Heatmap: Cluster_14 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.05 0.7 0.81 0.92 0.77 0.61 0.16 0.24 0.18 -0.45 -0.25 -0.69 -0.44 -0.67 -0.98 -1.3 -1.19 -0.17 0.17 0.22 -0.03 -1.27 -1.55 -0.72 0.11 0.61
0.28 0.36 0.41 0.21 0.01 -0.12 -0.22 0.03 -0.06 -0.24 -0.02 -0.05 -0.05 -0.36 -0.4 -0.17 -0.22 -0.08 -0.18 0.3 -0.62 0.31 -0.63 0.04 0.32 0.4
0.31 0.3 0.4 0.32 0.09 0.04 -0.0 0.21 0.24 -0.13 -0.06 0.03 0.13 -0.38 -0.49 -0.06 -0.36 -0.07 -0.21 0.21 -1.42 0.4 -0.79 -0.15 0.06 0.18
-0.47 0.09 0.72 0.88 0.47 0.07 -0.16 -0.1 -1.2 -0.99 -0.72 -0.25 0.57 -1.89 -1.57 -1.55 0.12 -0.39 -0.69 -0.6 -0.53 -0.02 1.13 -0.18 0.83 0.99
0.16 0.32 0.21 0.09 -0.04 -0.17 -0.23 -0.15 -0.07 -0.57 -0.38 -0.24 -0.11 -0.73 -0.48 -0.22 -0.3 -0.18 -0.02 -0.11 -1.58 0.91 0.27 0.66 0.49 0.52
0.46 0.22 0.34 0.56 0.28 -0.21 -0.19 0.28 0.03 -0.55 -0.26 -0.36 0.14 -0.79 -0.92 -0.69 -0.78 -0.34 -0.79 -0.21 -0.26 0.56 -0.14 -0.28 0.94 0.7
0.47 0.46 0.58 0.67 0.4 0.09 0.09 0.44 0.14 -0.36 -0.2 -0.16 0.39 -0.96 -0.82 -1.03 -0.86 -0.5 -0.95 -0.37 -0.77 0.6 -0.6 -0.8 0.61 0.49
0.91 0.81 1.28 1.4 0.27 -1.25 -1.21 -0.33 -2.2 -2.56 -1.96 -1.55 0.45 0.32 0.19 0.02 -1.24 -0.4 -0.62 -0.96 -1.23 0.48 -2.19 -0.86 0.65 1.12
0.52 0.55 0.57 0.61 0.23 -0.19 0.07 0.44 0.18 -0.39 -0.32 -0.16 0.3 -0.92 -0.89 -0.66 -0.67 -0.1 -0.59 -0.05 -1.35 0.56 -1.11 -0.27 0.61 0.33
0.44 0.64 0.67 0.71 0.45 -0.01 -0.02 0.37 0.23 -0.48 -0.29 -0.07 0.38 -1.22 -1.14 -0.85 -0.74 -0.37 -0.7 -0.12 -1.34 0.48 -0.91 -0.34 0.61 0.34
-0.21 0.2 0.45 0.57 0.51 0.36 0.14 -0.19 -0.28 -0.31 -0.28 -0.07 -0.22 -0.82 -1.28 -0.29 -0.42 -0.42 -0.52 -0.2 -0.85 -0.21 0.33 0.64 0.78 0.45
0.3 0.72 1.61 1.77 0.77 -1.23 -1.11 -0.52 -3.76 -2.67 -1.89 -1.09 0.48 -1.75 -2.77 -0.84 -2.46 -2.35 -2.6 -0.51 -0.02 1.04 -1.27 -1.01 1.08 1.42
0.26 0.75 1.36 1.91 0.61 -1.09 -1.0 -0.48 -3.26 -2.47 -1.72 -0.85 0.52 -1.98 -3.06 0.04 -2.51 -2.41 -2.62 -0.53 -0.11 0.82 -1.21 -1.02 0.97 1.5
1.15 0.58 0.83 0.76 -0.22 -0.76 -0.17 0.48 -0.56 -0.6 -0.42 -0.22 1.09 -1.06 -1.08 -1.21 -1.19 -1.1 -1.12 -0.51 0.29 -1.09 -0.37 -0.4 0.57 0.9
1.04 1.25 0.66 0.68 0.18 -0.62 -0.58 -0.49 -1.31 -1.67 -1.52 -1.44 0.74 -0.2 -2.05 0.22 -2.41 -0.38 -0.44 -1.53 1.19 -0.81 -0.81 -0.64 1.01 0.78
1.33 1.19 0.66 1.29 0.57 -0.45 -1.37 -0.43 -1.72 -1.18 -1.23 -1.17 0.84 -0.99 -2.28 0.41 -2.68 -0.59 -0.77 -1.22 1.06 -2.04 -0.29 -1.23 0.68 0.48
0.48 0.27 0.31 0.53 0.42 -0.44 -0.03 0.04 -1.07 -0.85 -0.27 0.16 1.14 -1.82 -2.19 -1.51 -1.62 -1.6 -1.92 -1.45 1.43 -0.59 1.54 -0.22 0.43 -0.22
0.79 -0.05 -0.82 -0.99 -1.83 -2.09 -0.99 -0.47 -1.06 -0.44 -0.48 -0.01 0.71 0.43 -0.55 0.31 -0.46 0.35 -0.64 -0.68 -0.78 0.51 0.62 0.51 1.19 1.11
-0.07 0.07 0.38 0.66 0.12 -0.67 -0.9 -0.46 -1.2 -1.65 -1.5 -1.5 -1.16 -0.82 -0.52 0.43 -1.02 -0.75 -0.68 -0.78 0.46 1.13 0.9 0.29 1.37 1.06
0.11 0.5 0.71 0.84 0.45 -0.05 0.16 0.36 -1.81 -0.87 -0.87 -0.72 0.82 -1.95 -2.82 -2.71 -2.17 -2.31 -2.31 -0.37 1.41 -3.16 1.39 0.45 0.21 0.79
0.81 0.51 0.69 0.44 -0.57 -0.94 -0.65 -0.02 -0.58 -0.94 -0.5 -0.08 0.26 -1.0 -0.76 -0.37 -0.7 -0.72 -0.67 -0.37 -0.86 0.97 0.58 0.2 0.85 0.63
-0.28 0.76 0.64 0.64 0.19 -0.36 0.11 0.31 -0.39 0.08 0.17 0.11 -0.02 -1.19 -1.77 -1.12 0.03 -0.31 -0.87 -0.61 0.49 -0.96 0.49 0.14 0.41 0.21
-0.1 0.53 0.54 0.38 0.29 0.07 -0.25 -0.17 0.02 -0.12 -0.39 -0.38 -0.23 -0.37 -0.26 -0.14 -0.05 0.06 0.15 0.37 -0.21 0.43 -0.56 -0.93 0.23 0.04
0.34 0.42 0.7 0.9 0.34 -0.31 0.43 0.65 -1.24 -0.74 -0.58 -0.34 0.5 -1.42 -1.66 -1.16 -1.46 -1.16 -1.09 -0.12 -0.24 0.86 -1.34 -0.1 0.66 1.08
0.18 0.16 0.32 0.24 -0.04 -0.21 -0.44 -0.11 -0.46 -0.64 -0.49 -0.09 0.05 -0.89 -0.48 -0.08 -0.05 -0.07 -0.37 -0.55 0.54 0.78 -0.25 0.59 0.4 0.43
0.97 0.5 0.71 0.89 0.44 -0.17 0.15 0.43 -1.76 -1.4 -1.2 -0.8 1.07 -0.02 -0.73 -0.03 -0.92 -0.51 -0.98 -0.42 -0.22 -1.25 -0.84 -1.38 0.82 0.69
0.48 0.64 0.58 0.65 0.4 0.02 0.04 0.37 0.2 -0.42 -0.34 -0.22 0.32 -0.78 -0.77 -0.81 -0.63 -0.24 -0.51 -0.01 -0.43 0.28 -1.23 -0.67 0.41 0.36
0.61 -0.18 0.11 0.19 -0.06 -0.41 -0.04 0.07 -0.15 -0.04 -0.05 0.2 0.52 -0.21 -0.38 -0.34 -0.17 0.11 -0.64 -0.05 -0.18 -0.46 -0.39 -0.27 0.55 0.63
1.11 0.51 0.55 0.67 -0.01 -0.74 -0.2 0.16 -0.33 0.12 0.34 0.57 0.85 -1.1 -1.45 -0.78 -1.03 -0.81 -0.82 -0.91 0.25 -3.04 -1.55 -0.59 0.63 0.94
0.15 0.47 0.48 0.27 0.04 -0.12 0.0 0.1 0.09 -0.3 -0.48 -0.54 -0.11 -0.29 -0.13 -0.14 -0.01 -0.06 -0.09 0.46 -0.47 0.53 -1.04 -0.51 0.3 0.25
0.38 0.03 0.32 0.25 -0.52 -0.77 -0.95 -0.45 -0.98 -1.16 -0.61 -0.08 0.25 -1.1 -1.43 0.04 -1.31 -1.56 -1.63 -0.9 0.55 0.93 1.26 0.73 0.82 1.21
0.92 0.6 0.63 0.44 -0.57 -1.18 0.0 0.44 -0.72 -0.59 -0.48 -0.4 0.77 0.09 -1.6 -0.24 -0.65 -0.1 -1.03 -0.4 0.11 -0.67 -0.57 -0.47 0.87 0.85
0.96 0.69 0.73 0.44 -0.52 -1.04 0.01 0.36 -0.62 -0.65 -0.58 -0.41 0.77 -0.01 -1.5 -0.33 -0.73 -0.34 -0.83 -0.42 0.01 -0.94 -0.7 -0.52 0.85 1.03
1.0 0.8 0.71 0.49 -0.45 -0.59 0.01 0.37 -0.55 -0.63 -0.62 -0.46 0.75 -0.1 -1.52 -0.51 -0.9 -0.35 -0.71 -0.37 -0.1 -0.83 -0.67 -0.69 0.83 0.96
0.44 0.54 0.36 0.47 0.28 0.09 -0.0 0.29 0.22 -0.38 -0.19 -0.2 0.33 -0.83 -0.71 -0.65 -0.72 -0.36 -0.39 -0.18 -0.69 0.46 -0.05 -0.4 0.34 0.35
0.42 0.46 0.49 0.44 0.25 -0.04 -0.22 0.1 0.14 -0.53 -0.35 -0.23 0.2 -0.48 -0.41 -0.2 -0.27 -0.02 -0.21 0.2 -0.8 0.48 -1.18 -0.49 0.34 0.37
0.54 0.34 0.44 0.6 0.12 -0.01 0.01 0.25 -0.11 -0.42 -0.36 -0.26 0.43 -0.73 -0.62 -0.69 -0.87 0.1 -0.44 -0.34 -0.16 0.23 -0.25 -0.15 0.28 0.53
0.3 0.54 0.53 0.37 0.22 0.08 -0.33 -0.21 -0.17 -0.48 -0.34 -0.09 0.31 0.07 -0.78 0.57 0.06 -0.77 -0.69 -0.05 -0.41 0.0 -0.65 -0.28 0.67 -0.02
0.04 0.25 0.44 0.4 0.4 -0.02 -0.39 -0.1 -0.13 -0.38 -0.32 -0.36 -0.05 -0.73 -0.38 -0.73 -0.31 -0.53 -0.36 0.06 -0.88 0.44 0.67 0.42 0.56 0.36
-0.36 0.23 0.55 0.63 0.24 0.08 -0.12 -0.08 -0.3 -0.5 -0.36 -0.35 -0.12 -0.76 -1.23 -0.39 -0.98 -0.51 -0.87 -0.9 -0.02 0.51 1.19 0.13 0.7 0.53
0.29 0.43 0.59 0.6 0.35 0.21 0.05 0.31 0.14 -0.36 -0.36 -0.34 0.07 -0.87 -0.68 -0.74 -0.65 -0.07 -0.46 -0.03 -0.72 0.48 -0.34 -0.48 0.53 0.24
0.22 0.39 0.25 0.36 0.23 0.05 0.02 0.2 0.21 -0.17 -0.14 -0.1 0.1 -0.47 -0.71 -0.01 -0.41 0.08 -0.2 -0.09 -0.53 0.22 -0.44 -0.07 0.26 0.03
0.98 0.77 0.43 -0.13 -0.02 -0.24 -0.32 0.03 -0.14 -0.06 0.39 0.28 0.4 -0.98 -1.16 -1.6 -0.16 -0.54 -0.5 0.28 -0.22 0.09 -0.25 0.57 -0.54 -0.08
0.88 0.68 0.14 0.01 -1.05 -1.88 -0.56 -0.49 -0.52 -0.13 0.15 0.55 0.89 -0.89 -0.63 -0.89 -0.3 -0.36 -0.74 -0.32 -0.42 -0.6 0.51 0.24 1.17 0.37
-1.93 -0.07 0.49 0.73 0.22 -0.29 -0.13 0.02 -0.51 -0.32 -0.25 -0.2 -2.11 -0.78 -0.54 -0.7 -0.86 -0.1 -0.23 -0.47 -0.39 0.94 1.02 0.25 0.63 0.97
0.46 -0.05 0.43 0.49 0.02 -0.12 0.1 0.42 -0.06 -0.33 -0.15 -0.07 0.42 -0.49 -0.69 -0.3 -0.92 -0.73 -0.85 -0.31 0.45 -1.47 0.4 0.49 0.01 0.61
0.46 0.23 0.28 0.29 0.26 0.23 0.19 0.08 0.11 -0.35 -0.14 0.07 0.12 0.16 -0.46 0.34 -0.33 -0.31 -0.14 -0.24 -3.16 0.37 0.09 -0.82 0.07 -0.05
0.26 0.09 0.43 0.6 0.29 -0.1 -0.15 0.05 -0.14 -0.52 -0.4 -0.2 0.23 -0.65 -1.15 -0.25 -1.1 -0.87 -1.07 -0.29 0.49 0.82 0.18 0.1 0.41 0.51
0.59 0.68 1.34 1.59 1.02 -0.26 -1.28 -0.88 -1.84 -1.55 -1.32 -1.19 0.31 -1.16 -1.4 -1.26 -1.5 -1.09 -1.4 -0.55 0.02 0.73 -0.07 -0.08 0.58 0.71
0.28 0.35 0.44 0.34 0.1 -0.0 -0.16 0.06 -0.05 -0.61 -0.48 -0.32 -0.04 -0.7 -0.58 -0.44 -0.59 -0.46 -0.67 -0.01 -0.41 0.73 0.52 0.12 0.56 0.4
-0.33 -0.31 -0.32 0.24 0.14 0.07 0.33 0.28 -0.9 -0.4 -0.11 -0.29 0.52 -0.58 -0.96 -1.37 -1.32 -1.28 -1.53 -0.92 1.0 0.5 1.25 0.19 0.63 0.67
-0.09 0.27 0.64 0.43 -0.43 -0.66 -0.68 -0.22 -0.27 -0.35 -0.1 0.06 -0.26 -0.67 -0.23 -0.57 -0.38 -0.25 -0.26 -0.35 -0.15 0.16 0.63 0.44 1.06 0.36
0.39 0.43 0.45 0.5 0.46 0.25 0.11 0.29 0.22 -0.25 -0.2 -0.39 0.06 -0.77 -0.57 -0.58 -0.64 -0.33 -0.36 -0.07 -0.76 0.05 -0.25 -0.7 0.66 0.31
0.59 0.4 0.51 0.49 0.27 0.06 -0.05 0.24 0.05 -0.3 -0.14 -0.04 0.32 -0.91 -0.25 -0.68 -0.49 -0.62 -0.41 0.07 -0.63 -0.34 0.11 0.16 0.17 0.07
-0.36 0.5 0.98 1.14 0.51 0.12 0.29 0.43 -0.62 -0.48 -0.43 -0.43 -0.5 -1.66 -1.85 -1.69 -1.28 -0.69 -0.73 -0.3 -0.03 0.48 -0.29 -0.42 0.54 1.16
1.78 1.14 1.08 1.18 0.6 -0.41 -0.78 -0.36 -3.29 -2.32 -1.25 -0.13 1.78 -3.98 -3.13 -3.66 -3.98 -3.01 -2.78 -1.02 0.65 0.53 -2.96 -0.7 0.2 0.41
0.75 0.13 -0.03 -0.27 -1.67 -2.51 -1.32 -0.52 -0.54 -0.2 0.05 0.31 0.57 -0.54 -0.5 -0.37 -0.35 -0.37 -0.7 -0.6 -0.17 0.7 0.59 0.58 1.25 0.68
0.89 0.55 0.49 0.58 0.31 0.44 0.16 0.38 -0.49 -0.76 -0.51 -0.18 0.79 -0.47 -0.95 -0.25 -1.29 -0.49 -0.54 -0.51 -1.46 0.31 0.14 -1.85 0.24 0.48
0.94 0.63 0.61 0.62 0.36 0.54 0.29 0.45 -0.79 -0.91 -0.45 -0.27 0.88 -0.81 -1.0 -0.19 -1.39 -0.77 -0.57 -0.71 -1.68 0.1 0.14 -1.32 0.11 0.55
0.83 0.4 0.82 0.82 -0.88 -1.33 -0.7 0.49 -1.67 -1.78 -1.32 -0.81 0.3 -1.18 -1.73 -1.35 -1.66 -0.16 -1.02 -0.29 0.45 0.76 -1.57 -0.74 1.72 1.41
0.18 0.26 0.35 0.32 0.28 0.27 -0.18 -0.11 -0.05 -0.24 -0.25 -0.01 0.03 -0.5 -0.14 -0.26 -0.12 -0.36 -0.06 0.3 -0.96 0.19 -0.08 -0.07 0.13 0.34
0.36 0.56 0.55 0.64 0.58 0.09 -0.28 0.07 0.12 -0.52 -0.28 -0.18 0.39 -0.81 -0.68 -0.63 -0.82 -0.83 -0.54 -0.21 0.08 0.22 0.06 -0.2 0.26 0.18
0.73 0.49 0.5 0.52 0.19 -0.17 -0.26 0.08 -0.13 -0.67 -0.38 -0.0 0.53 -1.08 -0.86 -0.84 -1.0 -0.37 -0.76 -0.19 -0.21 0.53 -0.07 -0.13 0.4 0.67
-0.55 0.16 0.7 0.62 0.23 -0.12 -0.82 -0.42 -0.69 -1.51 -1.41 -1.9 -2.06 -2.36 -2.34 -2.36 -2.3 -1.93 -1.74 -1.5 1.2 1.24 0.74 0.14 1.48 1.95
0.35 0.71 0.69 0.26 -0.3 -0.62 -1.45 -0.86 -0.49 -0.36 -0.02 0.25 -0.1 -0.51 -0.17 -0.18 -0.13 -1.0 -0.19 0.2 -0.55 1.02 -0.01 0.55 0.08 0.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.