Heatmap: Cluster_131 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.74 0.5 0.45 0.63 0.55 0.44 0.72 0.8 0.81 0.81 0.89 0.78 0.63 0.45 0.37 0.39 0.3 0.37 0.4 0.41 0.27 0.49 1.0 0.65 0.61 0.49
1.0 0.61 0.36 0.5 0.58 0.73 0.93 0.65 0.6 0.4 0.68 0.86 0.86 0.21 0.36 0.26 0.41 0.59 0.68 0.42 0.64 0.51 0.77 0.04 0.63 0.44
0.55 0.5 0.41 0.45 0.43 0.54 0.51 0.5 0.55 0.66 0.63 0.79 0.59 0.43 0.27 0.27 0.23 0.49 0.36 0.16 0.59 0.24 1.0 0.53 0.39 0.58
0.22 0.49 0.48 0.53 0.61 0.52 0.53 0.59 0.49 0.4 0.43 0.43 0.24 0.36 0.46 0.47 0.38 0.57 0.5 0.35 0.54 0.41 1.0 0.4 0.65 0.44
0.6 0.63 0.51 0.8 0.87 0.74 0.64 0.89 0.35 0.31 0.69 0.44 0.51 0.43 0.18 0.31 0.15 0.42 0.35 0.12 0.71 0.22 1.0 0.76 0.81 0.91
0.54 0.59 0.6 0.72 0.62 0.59 0.49 0.53 0.49 0.43 0.46 0.45 0.43 0.27 0.51 0.44 0.3 0.48 0.41 0.29 0.51 0.71 1.0 0.5 0.43 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.64 0.47 0.0 0.0
0.53 0.53 0.64 0.85 0.69 0.63 0.95 0.91 0.69 0.69 0.78 0.78 0.9 0.24 0.18 0.38 0.1 0.28 0.22 0.15 0.55 1.0 0.78 0.52 0.78 0.7
0.79 0.71 0.63 0.71 0.71 0.82 0.75 0.77 0.85 0.82 0.87 0.91 0.74 0.68 0.55 0.53 0.59 0.68 0.67 0.51 1.0 0.48 0.78 0.82 0.49 0.59
0.21 0.16 0.09 0.25 0.34 0.34 0.47 0.49 0.7 0.76 0.9 0.59 0.24 0.18 0.2 0.22 0.12 0.33 0.3 0.16 0.92 0.34 0.98 1.0 0.41 0.25
0.34 0.08 0.05 0.05 0.14 0.53 0.78 0.78 1.0 0.86 0.69 0.61 0.34 0.1 0.11 0.17 0.14 0.32 0.18 0.09 0.8 0.09 0.91 0.32 0.69 0.26
0.61 0.5 0.53 0.63 0.72 0.73 0.52 0.59 0.69 0.72 0.9 1.0 0.7 0.27 0.39 0.25 0.35 0.36 0.48 0.47 0.55 0.69 0.55 0.72 0.67 0.37
0.74 0.52 0.57 0.63 0.48 0.37 0.44 0.53 0.4 0.48 0.55 0.69 1.0 0.18 0.13 0.17 0.23 0.25 0.22 0.38 0.5 0.27 0.42 0.35 0.3 0.43
0.66 0.51 0.47 0.68 0.74 0.82 1.0 0.93 0.9 0.69 0.71 0.67 0.6 0.46 0.5 0.44 0.42 0.63 0.63 0.46 0.65 0.49 0.52 0.53 0.69 0.43
0.64 0.58 0.64 0.66 0.6 0.59 0.54 0.58 0.54 0.5 0.52 0.55 0.78 0.33 0.43 0.35 0.32 0.5 0.4 0.36 0.48 0.58 1.0 0.47 0.41 0.43
0.32 0.3 0.29 0.55 0.68 0.42 0.43 0.39 0.42 0.49 0.64 0.5 0.26 0.18 0.17 0.21 0.21 0.27 0.19 0.2 0.4 0.38 1.0 0.7 0.87 0.47
1.0 0.45 0.07 0.12 0.33 0.58 0.76 0.72 0.65 0.6 0.43 0.3 0.82 0.1 0.12 0.04 0.43 0.49 0.56 0.36 0.46 0.15 0.11 0.19 0.23 0.18
1.0 0.3 0.19 0.19 0.11 0.17 0.26 0.59 0.46 0.34 0.55 0.5 0.7 0.09 0.19 0.11 0.12 0.33 0.25 0.15 0.81 0.31 0.51 0.31 0.45 0.38
0.79 0.5 0.51 0.78 0.62 0.47 0.45 0.53 0.36 0.48 0.57 0.7 1.0 0.16 0.13 0.19 0.24 0.22 0.18 0.19 0.42 0.62 0.99 0.35 0.68 0.62
0.65 0.43 0.26 0.63 0.61 0.38 0.59 0.73 0.73 0.8 0.82 0.64 0.64 0.31 0.25 0.46 0.25 0.57 0.4 0.38 0.71 0.19 1.0 0.43 0.82 0.56
0.44 0.51 0.24 0.33 0.48 0.51 0.7 0.69 1.0 0.75 0.82 0.57 0.41 0.22 0.27 0.2 0.3 0.8 0.33 0.35 0.77 0.05 0.61 0.34 0.86 0.43
0.78 0.75 0.72 0.7 0.76 0.89 0.74 0.74 0.83 0.83 0.85 0.82 0.77 0.68 0.61 0.51 0.51 0.48 0.54 0.42 1.0 0.48 0.59 0.62 0.44 0.54
0.78 0.83 0.79 0.68 0.78 0.76 0.79 0.84 0.87 0.98 0.96 1.0 0.72 0.48 0.48 0.56 0.58 0.84 0.72 0.63 0.91 0.67 0.73 0.54 0.58 0.56
0.69 0.73 0.66 0.65 0.79 0.79 0.92 0.84 0.92 1.0 0.93 0.78 0.69 0.53 0.72 0.67 0.56 0.99 0.73 0.7 0.75 0.77 0.87 0.81 1.0 0.73
0.39 0.62 0.79 0.76 0.63 0.47 0.6 0.58 0.55 0.52 0.47 0.45 0.42 0.54 0.6 0.62 0.44 0.57 0.42 0.4 1.0 0.39 0.5 0.31 0.35 0.34
0.39 0.57 0.71 0.69 0.63 0.66 0.53 0.52 0.55 0.46 0.46 0.44 0.41 0.41 0.51 0.47 0.31 0.41 0.39 0.31 1.0 0.35 0.45 0.27 0.34 0.35
0.06 0.09 0.16 0.36 0.14 0.05 0.07 0.02 0.13 0.32 1.0 0.93 0.11 0.04 0.0 0.06 0.27 0.0 0.01 0.01 0.85 0.02 0.57 0.08 0.23 0.18
0.89 0.59 0.58 0.68 0.43 0.27 0.62 0.79 0.64 0.67 1.0 0.58 0.92 0.14 0.15 0.1 0.11 0.49 0.32 0.2 0.28 0.25 0.22 0.49 0.71 0.47
0.26 0.39 0.24 0.39 0.29 0.36 0.26 0.33 0.24 0.25 0.21 0.21 0.18 0.48 0.43 0.58 0.29 0.53 0.59 0.13 0.58 0.16 1.0 0.24 0.72 0.32
0.83 0.7 0.53 0.54 0.49 0.4 0.69 0.71 0.77 0.87 0.93 1.0 0.77 0.32 0.43 0.34 0.49 0.73 0.67 0.41 0.65 0.25 0.44 0.64 0.91 0.57
1.0 0.57 0.44 0.35 0.33 0.31 0.58 0.68 0.57 0.63 0.6 0.65 0.92 0.31 0.36 0.3 0.47 0.67 0.51 0.48 0.53 0.32 0.42 0.43 0.55 0.44
0.51 0.24 0.27 0.45 0.62 0.53 0.5 0.42 0.28 0.31 0.32 0.27 0.51 0.22 0.2 0.22 0.31 0.27 0.23 0.24 0.23 0.39 1.0 0.21 0.47 0.33
1.0 0.84 0.55 0.66 0.73 0.64 0.8 0.84 0.77 0.94 0.96 0.86 0.86 0.34 0.36 0.5 0.37 0.57 0.43 0.28 0.47 0.62 0.46 0.48 0.68 0.59
0.62 0.43 0.32 0.42 0.34 0.22 0.35 0.36 0.51 0.58 0.8 1.0 0.76 0.23 0.16 0.31 0.14 0.16 0.17 0.16 0.91 0.23 0.13 0.67 0.26 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0
0.68 0.49 0.4 0.65 0.64 0.53 0.54 0.57 0.46 0.45 0.56 0.56 0.69 0.33 0.18 0.3 0.18 0.26 0.26 0.25 0.38 0.66 1.0 0.7 0.79 0.59
0.13 0.06 0.09 0.23 0.25 0.16 0.26 0.29 0.41 0.41 0.6 0.44 0.12 0.12 0.14 0.11 0.1 0.2 0.15 0.14 1.0 0.32 0.78 0.49 0.35 0.27
0.53 0.49 0.43 0.58 0.68 0.59 0.71 0.65 0.65 0.66 0.65 0.64 0.42 0.34 0.37 0.37 0.34 0.55 0.43 0.34 0.29 0.74 1.0 0.31 0.64 0.38
0.24 0.36 0.43 0.6 0.61 0.48 0.49 0.68 0.62 0.5 0.55 0.42 0.22 0.33 0.26 0.6 0.19 0.53 0.43 0.29 0.43 0.73 1.0 0.54 0.6 0.4
0.77 0.63 0.63 0.76 0.69 0.53 0.58 0.68 0.6 0.63 0.7 0.71 0.93 0.4 0.36 0.43 0.38 0.41 0.4 0.45 0.6 0.63 1.0 0.54 0.5 0.64
0.19 0.14 0.15 0.15 0.1 0.07 0.11 0.14 0.21 0.4 0.67 1.0 0.25 0.11 0.08 0.15 0.15 0.13 0.1 0.1 0.68 0.28 0.39 0.63 0.21 0.26
0.73 0.49 0.36 0.85 0.53 0.42 0.54 0.68 0.46 0.57 0.58 0.5 0.64 0.21 0.16 0.17 0.15 0.32 0.28 0.19 0.5 0.29 1.0 0.5 0.61 0.47
0.67 0.37 0.34 0.63 0.54 0.13 0.23 0.43 0.62 0.66 0.76 0.39 0.87 0.22 0.13 0.18 0.1 0.37 0.17 0.13 1.0 0.63 0.27 0.34 0.81 0.34
0.37 0.12 0.16 0.25 0.32 0.34 0.32 0.3 0.46 0.66 0.85 0.73 0.47 0.19 0.09 0.62 0.1 0.04 0.03 0.1 1.0 0.18 0.98 0.31 0.08 0.23
0.33 0.31 0.27 0.47 0.48 0.46 0.52 0.58 0.5 0.51 0.67 0.52 0.35 0.37 0.21 0.33 0.21 0.3 0.25 0.17 0.34 0.28 1.0 0.68 0.71 0.49
0.29 0.22 0.37 0.54 0.48 0.8 0.8 0.53 0.92 0.93 1.0 0.73 0.4 0.45 0.27 0.19 0.19 0.28 0.34 0.18 0.42 0.54 0.55 0.26 0.36 0.41
0.95 0.43 0.35 0.43 0.39 0.37 0.55 0.62 0.68 0.94 1.0 0.82 0.79 0.27 0.24 0.15 0.25 0.27 0.29 0.39 0.97 0.31 0.4 0.23 0.5 0.46
0.31 0.38 0.25 0.42 0.4 0.28 0.31 0.42 0.44 0.65 0.88 0.7 0.42 0.13 0.33 0.48 0.12 0.57 0.29 0.19 1.0 0.09 0.73 0.15 0.09 0.14
0.4 0.32 0.34 0.34 0.39 0.46 0.55 0.64 0.74 0.9 1.0 0.87 0.56 0.25 0.14 0.25 0.36 0.26 0.16 0.17 0.7 0.04 0.78 0.64 0.51 0.42
0.15 0.08 0.08 0.16 0.22 0.22 0.48 0.48 0.82 0.75 1.0 0.54 0.26 0.19 0.12 0.17 0.06 0.12 0.05 0.12 0.88 0.25 0.91 0.73 0.62 0.4
0.78 0.54 0.62 0.69 0.62 0.58 0.83 0.96 0.89 1.0 0.94 0.95 0.97 0.41 0.63 0.32 0.18 0.43 0.4 0.29 0.85 0.84 0.81 0.78 0.78 0.55
0.56 0.38 0.19 0.41 0.59 0.99 0.44 0.46 0.38 0.51 0.35 0.31 0.74 0.13 0.04 0.1 0.03 0.04 0.06 0.04 0.16 0.08 0.44 0.15 1.0 0.45
0.7 0.27 0.35 0.46 0.73 0.94 0.72 0.7 0.46 0.49 0.51 0.4 0.59 0.18 0.04 0.07 0.04 0.05 0.06 0.04 0.41 0.25 1.0 0.33 0.92 0.54
0.81 0.56 0.45 0.9 0.87 0.65 0.9 0.99 0.91 0.88 1.0 0.75 0.73 0.4 0.26 0.35 0.22 0.42 0.33 0.19 0.65 0.96 0.51 0.68 0.56 0.52
0.72 0.4 0.41 0.52 0.59 0.52 1.0 0.9 0.8 0.64 0.81 0.67 0.77 0.51 0.53 0.58 0.4 0.44 0.41 0.36 0.19 0.58 0.92 0.59 0.78 0.52
0.09 0.12 0.18 0.5 0.44 0.23 0.45 0.48 0.44 0.62 0.76 0.54 0.09 0.23 0.14 0.09 0.24 0.21 0.21 0.13 0.44 0.17 1.0 0.43 0.8 0.52
0.17 0.06 0.14 0.18 0.38 0.48 0.44 0.37 0.67 0.75 0.81 1.0 0.33 0.14 0.18 0.12 0.21 0.29 0.31 0.22 0.43 0.06 0.9 0.55 0.37 0.21
0.49 0.56 0.48 0.61 0.49 0.35 0.34 0.37 0.26 0.25 0.27 0.29 0.46 0.22 0.35 0.35 0.22 0.49 0.37 0.23 0.53 0.42 1.0 0.28 0.46 0.33
0.16 0.16 0.32 0.53 0.6 0.63 0.78 0.68 0.97 0.95 1.0 0.86 0.3 0.34 0.23 0.28 0.19 0.12 0.13 0.09 0.52 0.5 0.77 0.36 0.34 0.32
0.91 0.61 0.69 0.64 0.56 0.66 0.82 0.92 0.72 0.68 0.71 0.94 1.0 0.36 0.36 0.4 0.46 0.73 0.49 0.6 0.67 0.47 0.4 0.37 0.33 0.46
0.36 0.33 0.27 0.5 0.53 0.35 0.43 0.47 0.55 0.6 0.58 0.55 0.53 0.36 0.46 0.36 0.26 0.38 0.31 0.21 0.44 0.1 1.0 0.49 0.44 0.61
0.56 0.52 0.55 0.6 0.69 0.67 0.89 0.82 0.73 0.64 0.68 0.71 0.61 0.45 0.33 0.42 0.33 0.43 0.43 0.33 0.46 0.54 1.0 0.45 0.62 0.44
0.41 0.17 0.24 0.33 0.54 0.39 0.35 0.46 0.44 0.38 0.63 0.31 0.33 0.09 0.04 0.1 0.05 0.16 0.14 0.05 1.0 0.37 0.97 0.43 0.65 0.32
0.68 0.31 0.2 0.18 0.22 0.32 0.8 0.8 1.0 0.93 0.86 0.57 0.67 0.47 0.31 0.4 0.43 0.49 0.45 0.44 0.74 0.26 0.97 0.49 0.57 0.46
0.3 0.39 0.48 0.52 0.41 0.38 0.54 0.66 0.8 0.8 1.0 0.95 0.43 0.34 0.37 0.26 0.65 0.74 0.41 0.32 0.72 0.41 0.99 0.5 0.59 0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)