Heatmap: Cluster_192 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00193310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.193)
0.73 1.0 0.59 0.21 0.91 0.12 0.1 0.08 0.08 0.08 0.38 0.45 0.39 0.24 0.36 0.4 0.34 0.29 0.34 0.38 0.09 0.43
AMTR_s00002p00130590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.91)
0.59 0.87 0.41 0.35 1.0 0.02 0.02 0.0 0.05 0.04 0.44 0.52 0.55 0.48 0.38 0.2 0.38 0.41 0.29 0.16 0.13 0.34
AMTR_s00003p00082280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.48)
0.51 0.96 0.59 0.32 1.0 0.13 0.07 0.12 0.05 0.05 0.32 0.37 0.39 0.33 0.46 0.46 0.4 0.21 0.27 0.33 0.1 0.4
AMTR_s00004p00110530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.90)
0.79 0.79 0.62 1.0 0.82 0.32 0.14 0.13 0.11 0.11 0.62 0.62 0.76 0.44 0.42 0.45 0.37 0.4 0.53 0.36 0.3 0.53
AMTR_s00004p00176820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.202)
0.68 0.82 0.57 0.84 0.86 0.13 0.43 0.04 0.33 0.31 0.95 0.91 0.69 0.68 0.46 0.5 1.0 0.61 0.59 0.53 0.43 0.56
AMTR_s00007p00012260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.1)
0.8 1.0 0.91 0.15 0.59 0.01 0.1 0.06 0.08 0.09 0.42 0.61 0.37 0.28 0.35 0.26 0.31 0.32 0.36 0.22 0.11 0.15
AMTR_s00007p00200160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.174)
0.69 1.0 0.97 0.31 0.82 0.42 0.07 0.11 0.06 0.07 0.35 0.39 0.31 0.16 0.24 0.29 0.46 0.25 0.24 0.16 0.12 0.34
AMTR_s00009p00043530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.8)
0.6 0.5 1.0 0.66 0.86 0.01 0.09 0.29 0.12 0.12 0.41 0.34 0.53 0.26 0.4 0.19 0.32 0.3 0.21 0.33 0.25 0.37
AMTR_s00009p00250760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.256)
0.64 0.88 0.71 1.0 0.48 0.03 0.03 0.13 0.04 0.04 0.59 0.61 0.35 0.27 0.17 0.48 0.31 0.59 0.5 0.35 0.34 0.34
AMTR_s00009p00261990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.343)
0.0 0.56 0.0 0.67 0.69 0.0 0.03 0.0 0.08 0.07 0.97 0.55 0.64 0.47 0.31 0.65 1.0 0.63 0.39 0.34 0.22 0.42
AMTR_s00009p00262730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.350)
0.77 1.0 0.57 0.33 0.61 0.1 0.1 0.07 0.07 0.08 0.31 0.37 0.34 0.25 0.25 0.21 0.43 0.21 0.18 0.22 0.05 0.37
AMTR_s00012p00089320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.43)
0.71 0.78 1.0 0.36 0.89 0.05 0.04 0.07 0.06 0.06 0.31 0.28 0.38 0.42 0.42 0.3 0.28 0.25 0.22 0.27 0.14 0.38
AMTR_s00012p00103290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.56)
0.85 1.0 0.77 0.39 0.68 0.16 0.03 0.02 0.01 0.02 0.38 0.43 0.43 0.26 0.29 0.45 0.34 0.29 0.33 0.42 0.11 0.48
AMTR_s00013p00199160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.133)
0.5 1.0 0.98 0.07 0.2 0.05 0.09 0.0 0.07 0.07 0.19 0.23 0.17 0.05 0.07 0.07 0.41 0.13 0.16 0.02 0.02 0.07
AMTR_s00013p00229960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.180)
0.8 0.97 0.27 1.0 0.72 0.01 0.09 0.07 0.12 0.12 0.71 0.7 0.64 0.37 0.42 0.66 0.47 0.59 0.48 0.45 0.23 0.43
AMTR_s00016p00193880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.157)
0.52 0.66 1.0 0.41 0.92 0.18 0.11 0.22 0.1 0.1 0.27 0.32 0.32 0.34 0.4 0.19 0.2 0.31 0.3 0.32 0.15 0.35
AMTR_s00016p00257030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.347)
0.65 1.0 0.91 0.3 0.97 0.2 0.19 0.1 0.08 0.09 0.54 0.53 0.59 0.31 0.68 0.41 0.91 0.39 0.41 0.52 0.12 0.69
AMTR_s00019p00068190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.45)
1.0 0.78 0.77 0.63 0.69 0.22 0.2 0.31 0.17 0.18 0.34 0.28 0.36 0.24 0.38 0.28 0.26 0.45 0.44 0.41 0.2 0.37
AMTR_s00022p00076070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.57)
0.8 1.0 0.64 0.54 0.98 0.06 0.04 0.08 0.03 0.04 0.21 0.26 0.41 0.25 0.48 0.16 0.36 0.12 0.14 0.28 0.09 0.46
AMTR_s00023p00243120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.213)
0.61 0.85 0.56 0.81 1.0 0.21 0.08 0.18 0.08 0.1 0.4 0.42 0.51 0.32 0.42 0.44 0.3 0.38 0.43 0.41 0.17 0.44
AMTR_s00024p00200570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.176)
0.68 0.64 0.59 0.92 0.77 0.55 0.09 0.07 0.13 0.1 1.0 0.85 0.84 0.37 0.72 0.42 0.51 0.47 0.81 0.57 0.21 0.5
AMTR_s00025p00145840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.161)
0.13 0.49 0.45 1.0 0.24 0.0 0.12 0.13 0.12 0.1 0.56 0.56 0.41 0.33 0.26 0.26 0.44 0.39 0.47 0.26 0.18 0.42
AMTR_s00025p00182570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.221)
0.89 0.87 0.78 0.53 1.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.46 0.43 0.26 0.13 0.27 0.2 0.53 0.2 0.2 0.22 0.03 0.5
AMTR_s00027p00141660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00027.41)
1.0 0.84 0.98 0.13 0.64 0.01 0.04 0.03 0.05 0.05 0.61 0.82 0.23 0.16 0.15 0.62 0.3 0.61 0.53 0.11 0.21 0.2
AMTR_s00029p00153350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.181)
0.81 0.9 1.0 0.31 0.84 0.19 0.06 0.11 0.06 0.07 0.48 0.49 0.44 0.31 0.25 0.21 0.28 0.3 0.37 0.36 0.02 0.34
AMTR_s00030p00033750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.11)
0.43 0.7 0.51 0.46 1.0 0.02 0.12 0.05 0.09 0.13 0.31 0.37 0.55 0.43 0.37 0.21 0.22 0.21 0.23 0.2 0.04 0.58
AMTR_s00031p00169220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00031.77)
0.76 0.72 0.97 0.52 1.0 0.15 0.13 0.2 0.06 0.06 0.52 0.64 0.41 0.27 0.41 0.39 0.75 0.42 0.46 0.45 0.18 0.57
AMTR_s00037p00146990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.64)
0.67 1.0 0.8 0.41 0.63 0.15 0.05 0.07 0.06 0.06 0.25 0.24 0.34 0.33 0.26 0.13 0.15 0.19 0.2 0.22 0.11 0.24
AMTR_s00039p00232300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.221)
0.26 0.25 0.19 0.2 1.0 0.22 0.25 0.11 0.12 0.14 0.09 0.13 0.31 0.28 0.41 0.14 0.06 0.04 0.09 0.44 0.01 0.33
AMTR_s00040p00164470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.140)
1.0 0.74 0.65 0.22 0.64 0.01 0.03 0.04 0.02 0.02 0.28 0.36 0.15 0.06 0.16 0.19 0.44 0.18 0.17 0.13 0.02 0.26
AMTR_s00041p00154550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.107)
0.69 0.86 0.92 0.36 1.0 0.35 0.02 0.09 0.04 0.04 0.57 0.58 0.68 0.35 0.55 0.59 0.65 0.41 0.34 0.41 0.2 0.53
AMTR_s00045p00119230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.116)
0.81 1.0 0.4 0.66 0.71 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.57 0.55 0.42 0.17 0.12 0.25 0.3 0.29 0.31 0.15 0.1 0.28
AMTR_s00055p00220020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.168)
0.42 0.46 1.0 0.12 0.36 0.05 0.08 0.1 0.06 0.08 0.3 0.3 0.28 0.14 0.16 0.22 0.29 0.19 0.18 0.15 0.12 0.21
AMTR_s00066p00108790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.96)
0.21 0.61 1.0 0.01 0.26 0.02 0.16 0.0 0.15 0.14 0.2 0.11 0.13 0.13 0.07 0.06 0.19 0.13 0.17 0.07 0.1 0.16
AMTR_s00066p00158830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.166)
0.52 1.0 0.51 0.22 0.68 0.15 0.08 0.09 0.08 0.07 0.43 0.41 0.46 0.36 0.34 0.31 0.45 0.28 0.27 0.25 0.07 0.35
AMTR_s00069p00029190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.13)
0.63 1.0 0.84 0.42 0.91 0.1 0.02 0.0 0.01 0.01 0.26 0.21 0.28 0.15 0.33 0.21 0.36 0.14 0.16 0.27 0.07 0.32
AMTR_s00069p00073180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.45)
0.43 0.56 1.0 0.05 0.3 0.01 0.21 0.18 0.16 0.16 0.28 0.3 0.22 0.16 0.14 0.14 0.16 0.21 0.2 0.16 0.14 0.2
AMTR_s00069p00112860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.76)
0.6 1.0 0.65 0.23 0.8 0.31 0.06 0.18 0.05 0.05 0.47 0.47 0.35 0.19 0.22 0.23 0.36 0.26 0.28 0.38 0.11 0.34
AMTR_s00074p00155110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00074.69)
1.0 0.64 0.86 0.52 1.0 0.25 0.22 0.18 0.19 0.19 0.35 0.41 0.46 0.42 0.57 0.4 0.36 0.28 0.32 0.45 0.21 0.57
AMTR_s00085p00083580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00085.43)
0.75 1.0 0.43 0.44 0.79 0.25 0.08 0.13 0.07 0.06 0.52 0.48 0.48 0.28 0.39 0.5 0.53 0.35 0.36 0.41 0.18 0.68
AMTR_s00086p00091890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00086.45)
0.61 0.83 0.88 0.62 1.0 0.01 0.04 0.19 0.07 0.06 0.33 0.43 0.53 0.37 0.46 0.32 0.21 0.4 0.43 0.34 0.24 0.66
AMTR_s00086p00164400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00086.103)
0.67 1.0 0.74 0.3 0.82 0.22 0.14 0.05 0.09 0.1 0.52 0.52 0.42 0.35 0.34 0.34 0.51 0.28 0.37 0.5 0.25 0.39
AMTR_s00091p00120960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00091.44)
0.66 0.61 1.0 0.32 0.95 0.07 0.1 0.13 0.13 0.15 0.47 0.45 0.46 0.38 0.37 0.31 0.45 0.27 0.31 0.4 0.11 0.49
AMTR_s00092p00156160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.130)
0.52 1.0 0.69 0.43 0.89 0.24 0.03 0.08 0.03 0.05 0.17 0.19 0.3 0.25 0.28 0.09 0.18 0.09 0.14 0.24 0.05 0.44
AMTR_s00095p00113890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.70)
1.0 0.79 0.76 0.59 0.66 0.02 0.03 0.06 0.05 0.06 0.3 0.26 0.32 0.26 0.38 0.32 0.13 0.21 0.28 0.23 0.17 0.44
AMTR_s00101p00100170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00101.77)
0.73 0.95 0.8 0.61 1.0 0.17 0.07 0.12 0.05 0.06 0.25 0.31 0.45 0.24 0.41 0.41 0.21 0.2 0.18 0.28 0.06 0.36
AMTR_s00109p00098960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.87)
0.88 0.64 0.59 0.48 1.0 0.31 0.14 0.13 0.05 0.06 0.23 0.25 0.24 0.18 0.16 0.11 0.27 0.1 0.13 0.09 0.04 0.26
AMTR_s00111p00123040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00111.95)
0.26 0.66 1.0 0.16 0.59 0.02 0.04 0.02 0.07 0.06 0.19 0.22 0.28 0.19 0.15 0.3 0.21 0.1 0.14 0.15 0.12 0.27
AMTR_s00114p00112110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00114.47)
0.0 0.0 0.0 1.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.31 0.0 0.41 0.2 0.06 0.0 0.15 0.11 0.15 0.29 0.1 0.22
AMTR_s00119p00087830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.66)
0.32 0.83 1.0 0.03 0.26 0.01 0.05 0.13 0.06 0.06 0.31 0.2 0.18 0.11 0.07 0.09 0.27 0.15 0.13 0.07 0.05 0.13
AMTR_s00121p00130180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00121.38)
0.68 0.53 1.0 0.13 0.48 0.01 0.01 0.06 0.03 0.03 0.26 0.33 0.29 0.18 0.21 0.22 0.31 0.17 0.18 0.16 0.07 0.28
AMTR_s00124p00014420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00124.1)
0.7 0.83 1.0 0.54 0.39 0.07 0.04 0.01 0.04 0.04 0.3 0.31 0.3 0.2 0.21 0.29 0.26 0.17 0.25 0.22 0.12 0.25
AMTR_s00138p00051570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00138.21)
0.64 0.64 0.63 0.4 1.0 0.38 0.22 0.17 0.11 0.14 0.25 0.19 0.38 0.35 0.46 0.27 0.14 0.11 0.24 0.33 0.1 0.36
AMTR_s00163p00029820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00163.8)
0.37 1.0 0.58 0.28 0.93 0.05 0.07 0.06 0.07 0.08 0.48 0.48 0.43 0.21 0.34 0.43 0.25 0.48 0.46 0.28 0.11 0.37
AMTR_s00182p00033480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00182.13)
0.56 0.79 0.97 0.63 1.0 0.2 0.19 0.24 0.14 0.16 0.37 0.52 0.47 0.52 0.5 0.4 0.07 0.33 0.52 0.47 0.04 0.4
AMTR_s00197p00028970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00197.10)
0.75 0.62 0.63 0.62 1.0 0.12 0.04 0.14 0.08 0.08 0.37 0.49 0.47 0.45 0.24 0.17 0.25 0.16 0.18 0.19 0.07 0.5

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)