89 0.47 1.44 - - - - - - - -8.16 - -4.56 -8.55 -10.34 - - -6.34 -7.15 - -7.31 -8.67 -5.09 -7.63 -8.19 -7.44 - -1.98 -2.85 -3.46 -8.33 -8.02 4.54 -4.65 -3.23 -4.21 0.14 -3.01 - -1.72 -0.93
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.84 - - - - -6.72 - - - - 0.18 - -1.07 - 0.3 5.35 - - -1.87 - - - - -6.81
- - - - - - -6.27 - - - - - - - - - - - - - -5.77 - - - - - -7.89 - - - 1.49 - -0.49 - -5.66 5.33 - - -1.8 - - - - -
- - - - - - - -7.46 - - -6.98 - - - - - - - - - -5.16 - - - - -5.14 - - -4.54 - 1.24 - 0.29 - -1.9 5.32 - - -3.65 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -7.37 - - - -2.76 -2.25 -5.19 - - 2.46 -5.53 - - -0.84 1.08 -4.5 -1.51 -4.43 -3.12 5.08 -1.95 - -0.7 -4.08 - - - -
- - - - - - - - - - - -5.23 - - - - - - - -5.51 - 0.69 - - - 0.09 -7.44 - - -0.74 -1.0 - -2.53 -6.47 -6.16 5.32 - - -5.1 -6.95 - -5.33 -5.57 -7.22
- - -6.39 - - -7.12 -5.13 1.67 -3.37 -6.68 -7.9 - - -2.16 -6.15 -8.86 -3.93 - - -6.69 -4.38 -1.9 - - - - -5.39 -3.08 -6.51 - -1.65 - -3.02 - - 5.18 - - -3.1 - -0.87 -1.45 -0.5 0.54
-3.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.79 - - - - - - - - - 1.31 - -0.18 - -1.83 5.32 - - -1.56 - - - - -5.62
AT4G13380 (MEE56)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -8.13 - - - -9.93 - - - 1.2 - 0.1 - -4.38 5.34 - - -6.46 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - -3.64 - - - - - - - 3.25 -3.21 - - - 0.37 - -3.55 - - 5.04 - - - - - - - -
-3.21 -2.73 -5.67 -3.44 - -6.49 - - - - - - - - - - - -7.87 - - -2.29 - - - - -6.29 -8.98 -5.61 - - -0.43 - -2.47 - - 5.38 - - -0.62 -5.99 - - -5.86 -4.85
- - - - - - - -3.95 -3.46 -2.62 -2.84 - - - -5.92 - - - - - - - - - - - - - - - -1.01 -2.9 -2.03 - -4.02 5.39 -2.23 -1.83 -8.14 -2.78 -4.56 - -6.02 -7.41
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.46 - - - - - -5.28 -3.86 - - 0.59 - -1.9 - - 5.37 - - -0.34 - - - - -
AT4G22115 (SCRL14)
-8.18 - - - - - - - - - - - - -8.26 - - -10.29 - - - -6.33 -6.03 -7.01 - - - -5.9 -5.61 -7.44 - 1.59 - -0.07 - -1.48 5.3 - - -2.09 - - - - -8.58
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -5.93 - - -8.0 - - - -4.86 1.1 - 0.26 - -1.55 5.33 - - -4.45 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.55 - - - - 0.57 - -0.16 - -1.3 5.36 - -4.93 -8.82 -4.41 - - - -6.92
AT4G24650 (IPT4)
- - - - - - - - - -5.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.59 -0.99 - -2.96 - - 5.43 - - -5.11 - - - - -4.41
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.66 - - - - - - - - - -0.49 - -3.94 - - 5.41 - - -0.82 - - - - -
- - - - - - -6.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.21 - -2.14 - - 5.41 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.05 - - - - - -7.34 - - - 1.14 - -1.56 - - 5.24 - - 1.45 - - - - -6.59
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -5.67 -3.2 - - - 2.91 -4.61 -3.22 - - 1.59 - 0.63 - -2.48 4.95 - - -0.76 - - - - -
- - - -2.0 - -3.35 - - - - - - - - - - - - - - -3.18 -0.41 - - -3.38 2.7 -3.21 -0.99 - 1.37 0.75 - -0.68 - -2.41 4.91 - - -1.16 - - - - -
AT5G05260 (CYP79A2)
- - -3.98 - - -7.8 - - - - - - -5.65 - - - - - - - -7.14 - -8.04 - - - -6.25 - -4.3 - -1.64 - -3.21 - -4.88 5.44 - - -3.95 -7.84 - - - -8.82
-1.81 -0.86 -2.36 -1.05 - -4.77 -2.52 - -7.14 -5.92 -7.14 - - - - 0.39 0.76 1.31 -1.86 -2.67 -1.0 -2.87 -5.56 - - -2.77 -1.66 0.32 - - 0.27 - -1.07 - -2.16 4.92 - - 0.59 -4.49 -3.06 -4.5 -3.57 -5.71
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.65 - - - - -6.54 -4.08 -3.4 - - 0.86 - -1.86 - - 5.3 - - 0.98 - - - - -7.58
- - - - - - - - - - - - - - -2.82 -3.81 - - - - -2.65 - - - - -2.64 -6.73 - - -4.17 1.65 - -0.43 -1.54 - 5.25 - - 0.09 - - - - -4.63
-3.78 -2.61 -6.28 -5.6 - -2.29 -5.65 -8.77 - - - - - -6.17 - -4.47 -6.28 -6.11 - -7.62 -3.34 -2.83 - -7.24 -5.94 - -2.64 -1.12 - - -0.31 - -1.36 - -1.66 5.34 - - -1.36 -7.84 -7.2 - -5.85 -5.08
- - - - - - -5.44 -5.22 -6.44 -7.94 -8.0 - - 0.5 -1.22 0.75 0.06 -0.52 -1.06 -1.54 -0.6 -2.35 -5.49 -6.9 -4.75 -6.64 -3.87 - -6.45 - -0.18 -6.93 -2.08 -5.69 - 5.1 - -8.44 0.11 -8.41 -5.19 -2.03 -3.86 -4.65
AT5G39700 (MYB89)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.21 - -1.43 - - 5.34 - - -0.52 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -8.93 - - - 1.56 - 0.62 - -5.29 5.3 - - -3.02 - - - - -
AT5G43090 (PUM13)
- - - - - - - - - - - -4.28 - - - - - - - - -6.13 -3.34 - - - 0.33 -1.7 0.88 -4.63 - 1.51 - 0.54 - -0.12 5.12 - - -1.4 - - - - -5.18
- - - - - - - - - - - - - - - - -8.38 - - - -5.15 - - - - - -8.68 - - - 1.08 - -0.28 - -5.14 5.34 - - -1.25 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.37 - - - - -3.14 - - - - 1.37 - -1.25 - - 5.31 - - -0.14 - - - - -
- - - - - -1.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.6 -2.7 - - - - -0.59 - - - 5.29 - - -1.11 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - -8.88 - - -11.98 - -8.9 - -5.48 - -9.9 - - -10.37 -10.71 -7.9 -8.96 - 1.01 - -1.05 - -8.74 5.36 - - -1.84 -10.02 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.46 - - - - - - - -5.02
-2.78 -3.7 -4.71 -3.26 - -4.14 -6.61 - -5.87 -6.32 -5.91 - - -6.14 -5.18 -4.31 -4.49 -4.16 -4.57 -6.6 -4.1 -1.54 - - -2.91 1.28 -3.46 -3.58 - -1.08 -0.38 -1.75 -1.44 1.14 -2.67 5.14 -1.93 - -2.08 -5.92 -6.95 - - -8.02
- - - - - - - - - - - - - - -4.58 - - - - - 0.12 - - - - - -5.4 -4.42 - - 1.23 - -1.33 - - 5.21 - - 1.63 - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.