Heatmap: Cluster_166 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.02 0.09 -0.06 -0.09 0.09 0.1 0.69 0.64 0.19 0.25 0.03 -0.45 0.65 -0.54 -1.25 -1.12 -0.54 0.47 0.02 -0.2 -4.16 -1.2 -0.49 0.05 0.15 0.23
0.89 0.7 0.09 0.05 -0.04 -0.25 -0.29 -0.31 -0.07 0.06 0.33 0.43 0.3 -1.22 -0.98 -1.67 -0.44 0.08 -0.17 -0.08 -2.37 0.43 0.26 0.5 0.17 0.02
0.99 0.81 0.73 0.5 -0.2 -0.26 0.27 0.87 0.52 0.53 0.38 0.24 0.51 -2.01 -0.86 -1.95 -0.44 0.16 0.12 0.37 -7.86 -3.05 -2.48 -1.48 -0.11 -0.37
0.85 0.58 0.23 -0.39 -0.69 -1.31 -0.41 -0.09 -0.38 -0.29 0.21 0.56 0.56 -0.53 -0.53 -0.99 -0.16 0.61 -0.19 0.25 -5.19 -0.68 -0.55 0.78 0.7 0.4
0.85 0.32 0.53 0.38 0.57 0.2 0.76 0.13 -0.84 0.32 0.01 -0.5 1.04 -0.85 -1.03 -1.12 -0.84 0.64 0.34 0.21 - -1.82 -1.21 -1.64 0.32 -0.19
0.83 0.92 0.75 0.33 -0.25 -0.32 -0.32 0.13 0.07 0.19 -0.11 0.26 0.72 -0.46 0.1 -0.23 -0.06 -0.02 0.38 0.09 -4.05 -1.01 -1.37 -0.8 -0.54 -0.46
0.35 0.54 0.52 0.37 0.23 -0.23 0.01 0.23 0.1 -0.17 -0.05 -0.16 0.26 -0.65 -0.02 -0.7 -0.41 0.43 0.17 0.0 -2.03 0.37 -0.97 -0.32 -0.1 0.09
1.7 1.54 0.58 -0.31 -2.33 -3.79 -1.86 -0.66 -0.86 -0.02 0.4 0.82 1.32 -0.11 -1.08 -0.18 0.04 -0.71 -0.56 -1.0 -5.12 -1.24 -1.9 -0.86 0.24 0.77
1.64 1.62 0.68 -0.48 -2.84 -4.05 -2.45 -1.01 -1.01 -0.1 0.62 0.79 1.18 -0.1 -1.29 -0.26 -0.16 -0.85 -0.73 -0.68 -3.81 -0.99 -2.87 0.11 0.22 0.88
1.46 1.42 -0.11 -0.48 -5.02 -3.24 -2.06 -1.23 -0.98 -1.2 0.35 0.13 1.65 -0.43 -1.66 -0.38 0.13 -0.95 -0.4 -1.15 -3.6 -0.09 -1.26 -1.13 1.43 1.28
0.7 0.14 -0.14 -0.36 -0.53 -0.76 -0.08 0.1 0.19 0.02 0.17 0.51 0.86 -0.51 -0.5 -0.01 -0.47 0.19 -0.19 -0.26 -2.31 -1.14 -0.06 0.45 0.8 0.07
1.34 1.12 0.53 0.28 -0.38 -0.16 -0.01 0.46 -0.46 -0.24 0.01 -0.13 0.65 -0.94 -1.03 -0.67 -0.48 -0.17 0.43 -0.06 -4.35 -2.13 0.04 -1.28 0.39 -0.08
0.9 0.39 0.84 0.45 -0.23 -0.18 0.67 1.28 0.91 0.52 0.24 -0.29 0.2 -1.88 -1.17 -1.48 -0.64 0.35 0.26 0.62 -6.05 -2.5 -3.67 -3.0 -0.71 -0.47
0.98 0.51 0.25 -0.17 -0.14 0.17 0.57 0.68 0.61 0.47 0.54 0.68 0.89 -1.36 -1.0 -1.43 -0.66 0.19 0.16 -0.22 -5.17 -1.79 -1.08 -0.47 -0.57 -1.36
0.87 0.97 0.87 0.59 0.17 -0.44 -0.52 -0.35 -0.23 -0.03 0.32 0.68 0.76 -0.64 -1.43 -0.82 -0.46 -0.88 -1.1 -0.3 -3.22 0.16 -1.23 0.46 0.16 -0.14
0.03 -0.17 -0.56 -0.29 -0.32 -0.77 0.2 0.55 1.02 0.67 0.59 0.34 -0.19 -0.47 -0.43 -0.63 -0.57 0.61 -0.35 0.11 -3.33 -1.15 0.29 0.07 0.25 0.2
0.04 0.32 0.4 0.17 0.16 0.19 -0.07 -0.06 0.06 -0.17 -0.24 -0.08 -0.08 -0.2 0.29 0.12 0.21 -0.1 0.19 0.43 -2.29 -0.78 -0.14 0.33 -0.62 0.1
0.55 1.1 0.87 0.37 0.2 0.36 0.21 0.16 -0.0 -0.18 -0.35 -0.13 0.68 -1.48 -0.22 -0.98 0.62 0.49 0.32 0.54 -2.67 -2.99 -0.78 -1.87 -0.92 -1.48
1.96 1.53 0.35 -1.13 -2.46 -2.15 -0.53 0.19 -0.57 -0.78 -0.7 -0.7 1.36 -1.4 -0.35 -1.22 -0.45 0.72 0.56 0.24 -7.64 -0.84 -2.83 -2.19 0.99 -0.57
0.59 -0.2 -0.87 -0.79 -0.38 -0.38 0.07 0.13 0.19 0.41 0.4 0.43 0.56 -0.29 -0.42 -0.44 -0.16 0.37 0.32 0.05 -3.69 -0.35 0.13 0.29 0.06 0.26
0.97 -0.07 -0.75 -0.53 -0.61 -0.74 0.08 0.61 0.25 0.5 0.68 0.66 0.8 -0.83 -0.98 -1.0 -0.8 0.23 -0.48 -0.25 -4.24 -0.6 -0.21 0.17 0.78 0.2
0.55 0.32 -0.06 -0.38 -0.73 -1.17 -0.18 0.17 0.47 0.56 0.58 0.21 0.4 -0.03 -0.01 -0.03 -0.43 0.22 -0.35 -0.81 -1.87 -1.84 -0.14 0.32 0.72 0.13
-0.44 -0.6 -0.72 -0.3 -0.28 -0.05 0.05 0.04 0.47 0.67 0.57 0.79 0.0 -0.69 -0.69 -0.38 -0.0 0.43 0.34 0.44 -1.95 -0.98 0.0 -0.45 0.59 0.2
1.08 0.1 -1.12 -0.39 -0.11 0.28 0.42 0.5 0.41 0.53 0.58 0.43 0.66 -0.9 -1.3 -1.12 -1.2 0.01 -0.19 -0.04 -2.39 -0.74 0.08 0.06 -0.05 -0.05
0.59 0.64 0.44 0.54 0.43 0.33 0.53 0.34 0.01 0.01 0.21 -0.02 0.51 -0.36 -0.23 -0.29 -0.17 -0.07 0.08 0.33 -3.76 -1.41 -1.82 -0.95 -0.5 -0.58
0.42 0.74 0.44 0.24 -0.28 -0.7 -0.53 -0.24 -0.01 0.07 0.3 0.43 0.25 -0.27 -0.44 0.51 -0.25 -0.1 -0.13 -0.25 -1.71 0.3 -0.09 0.15 -0.29 -0.41
1.2 0.13 -0.45 -0.92 -1.36 -1.1 0.57 0.16 0.15 -0.3 0.15 0.51 0.96 -0.37 -0.89 -0.47 -0.51 0.36 -0.44 -0.1 -3.09 -1.8 -0.11 0.17 1.03 0.39
0.49 0.25 0.38 0.45 0.1 -0.44 0.01 0.27 -0.06 0.47 0.55 0.65 0.57 -1.33 -1.23 -1.82 -0.59 -0.18 -0.41 0.1 -4.31 -0.49 0.02 -0.18 0.44 0.45
1.02 0.26 0.48 0.03 0.26 -0.28 0.07 0.34 0.23 -0.01 0.31 0.12 1.07 -0.8 -1.1 -0.6 -0.76 0.39 -0.22 0.24 - -1.73 -0.09 -3.61 0.7 -0.21
1.0 0.8 0.09 -0.68 -1.53 -1.55 -0.3 0.24 0.04 0.13 0.42 0.65 0.78 -0.73 -0.82 -0.9 -0.24 -0.16 -0.69 -0.36 -2.02 -0.22 0.15 -0.02 1.0 0.13
0.48 1.0 0.19 -0.12 -0.27 -0.46 -0.56 -0.62 -0.26 -0.13 -0.18 -0.35 -0.23 -1.02 -0.58 -1.38 -0.22 0.37 -0.0 -0.1 -1.84 1.16 0.76 0.25 0.55 -0.16
0.95 0.24 -0.08 0.23 -0.01 -0.3 0.24 0.42 0.08 0.17 0.08 -0.11 0.87 -0.51 -0.38 -0.61 -0.59 0.17 -0.32 -0.29 -2.55 0.12 -0.71 -0.32 0.27 0.07
0.53 0.87 0.45 0.02 -0.61 -1.04 -0.78 -0.31 0.0 0.2 0.58 0.78 -0.08 -0.95 -0.77 -1.07 -0.25 -0.04 -0.38 -0.2 -1.32 0.5 0.12 0.86 -0.04 -0.35
0.92 0.4 0.03 -0.15 -0.24 -0.36 -0.0 0.06 -0.22 -0.32 -0.42 -0.42 0.69 -0.17 0.12 -0.2 0.05 0.57 0.22 0.07 -1.23 -0.08 -0.15 -0.74 0.27 -0.34
1.22 1.1 0.8 0.55 -0.11 -0.71 -0.36 0.08 -0.37 -0.19 0.19 0.42 1.04 -0.76 -1.48 -0.69 -0.74 -0.65 -1.13 -0.46 -2.65 -0.79 -0.21 -0.36 0.48 0.0
0.73 0.71 0.68 0.23 0.02 -0.3 -0.53 -0.5 -0.28 0.14 0.2 0.63 0.86 -0.58 -0.31 -0.09 0.21 -0.66 -0.23 0.3 -1.63 -1.14 -0.34 0.28 -1.27 -0.35
0.77 0.44 0.66 0.38 -0.29 -0.42 0.06 0.57 0.17 0.18 0.3 0.28 0.8 -0.54 -0.65 -0.73 -0.26 -0.0 -0.23 0.34 -3.97 -2.43 -1.33 -0.47 0.02 0.34
0.8 -0.16 -0.82 -1.46 -2.07 -1.11 0.42 0.66 0.48 0.42 0.21 0.23 0.96 -0.49 -0.2 -0.65 0.54 0.25 0.14 -0.05 -4.51 -2.76 0.34 0.15 0.37 0.0
0.51 0.79 0.57 0.65 0.28 0.05 -0.05 0.08 -0.42 -0.2 -0.02 -0.01 0.76 0.08 -0.32 -0.1 -0.25 -0.02 -0.08 -0.16 -4.6 -1.03 -0.67 -0.96 0.04 0.1
0.86 0.6 -0.35 -0.8 -0.46 0.1 0.24 0.34 0.31 0.33 0.25 -0.25 0.39 -0.47 -0.08 -0.79 0.13 0.18 0.4 0.42 -2.63 -0.89 -0.21 -0.25 -0.03 -0.46
0.74 0.55 -0.25 -0.81 -0.78 -0.52 0.32 0.45 0.31 0.27 0.08 -0.06 0.44 -0.65 -0.51 -0.89 0.11 0.33 0.03 0.19 -1.88 -0.51 0.34 0.17 0.31 -0.4
0.83 0.49 -0.0 -0.46 -0.61 0.01 0.41 0.57 0.33 0.12 -0.0 -0.15 0.33 -0.41 -0.49 -0.59 -0.22 0.16 0.04 0.15 -1.32 -0.89 -0.14 -0.38 0.31 0.04
0.46 -0.09 -0.23 -0.26 -0.14 -0.09 0.27 0.24 0.56 0.55 0.51 0.22 0.03 -0.77 -0.33 -0.54 -0.03 0.51 0.61 0.59 -1.82 -0.87 -0.33 -0.25 -0.79 -0.61
1.01 0.38 -0.26 -0.57 -0.56 -0.35 0.27 0.26 -0.08 0.07 -0.14 -0.14 0.96 -0.31 -0.16 -0.39 0.2 0.86 0.29 0.2 -2.17 -0.42 -1.07 -0.73 -0.11 -0.35
0.86 -0.07 -0.42 0.48 -0.17 -0.07 -1.1 -0.22 -0.14 0.89 0.23 0.83 0.66 -0.83 -1.65 -1.23 -0.8 -0.69 -1.0 -0.09 -3.51 -0.28 -0.08 0.0 0.72 1.13
0.7 0.64 0.09 -0.5 -0.98 -0.94 -0.31 0.16 0.05 0.23 0.11 0.13 0.43 -0.78 -1.06 -0.36 -0.34 0.27 0.02 -0.03 -1.58 0.57 -0.68 0.7 0.74 -0.33
0.49 0.71 0.39 0.33 -0.04 -0.03 0.41 0.56 0.44 0.24 0.13 -0.04 0.43 -0.4 -0.79 -0.57 -0.02 0.27 0.37 0.39 -3.96 -0.97 -2.36 -0.9 -0.45 -0.27
1.14 -0.09 0.07 0.32 0.05 -0.22 0.19 0.58 0.2 0.38 0.36 0.52 1.08 -1.21 -1.37 -0.87 -0.41 -0.26 -0.37 0.15 -2.84 -1.99 -0.53 -0.8 0.18 0.16
0.18 0.41 0.78 0.11 -1.14 -1.61 -0.49 0.23 0.29 0.49 0.42 0.66 0.04 0.09 -0.91 -1.27 -0.35 0.23 0.15 0.25 -1.21 -1.15 0.32 0.18 0.05 -0.1
1.46 0.88 0.63 0.29 -0.42 -0.24 0.01 0.48 -0.05 -0.11 -0.01 -0.06 1.24 -0.62 -0.49 -0.67 -0.62 -0.09 -0.15 0.04 -7.72 -2.84 -1.62 -1.16 0.16 -0.16
0.7 0.16 -0.21 -0.03 -0.11 -0.36 0.19 0.46 0.38 0.33 0.58 0.68 0.75 -2.09 -2.64 -1.18 -1.3 0.24 -0.54 -0.23 -2.86 -0.27 -0.26 0.22 0.9 0.07
0.72 0.37 -0.26 -0.08 -0.29 -0.38 0.37 0.57 0.5 0.48 0.53 0.17 0.17 -0.5 -0.66 -1.31 -0.28 0.14 0.03 0.04 -2.56 -0.23 -1.31 -0.27 0.44 0.13
0.32 0.13 0.4 0.55 0.55 0.15 0.28 0.44 0.09 0.06 0.38 0.52 0.06 -1.17 -0.95 -0.89 -0.44 -0.12 -0.56 -0.26 -2.41 -1.23 0.15 0.4 0.11 0.08
0.8 0.33 -0.32 -0.48 -0.81 -0.75 -0.34 0.18 0.17 0.26 0.38 0.36 0.43 -1.92 -0.37 -1.79 -0.22 -0.01 0.1 -0.11 -4.14 0.98 -0.48 0.21 0.71 0.5
1.18 0.29 -0.01 0.15 0.18 0.14 -0.05 0.23 0.09 0.08 0.37 0.76 1.2 0.04 -1.46 -0.13 -1.23 -0.32 -0.45 -0.56 -2.95 -1.62 0.25 -0.59 -0.47 -0.61
1.03 1.72 0.58 -0.64 -0.98 -0.49 -0.07 0.14 0.42 0.3 0.42 0.4 0.45 -1.33 -1.05 -2.3 -0.29 -0.25 -0.3 0.03 -2.84 -1.42 0.01 -0.06 0.08 -0.86
0.84 0.15 -0.25 -0.01 -0.26 -0.69 -0.12 0.13 -0.19 0.19 0.29 0.18 0.57 -0.38 -0.19 -0.71 -0.12 -0.03 -0.06 -0.17 -2.76 -0.17 -0.4 0.54 0.67 0.13
1.15 0.68 0.65 0.61 0.16 -0.29 -0.48 -0.07 0.08 0.38 0.88 0.94 1.18 -3.72 -1.95 -2.37 -0.82 -0.32 -0.41 -0.19 -4.46 -0.63 -1.09 -1.26 0.11 -0.11
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0.72 0.91 0.37 0.4 0.02 -0.24 0.28 0.56 0.33 0.04 0.09 0.02 0.66 -0.83 -0.86 -0.7 -0.51 0.14 0.08 -0.28 -4.73 -0.47 -1.09 -0.67 0.43 -0.45
0.77 0.85 0.33 0.25 -0.06 -0.21 -0.05 0.25 0.2 0.34 0.42 0.62 0.54 -1.11 -0.79 -1.43 -0.13 -0.07 -0.34 -0.22 -3.41 -0.52 -0.83 -0.22 0.47 -0.3
1.32 0.27 -0.3 -1.05 -0.41 -1.13 0.49 0.69 0.26 0.25 0.32 0.12 1.15 -1.06 -0.82 -1.97 -0.96 0.66 0.15 -0.75 -5.43 -0.78 -2.4 -1.78 1.51 -0.33
0.91 1.19 0.72 0.13 -0.66 -0.91 -0.78 -0.25 0.12 0.07 0.36 0.66 0.9 -0.24 -0.13 0.14 -0.22 -0.2 0.13 -0.2 -2.33 -0.92 -0.86 0.05 -1.42 -1.39

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.